Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815: UPA3_0081
Help
Entry
UPA3_0081 CDS
T00680
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase, A subunit
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
upa
Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
upa00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
upa03032
]
UPA3_0081 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
upa03400
]
UPA3_0081 (gyrA)
Enzymes [BR:
upa01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
UPA3_0081 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
upa03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
UPA3_0081 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
upa03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
UPA3_0081 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
DUF6364
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA32732
UniProt:
A0A2C9DXZ6
LinkDB
All DBs
Position
99097..101619
Genome browser
AA seq
840 aa
AA seq
DB search
MALKKPKKSRLTTEEIKQQLEGSTIKEQSITKEVETSFLDYSMSVIVARALPDVRDGFKP
VHRRALFAAFENGMTHDKPYKKSARWVGDVIGKYHPHGDQAVYQTIVRMAQDFSMRYLLV
DGHGNFGSIDGDSAAAMRYTEARLSKISYELLKYIDKETVDFVPNYDASEQEPSVLPSGF
PNLLTNGTTGIAVGMATNIPPHNLTEVCQAIKAYAKNHNVTISEIMEYLKGPDFPTGAEI
YGDSGIIKYFNTGRGSVTIRSKYEIEDIGQGRVAIVVTEIPYMVNKANLIEKIVELVTNK
QIEGISDLRDESSRDGIRIVIEVKRDVIPEVLLNKLFKTTPLQTNFSVNNLALVNGVPMV
LNIKEMIKYYFEHQIEILVRRTNFDLKKAKERIHIVEGLVIAVNNIDEVIKIIKASGDDD
IASKSLIQRFDLTELQTKAILEMRLRALTGLNIDKLKKEYEDLILVIKDLEDVLNNYNRQ
VNIICENLDYLIEKFGDERRTEIMYGVSSHIDDEDLIPVEDIVVTMSKRGYFKRLPIDTY
KNQRRGGVGVQGLKTYEDDDVEKILVANTHTDLLFFSDLGRVYRLRGHEVPLGSRQSKGI
PAINFLPIEKSESILTILPIDNYDQGSLFFTTSKGIIKRANLSDFESIRANGKIAITLKD
GDKLFSVMQTLGNDEVFIGASNGNVIRFNENDAREMGRIATGVKGINLENDEYVVGTGLS
SHGEYVLAVGSKGLGKLTDINDYRLTKRGAKGVNTLKVNDKTGNLVSIKVVNREEEALII
TTSGKVIRLSIKDISVIGRNTSGVKLISLENKEEVKSIAIFKKEEINDEQLLQENDYNLK
NT seq
2523 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcattaaaaaaaccaaaaaaaagtcgtttaaccaccgaagaaattaagcaacaatta
gaaggttcaacgattaaagaacaatcaattacaaaagaagtcgaaacatcatttttagat
tattcaatgtctgtaatcgttgcacgtgctttgcctgatgtgcgtgatggatttaagccc
gtgcatcgccgagctttatttgctgctttcgaaaacggaatgacacatgataagccttat
aaaaaatctgcacgttgagttggggatgtaattggaaaatatcatccacatggagatcaa
gctgtttatcaaactattgtaagaatggcacaagacttttcaatgcgttatttattagtt
gatggtcatggtaattttggttcgattgatggtgatagtgcagctgcgatgcgttataca
gaagcacgattatcaaaaatctcttatgaattattaaaatacattgataaagaaacagta
gattttgtacctaattatgatgcatcagaacaagaaccaagtgttttaccatcaggtttt
ccaaatttattaacaaatggaactacaggaatagctgttgggatggcaacaaatattcca
ccacataatttaactgaagtttgtcaagcaataaaagcttatgctaaaaaccataatgtt
actatttctgaaattatggaatatctaaaaggtcctgattttccaacaggcgctgaaatt
tatggtgatagcggtattattaaatattttaatacaggtcgtggttcagtaacaattcgt
tcaaaatatgaaattgaagatattgggcaaggacgtgtagcaattgttgtgacagaaatt
ccttatatggttaataaagctaatttaattgaaaaaattgttgaattagtaacaaacaaa
caaatcgaaggaatttctgatttacgtgacgagtcaagtcgtgatggaattcgaattgtt
attgaagttaaacgtgatgttatacctgaagttttattaaacaaattatttaaaacaaca
cctttacaaacaaattttagtgttaataatttagctttagttaatggtgtaccaatggta
ttaaacattaaggaaatgattaaatactattttgaacaccaaattgagattttagtaaga
agaacaaattttgatttaaaaaaagcaaaagaacgaattcatattgttgaaggtttagta
attgctgttaataatatcgatgaagtaattaaaattattaaagcctcaggtgatgatgat
attgcttcaaaatcactaattcaacgtttcgatttaacagaattgcaaacgaaagcaatt
ttagaaatgcgtttacgcgctttaacaggactaaatattgataaattaaaaaaagaatat
gaagatttaatattagttattaaagatttagaagatgttttaaacaactacaatcgtcaa
gttaatattatttgtgaaaatttagattatttaattgaaaaatttggtgatgagcgtcgt
acagaaattatgtatggagttagttcgcatattgatgatgaagatttaataccagtcgaa
gatattgttgtaacaatgtcaaaacgtggttattttaaacgtttgccaattgatacatat
aaaaatcaacgacgtggtggtgtaggtgtacaaggattaaaaacgtatgaggatgatgat
gttgaaaaaatcttagttgctaatacccatacagatttattattcttttctgatttaggt
cgtgtttatcgattacgaggacatgaagtaccattgggatcacgacaatcaaaaggaatt
ccagcaattaattttttaccaattgaaaaaagtgaaagcattttaactattttaccaata
gataattatgatcaaggttcattattctttacaacaagtaaaggaattataaaacgagct
aatctaagtgatttcgagtcaattcgtgctaatggtaaaattgctattactttaaaagat
ggtgataaattattttcagtaatgcaaacactaggtaatgatgaagtatttatcggcgca
tcaaatggtaatgtaattcgtttcaatgaaaatgatgcacgtgaaatgggaagaattgcg
acaggtgttaaaggaattaatttagaaaatgatgaatatgttgtaggaacagggttatct
agtcatggagaatatgttttagctgttggttctaaaggattaggtaaattaactgacatc
aatgattatcgtttaactaagcgtggagcaaaaggtgttaatacactaaaagtaaatgat
aaaacaggtaacttagtaagtattaaagttgttaatcgtgaagaagaagctttaattatt
acaactagtggaaaagttattcgtttatcgattaaagacattagtgtaattggaagaaat
acatcaggagttaaattaatttcattagaaaataaagaagaagtaaaatcaattgctatc
tttaaaaaagaagaaattaatgatgaacaattattacaagaaaatgattacaatctaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
