Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815: UPA3_0539 Help Entry UPA3_0539         CDS       T00680                                  Name (GenBank) conserved hypothetical protein   KO K12574   ribonuclease J [EC:3.1.-.-] Organism upa  Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 27815 Pathway upa03018   RNA degradation Brite KEGG Orthology (KO) [BR:upa00001]  09120 Genetic Information Processing   09123 Folding, sorting and degradation    03018 RNA degradation     UPA3_0539  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03019 Messenger RNA biogenesis [BR:upa03019]     UPA3_0539 Messenger RNA biogenesis [BR:upa03019]  Prokaryotic type   Bacterial mRNA degradation factors    RNA degradosome components     Ribonucreases      UPA3_0539 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  RNase_J_C RNase_J_b_CASP Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ACA33108 UniProt:  A0A2C9DYT9 LinkDB All DBs Position complement(628989..630659) Genome browser AA seq 556 aa AA seqDB search MAKINFLSLGGQDERGKSCFVLEVNDDIFIFNAGAKIPTSDVFGVNMIVCDYSYLEKNAK RVKGIFIGTPTFNNVMGIKLLLGQVGYKIPIYTSPIGAIVIKKIFEQKVNNKKIEPNIIE LDPISDKKIGSIYVTSFKVSNSMPHSYGFVLKTSDGAIVYVDEFIISNDKNKTFDSQINL LNNITKNNTLALIVGMGQAGNPYFTAPNHKNKAFYEAALQNTKNRLIVGCYSNDAYSIFT LATIAKQQNRPFIVYSNNFINTFIGVLKLKLFNSKNLISLPVSEINNSKNAIIVVIENQD TLFSKLNKILHNEDKYVNLSSDDQLILGVVITPGFEMLAAELSDEVGRLDIPYKALPKTV LPMTQSDEDLKHLINFLQPKFLIPINGLYKTEVKFSSTVTTSWIKSDQIISVSNGELFTI EDKVLNPKPQIIELEDKYISSFDALDVGANILFERSQMGENGVINLIVIFDKQFQKLFNY VEFDYCGVVNNDAQIKEIEETFKKRMGECLVYDERKRLILKDTKANLKRLLTKLFEKKFN KRPLVLPTVVDCYKTK NT seq 1671 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggctaaaattaattttttatcgttaggaggacaagatgaaagaggaaaatcttgcttt gttcttgaagtgaacgatgatatttttatttttaatgctggtgcgaaaattccaacaagt gatgtttttggcgtaaatatgattgtttgtgattattcttatttagaaaaaaacgcaaaa cgcgttaagggaatttttattggtacaccaacatttaataatgttatgggaattaaatta ttactaggacaagtaggttataaaatcccaatttacacaagcccaataggagcaattgtt attaaaaaaatttttgaacaaaaagtaaacaataaaaaaattgaacctaatattattgag ctagatccaatttcagataagaaaattggatcaatttatgttacatcttttaaagtttca aactcaatgcctcattcatatggatttgtattaaaaacaagcgatggagcaattgtttat gttgatgagtttattatttcaaatgataaaaataaaacctttgattcacaaattaatctt ttaaataacattactaaaaataatactctagctttgattgtaggaatgggtcaagcagga aatccttattttactgctcccaatcataaaaataaggctttttatgaagctgcattgcaa aatactaaaaatcgtttaattgttggttgttatagcaatgatgcatatagtatttttact ttggcaacaattgcaaaacaacaaaatcgcccctttattgtttatagtaataacttcatt aacacttttattggtgtattgaaattgaaattatttaatagtaaaaatttaatttcttta ccggtttctgaaattaataattcaaaaaatgcaattattgtggtaattgaaaatcaagat actcttttttcaaaattaaataaaattctacataacgaagataaatatgttaatttgtct tctgatgatcaactaatattaggcgttgttattacaccaggttttgaaatgttagcagct gaactaagtgatgaagtaggtcgtttagacattccttataaagcattacctaaaacagtt ttaccaatgacacaatctgatgaagatttaaaacatctaattaattttttacaaccaaaa tttttaattccaattaatggattatataaaactgaggttaaatttagttctacagttaca acatcttgaattaaaagtgatcagattattagtgtttctaatggcgaattattcactata gaagataaagttttaaatcctaaaccccaaattattgagttagaagataaatatatttca tcttttgatgcacttgatgttggtgctaatattttatttgaacgatcacaaatgggcgag aatggtgttattaatttaattgttatttttgataaacaattccaaaaactatttaattat gttgaatttgattattgtggagttgttaataatgacgctcaaattaaagaaattgaagaa acatttaaaaaacgtatgggtgaatgtttagtttatgatgaacgtaaacgcttaatacta aaagataccaaagcaaatttaaaacgtttattaactaaattatttgaaaagaaatttaat aagcgtccattagttttgccaacagtagttgactgttataaaacaaaataa

DBGET integrated database retrieval system