Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815: UPA3_0056
Help
Entry
UPA3_0056 CDS
T00680
Symbol
rnr
Name
(GenBank) ribonuclease R
KO
K12573
ribonuclease R [EC:
3.1.13.1
]
Organism
upa
Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815
Pathway
upa03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
upa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
UPA3_0056 (rnr)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
upa03019
]
UPA3_0056 (rnr)
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
upa03016
]
UPA3_0056 (rnr)
Enzymes [BR:
upa01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.13 Exoribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.13.1 exoribonuclease II
UPA3_0056 (rnr)
Messenger RNA biogenesis [BR:
upa03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
UPA3_0056 (rnr)
Transfer RNA biogenesis [BR:
upa03016
]
Prokaryotic type
tRNA degradation factors
UPA3_0056 (rnr)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNB
CSD2
S1
OB_RNB
RNase_II_C_S1
S1_RRP5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA33123
UniProt:
A0A2C9DYV6
LinkDB
All DBs
Position
70271..72436
Genome browser
AA seq
721 aa
AA seq
DB search
MSDFTKQTITEVISKEERPIPAAILAKKVLEKIPTLNKTDVYKLIDLLIQENTIKKLENN
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TIEGLIRIKNLKDDFYDFIPENMTLVGQKRKKIITVGNKVRVRVIEANKLTRKIDFELVA
Q
NT seq
2166 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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caataa
DBGET
integrated database retrieval system
