KEGG   Ureaplasma diversum: JM47_02200
Entry
JM47_02200        CDS       T09765                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
  KO
K03763  DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:2.7.7.7]
Organism
ude  Ureaplasma diversum
Pathway
ude03030  DNA replication
ude03430  Mismatch repair
ude03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ude00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    JM47_02200
   03430 Mismatch repair
    JM47_02200
   03440 Homologous recombination
    JM47_02200
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:ude03032]
    JM47_02200
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ude03400]
    JM47_02200
Enzymes [BR:ude01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     JM47_02200
DNA replication proteins [BR:ude03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     JM47_02200
DNA repair and recombination proteins [BR:ude03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     JM47_02200
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha RNase_T DNA_pol3_finger PHP HHH_6 RNase_H_2 HHH_3 DUF1980_C Feld-I_B STIV_B116-like T2SSK RMI2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AJQ45387
UniProt: A0A0C5RLX0
LinkDB
Position
complement(546234..550538)
AA seq 1434 aa
MKAKLEQIAEIDQALVDQLPNFKIKMNQTDRFTATLTLLFESFVDFATIQKLKSIKPKID
GVKIQLINSWENVDQNQLALFWNQAVADCSLKINSNLETIHSVSFSEASFSFKTDDLNFV
QQVNAAKEQLLKTLLDWSINTNTIDIEYIDNSSTYLLENQERTQKELIAQQQKLETIKAQ
QEAQTKAINDYKYTNSIHNAMNPIPLNDVTEEMKQVWVQGQVFHVEKESRRNGFIYRFRI
LDDTNTLEIFEFALNENPEREKIKKNDWIVALITILPTRNDGVKQNFVGKINKLLLKPQQ
IDQAFFSPRIEFNFHTKMSALDSIIEPKDLIDFATKNNLKTIGITDRNVVQAYPEIFTYL
NKTKSDLKIIYGIETEKIPSYIELVLNPCDQNLNNATYVVFDIETTGLFPNYDGVIEIGA
IKIKNNELLGRLSFFLKPNKEISLATQELTNITNSDIADAISEKEGLIKIFEFFKDSVLV
AHNAINFDINFLNIRAVHHNLEPLNNPVIDTLMISRAINKDFKSHRLGWVCKKYGIDYNE
DSAHRADYDAEVLNQVFKVMLDKLFHEYSITNLNEINDKLQNDTLRSRIFGKWLNLYVKK
QENIRDMYELVSLSHTDNFFSRPTLYREQIEKKRENGLLTTNAVHESDLIEALFSKTDQE
IKSIIQSYDFITLPSLKTQAHLTYEQNKISLEDLKHAFVKLVSFSYELNKKVVYSNTPYF
LDADHKKFYDVYVHSKQLEGKSHRFSHEKYVPDLYLDDAKAAEFELSYLNNETWINDIIY
NHPQAIVDLIDDSIAPLKSGLYAPKIEGVNEKAKAYIYETAHRIYGDHLHPIIQKRLDRE
WNAISEHGFTVVYWISHLLVKKSLEDGYGVGSRGSVGSSLVATFLDITDVNPLPPHYLCT
KCKYCEFVEDADDGFDLVPKNCSNCDLTLTTNGHNIPFETFLGFNADKVPDIDLNFSGLY
QQTAHNFIMEYFGSSHAFRAGTIATVAEKTAFGMVRKYFEEQKLDPKVRDSTIMLYALAC
INSKRTTGQHPGGIIVVPEDLSIFDFSPYNYPANKKEENWLTTHFAFEYLHDNLLKFDIL
GHDNPTILNLIKKLTNIDDRDVPMYDLKVIASFSDISVFNLEPRDVLNETTGAISIPEFG
TKFVRQMLVDTKPKSFADLIRISGLSHGTDVWLDNAQSLIKSGKVLKDVIACRDDIMTYL
IALNIEPSIAFAVMEDVRKGKKIKLDHQKILQEKQIPQWYIESANKIKYMFPKAHATAYV
MHAYKFAWFKLYYPLEYYAAFLSVRAEKVDMLIIKKGKLAIEEEYKRIVDKENKAKNGNG
PKPTTAELESLNTYEIMVELLARGIKINNVDIKKSAATDFLIDRATNSIIPPFTMLPGLG
EIVANSIVSARDELQFATIEDLKARTKLSKKDLDNLSKIGALDELSETDQLTLF
NT seq 4305 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaagcgaaattagaacaaatagctgaaattgatcaagctttagttgaccaattacct
aattttaaaatcaaaatgaatcaaacagatagatttacagcaacgcttacacttcttttt
gaatcatttgttgattttgctacaattcaaaaactaaaatcaattaaaccaaaaattgat
ggtgttaaaatccagttaataaactcttgagaaaatgttgatcaaaaccaacttgcttta
ttttgaaatcaagctgtagctgattgttctttaaaaattaattcaaatctagaaactatt
cattcagttagttttagtgaagcatcatttagttttaaaactgatgatttaaattttgtc
caacaagttaatgcagctaaagaacaattattaaaaacacttttagattgatcaattaat
acaaacacaattgatattgaatacattgacaacagtagtacttatttattagaaaaccaa
gaacgaactcaaaaagaattaattgctcaacaacaaaaacttgaaactataaaagctcaa
caagaagctcaaactaaagcaattaatgattataaatatactaattcaattcacaatgcc
atgaatccgatcccactaaatgatgtaactgaagaaatgaaacaagtatgggttcaagga
caagtttttcatgttgaaaaagaatcaagaagaaacggatttatatatcgatttagaatt
ttagatgatactaatactcttgaaatttttgaatttgctttaaacgaaaatccagaacga
