Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815: UPA3_0476
Help
Entry
UPA3_0476 CDS
T00680
Symbol
pheT
Name
(GenBank) phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit
KO
K01890
phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain [EC:
6.1.1.20
]
Organism
upa
Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815
Pathway
upa00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
upa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
UPA3_0476 (pheT)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
upa01007
]
UPA3_0476 (pheT)
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
upa03016
]
UPA3_0476 (pheT)
Enzymes [BR:
upa01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.20 phenylalanine---tRNA ligase
UPA3_0476 (pheT)
Amino acid related enzymes [BR:
upa01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class II (U)
UPA3_0476 (pheT)
Transfer RNA biogenesis [BR:
upa03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
UPA3_0476 (pheT)
Prokaryotic type
UPA3_0476 (pheT)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
B3_4
tRNA_synthFbeta
tRNA_bind
B5
FDX-ACB
DUF5387
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACA33195
UniProt:
A0A2C9DZ09
LinkDB
All DBs
Position
complement(520137..522455)
Genome browser
AA seq
772 aa
AA seq
DB search
MILSLNLLHKISPKLKKIPLNELCAALMDLGCEVETINSIKPSTNLVFAKVLEKTRHPNA
NHLNLVKVKANQKVYEIVCGANNFSVHNWVVLAKLNAELANGLKITPRELRGYVSNGMLC
AYSEINPQATSFLTSTDLDGILVLDDNYDHYKTPNQIFNLDDVILDLSIPSNRNDLNGYF
WIAKELCAYFDFEYVVDATINHRPHKEIIDVRILSDDVNSYGIIEVKNIQNYILKWNTKS
ILINNQIKVLNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDARKISGQIVVKNAEEDAILLGLDQKEYL
IKKGDLIIVDDQKILALAGIIGSNDSKIDATSTTAYIECANFNPMLIANTARRLKINTAA
AMRFSKPLTNYVTKVTLKKLLANFKSDAKLIYYFKHSVHNVIKNKINQVSDFVGAEIDLD
TAQTFLKRLGYKINKSNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKISIQEIKPQPISFDILNFEN
NLAYDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKNQTQAHEFNFFNFKQAYEINNPTSNMRSHLKL
NNLNSLLEVLEYNQNQKNELENIFEISKINPVDSSQQTVLSIILCKPLINSKINDSLIVN
NFVTTKALLHALLTKLNIDYAYDKNHVVNELYDNNQLALINANKQVFGFIGQLKNQVKKT
YGLSNDIFIINLNLTSYLNQKQVITKVIKPSMYHDVIRDISVKLASDVDLNNIIANIKKI
KNIRKVEISDLYIKDDGIIYTFKYYINDHLSNLSSEQIIIIEQEVNNYLKQF
NT seq
2319 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattttaagtttaaatttattacataagattagtccaaaactaaaaaagattccttta
aatgaattatgcgcagctttaatggatttaggttgtgaagttgaaacaattaatagcatt
aaaccatctactaatttagtttttgctaaagtattagaaaaaactagacatcctaatgct
aatcatttaaatttagttaaagttaaagcaaaccaaaaagtttatgagatcgtttgtggt
gcaaataattttagtgttcataattgagttgttttagcaaaattaaatgccgaactagca
aatggtttaaaaattacgccacgtgaattaagaggatatgtttcaaatggaatgttatgt
gcttacagtgaaattaatccacaagctactagttttttaacatcaacagatttagatgga
attttagttttagatgacaattatgaccattataaaaccccaaatcaaatttttaattta
gatgatgttattttagatttatcaattccatcaaatcggaatgatttaaatggttatttt
tgaatagctaaggaattatgtgcttattttgatttcgaatatgttgttgatgcaacgatt
aatcatcgcccacataaagaaattattgacgtgcggattttatctgatgatgttaattcg
tatggaataatcgaggttaaaaatattcaaaattatattttaaaatggaatactaaaagt
atattgattaataatcaaattaaagttcttaataatttcgctgataatatgaatttttta
acattattaactgctaatccacttcatgcatttgatgcacgaaaaattagtggtcaaatt
gttgttaaaaatgctgaagaagatgcaattttattgggtttagatcaaaaagaatattta
attaaaaaaggggatctaattatcgttgatgatcaaaaaattttagcacttgctggaatt
attggttctaatgattctaaaattgatgcaacaagcacaactgcttatattgaatgtgca
aattttaatcctatgttgattgcaaatacagcgcgtcgtttaaaaatcaataccgcagcg
gctatgcgttttagcaaacccttaactaattatgttacaaaagtaacattaaaaaaattg
ttagctaattttaaatcagatgcaaaattaatttattattttaaacattcagttcataat
gtcattaaaaataaaattaatcaagtaagtgattttgtgggtgcagaaattgatttagac
actgctcaaacatttttaaaacgcttaggttataaaattaataagtctaatttaattact
ccaagtcatcgatatgatgtattaaatgagtttgatgtttatgaagatattatgaaaaaa
attagtattcaagaaatcaaaccacaaccaatcagttttgatattttaaattttgaaaat
aatctagcttatgattttgaaaaaaaagttagtgattttttagttgatcaaggtttgttt
gagtgtaaaacttataatttaaaaaatcaaacacaagcacatgagtttaatttttttaat
tttaaacaagcttatgaaattaataatccaacttcaaatatgcgttcgcatttaaaatta
aataaccttaactccttacttgaagtattagaatataaccaaaaccaaaaaaatgaatta
gaaaatatctttgagatttcaaagattaatccagttgattcaagtcaacaaacagtttta
tcaatcattttatgtaaaccattaattaattcaaaaattaatgattcattaatagttaat
aattttgtgacaacaaaagctttactacatgctttattaacaaaattaaatattgattat
gcatatgataaaaatcatgttgttaatgaattatatgataataaccaattagctttaatt
aatgcaaacaaacaagtatttggttttattggtcaactaaaaaatcaagtcaaaaaaaca
tatggtttaagtaatgatatttttattattaatttaaatttaactagttatttaaatcaa
aaacaagtaatcactaaagttattaagccaagtatgtatcatgatgtcatacgtgatatt
agtgttaaattagcttctgacgttgacttaaataatataattgctaatattaaaaaaatt
aaaaatattagaaaagttgaaatcagcgatctttatataaaagatgatggaattatttat
acttttaaatattatattaatgatcatttatctaatttaagtagtgaacaaattataatc
attgaacaagaagtaaataattatttgaaacaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system