Ureaplasma diversum: JM47_01730
Help
Entry
JM47_01730 CDS
T09765
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
ude
Ureaplasma diversum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
ude00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
ude03032
]
JM47_01730
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
ude03400
]
JM47_01730
Enzymes [BR:
ude01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
JM47_01730
DNA replication proteins [BR:
ude03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
JM47_01730
DNA repair and recombination proteins [BR:
ude03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
JM47_01730
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJQ45676
UniProt:
A0A0C5RCP3
LinkDB
All DBs
Position
428670..431192
Genome browser
AA seq
840 aa
AA seq
DB search
MSTEEIQEQLSLSTINDHSITKEVETSFLDYAMSVIVSRALPDVRDGFKPVHRRALYAAY
ENGMTHDKPYKKSARWVGDVIGKYHPHGDQAVYQTIVRMAQDFSMRYQLVDGHGNFGSID
GDSAAAMRYTEARLSKISAELLKYIDKDTVEFVPNYDGSESEPSVLPSGFPNLLTNGTTG
IAVGMATNMPPHNLVEVCNAIKAYAHNHDITIDEIAEHISGPDFPTGAQIYGTAGIRKYF
ETGKGSVTIRSSHEFEEIGNNRVAIVFTEIPYMINKTTLIEKIVELVTNKQLDGISDLRD
ESSRDGIRIVVEIKRDFIPEVVLNKLFKMTSLQSNFSVNNLALVNGVPQVLNIKELIKYY
FEHQIDVLIKRTTFDLKKAKERIHIVEGLVIAVDNIDEVIKIIKTSKNDELATQTLMSRF
NLSEIQAKAILEMRLKALTGLNIEKLKQEHAELIKIVEDLEDILNSYERQTNIVCEYLDY
LIEKFGDERRTEILHGVSSSIDEEDLIPEEDIVITVSKRGYFKRLPIDTYRAQKRGGVGV
IGANTYEDDDIDQIIVANTHTDVLFFSDLGRVYRIRGHQIPIGSRTTKGTPAINFLPIQK
GELIQTILPINDYDEGSLLFTTVKGKVKRGRMDDYKLIYKGGKIAINLPEDDKVFSVMAT
NGNDEIFISSSSGHLVRFDETTIREMGRNSYGVNGIKLTDKEYVVGTGLASQGKYVLAVG
KKGIGKLSDCEDYRMTNRGTKGVITLKVNSKTGPLVGIKVVDLDDELLIITSSGKIIRTR
INEISITGRNTSGVKLVSLDDKEEIKSITIFKKDLNELEADTNEQNEQETEKPELEENNQ
NT seq
2523 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttaagtactgaagaaattcaagaacaattatcattatcaacaattaatgatcattcaatt
actaaagaagttgaaacatctttcttagattatgcaatgtcagttattgtctctcgtgct
ttacctgatgttcgtgatggatttaaaccagttcaccgtagagcattatatgctgcttat
gaaaatggaatgactcatgataaaccatataagaaatcagcaagatgagttggggatgtt
attggtaagtaccacccacatggtgatcaagctgtttatcaaacaattgtaagaatggca
caagatttctcaatgcgttatcaattagttgatgggcatgggaactttggatcaattgat
ggtgatagtgcagctgctatgcgttatactgaagctcgtttatctaaaatatcagctgaa
cttttaaaatacattgataaagatacagtagaatttgttcctaactatgatggttcagaa
agtgaacctagtgttttaccatctggtttccctaacttattaactaatgggacaacaggg
attgctgttgggatggctacaaatatgccaccacacaacttagttgaagtatgtaatgca
attaaagcttatgcacataatcacgatattacaattgatgaaatagctgaacatatttca
ggacctgatttcccaactggtgctcagatttatgggactgcaggaattagaaaatatttt
gaaactggtaagggttctgtaacaattcgatcaagtcatgaatttgaagaaattggaaac
aatcgggttgctattgttttcactgaaattccatacatgatcaacaaaacaacactaatt
gaaaaaattgttgaattagtaactaataaacaattagatggaataagtgacttaagagat
gaatctagccgggatggaattagaattgttgttgaaatcaaacgagattttattcctgaa
gtagttttaaataaactatttaagatgacatcattacaatcaaactttagtgttaataac
ttagctttagttaatggtgtaccacaagttttaaatatcaaagaattaattaaatattac
tttgaacaccaaattgatgtattaatcaaacgaacaacatttgatcttaaaaaagctaaa
gaaagaattcatattgttgaaggtttagttattgctgttgataacattgatgaagttatt
aagattattaagacttcaaaaaatgatgaactagcaacacaaactttaatgagtcgattc
aatttaagtgaaatccaagctaaagctattttagaaatgcgtcttaaagctttaactggt
ttaaatattgaaaaacttaaacaagaacatgctgaattaattaagattgttgaagatcta
gaagatatattaaatagttatgaaagacagactaatattgtttgtgaatacttagattat
ttaattgaaaaatttggggatgaaagaagaactgaaattttacatggagtaagttcaagt
attgatgaagaagatttaattcctgaagaagatattgtaattacagtttcaaaacgtggt
tactttaaacgattaccaattgatacatatcgtgcacaaaaaagaggtggagttggagtc
attggtgctaacacttatgaagatgatgatattgatcaaatcattgttgctaacacccat
actgatgttttattcttctctgatttaggtagagtatatcgaatcagaggacaccagatt
ccaattggttcaagaacaactaaaggaacaccagcaattaacttcttaccaattcaaaaa
ggtgaattaattcaaacaatcttaccaattaatgattatgatgaaggatcattattgttt
actacagttaaaggtaaagttaaacggggaagaatggatgattataaattaatctacaag
ggtggtaagattgcaattaatcttcctgaagatgataaagtcttctctgtaatggcaaca
aatggaaatgatgaaatcttcatttcttcaagttcaggacatttagttagatttgatgaa
acaacaattcgagaaatgggacggaactcttatggggttaatggtattaaattaactgat
aaagagtacgttgtaggaactggacttgctagtcaagggaaatatgttttagctgttggt
aaaaaaggaatcggtaaattatctgattgtgaagactacagaatgactaaccgtggtacc
aagggtgtaattacacttaaagttaattcaaaaacaggaccacttgttggaattaaagta
gttgatcttgatgatgaattattaattattacaagttcaggaaaaatcataagaacacga
attaatgaaatttctattacaggacgtaatacttctggagttaaattagtaagcttagat
gataaagaagaaattaaatcaattacgatctttaaaaaagatttaaatgaattagaagct
gatactaacgaacaaaacgaacaagaaacagaaaaaccagaactagaagaaaataaccaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