gaaaaaatcaaaaagaatgattgaatcgttgcacttattacaattctaccaacacgaaac
gatggagttaaacaaaactttgttggtaaaattaataaactattattaaaaccacaacaa
attgatcaagcttttttctcaccccgtattgaattcaacttccatacaaaaatgagtgca
cttgattcaattattgaacccaaagacttaattgattttgctactaaaaacaatttaaaa
acaattggtattactgatcgaaatgttgtacaagcatatccggaaatttttacttattta
aacaaaactaaaagtgatttaaaaataatatatggaattgaaactgaaaaaattccatca
tatattgaactagttctaaatccttgtgatcaaaatctaaataatgctacatatgttgtt
tttgatattgaaacaacaggactttttccaaactatgatggagtcattgaaattggagca
atcaagatcaaaaacaatgaacttttaggtagacttagcttctttttaaaaccaaataaa
gaaattagtttagctactcaagaattaactaatattactaattctgatattgccgatgca
atctctgaaaaagaaggattaataaaaatctttgaattcttcaaagacagtgtactagtt
gctcataatgcaattaactttgatattaacttcttaaatattagagcagttcatcataat
ctagaaccacttaataaccctgtgattgatacattaatgatctcaagagcaatcaataaa
gattttaaaagtcaccgtttaggatgagtatgtaaaaagtatggaattgattataatgaa
gacagtgcgcatagagctgattatgatgcagaagtattaaatcaagtctttaaagtaatg
ttagataaattatttcatgagtattcaataactaatttaaatgaaattaatgataaatta
caaaacgatacactaagaagtagaatctttggtaaatgattaaatctatatgttaaaaaa
caagaaaatataagagatatgtatgagctagtttcactatctcatactgataactttttt
tcaagaccaacactttatagagaacaaattgaaaagaaaagagaaaatggtttattaaca
actaatgcagttcatgaatctgatctaattgaagctttattttctaaaactgatcaagaa
attaaaagtattatacagtcgtatgattttattacattaccatctcttaaaacccaagct
catttaacatatgaacaaaataaaattagtttagaagatcttaaacatgcttttgttaaa
ctagttagttttagttatgaattaaataaaaaagtagtgtattcaaatactccctacttt
ttagatgctgatcataaaaagttttatgatgtatatgttcattcaaaacaactagaaggg
aaatcacaccggtttagtcatgaaaaatatgtacctgatctttatttagatgatgctaaa
gcagctgaatttgaactttcatatttaaataatgaaacttgaattaatgatattatttac
aatcacccccaagcaatagtagatttaattgatgatagtattgccccgcttaaaagtggt
ttatatgctccaaaaattgaaggtgttaatgaaaaagctaaggcttatatttatgaaact
gcccaccggatttatggagatcatttacacccaattattcaaaaacgattagatcgagaa
tgaaatgcaattagtgaacacgggtttactgttgtttattgaatttcacacttattagta
aaaaaatctttagaagatggatatggtgtagggagtcggggatcggttggttcttcactt
gttgcaacatttttagatataactgatgttaaccctctacccccacactatttgtgtact
aaatgtaaatattgtgagtttgttgaagatgctgatgatgggtttgatttagtacctaag
aattgttcaaattgtgatcttactttaacaacaaatggacataatattccatttgaaacc
ttcttaggttttaatgctgataaagtacctgatattgatttaaacttttctggactttat
caacaaacagctcataactttattatggaatattttggatcttcacacgcttttagagct
ggaacaatcgcaacagttgctgaaaaaacagcttttggaatggttcgaaaatattttgaa
gaacaaaaactagatcctaaagttcgtgattcaacaattatgttatatgcacttgcttgt
attaactcaaaacgaacaacaggacaacacccaggaggaattattgtagttcctgaagat
ttatctatttttgatttctcaccatacaactatccagctaataaaaaagaagaaaactga
ttaacaacccattttgcttttgaatatttacatgataatttattaaagtttgatatttta
ggtcatgataatccaacgattttaaaccttattaaaaaattaacaaacattgatgatcgt
gatgtaccaatgtatgatttaaaagttattgcatcatttagtgatatatctgtttttaat
ctagaaccacgtgatgttttaaacgagacaacaggagctattagtattcctgaatttggt
actaagtttgtgcgacaaatgttagttgacaccaaacctaaatcatttgctgacttgata
cggatctcaggtttatctcatggaactgatgtttgattagataatgctcaatcattaatt
aaatcaggtaaagtactaaaagatgtaattgcttgtcgggatgatattatgacctattta
atcgctttaaacatcgaaccatcaattgcttttgctgtaatggaagatgtaagaaaaggt
aagaaaattaaattagatcatcaaaagatcttacaagaaaaacaaattccacaatgatat
attgaatcagctaataagattaaatatatgttcccaaaagcacacgcgactgcttatgta
atgcacgcttataaatttgcttgatttaaactttattacccccttgaatactatgctgct
tttttaagtgtgcgagctgaaaaagttgatatgttaattattaaaaaagggaaattagca
attgaagaagaatataaacgaattgttgataaagaaaataaagctaaaaatggtaatgga
ccaaaaccaacaacagctgaacttgaatcattaaacacttatgaaattatggttgaacta
ttagctagaggaattaaaatcaataatgttgatattaaaaaatcagctgcaactgacttt
ttaatcgatcgagcaacaaatagtattatcccaccttttacaatgcttcctggattaggt
gagattgttgcaaatagtattgtaagtgcacgagatgaattacaatttgcaaccattgaa
gatctaaaggctagaactaaactatcaaaaaaagatcttgataatttatcaaaaattggt
gcacttgatgaactaagtgaaacagatcagttgactttattttaa

DBGET integrated database retrieval system