Ureaplasma parvum serovar 3 SV3F4: UP3_c0037 Help Entry UP3_c0037         CDS       T03673                                  Name (GenBank) excinuclease ABC subunit A   KO K03701   excinuclease ABC subunit A Organism upr  Ureaplasma parvum serovar 3 SV3F4 Pathway upr03420   Nucleotide excision repair Brite KEGG Orthology (KO) [BR:upr00001]  09120 Genetic Information Processing   09124 Replication and repair    03420 Nucleotide excision repair     UP3_c0037  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:upr03400]     UP3_c0037 DNA repair and recombination proteins [BR:upr03400]  Prokaryotic type   SSBR (single strand breaks repair)    NER (nucleotide excision repair)     GGR (global genome repair) factors      UP3_c0037   DSBR (double strand breaks repair)    NHEJ (non-homologous end-joining)     SHDIR (short-homology-dependent illegitimate recombination)      Supressor       UP3_c0037 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  UvrA_DNA-bind UvrA_inter ABC_tran SMC_N AAA_21 nSTAND1 AAA_16 AAA_29 nSTAND3 AAA_25 BCA_ABC_TP_C RsgA_GTPase SLFN-g3_helicase DnaJ_CXXCXGXG Viral_helicase1 AAA_23 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  BAO73344 LinkDB All DBs Position complement(48227..51058) Genome browser AA seq 943 aa AA seqDB search MDKIIIKGARENNLKNIDLEIPKNKLVVITGVSGSGKSSLAFDTIFAEGKRRYFESLSSY ARQFLGGNDKADVESIEGLSPTIAVDQKSTNQNPRSIVGTITEIYDYLRVLFARVGTPFC PNGHGQIKSQTPKQIADFLFSLSPKSKIQILAPIEIKKGYKINDVLNNLRNQGYLRVLVN NEVYQLDENLPQFLDNKKTDVAIIVDRLILNIDHQTKTRALDAIEFALNYSGGEIAFKVN DDIHYFTQNDVCQVCGFKIKEIEPTLFSFNSPIGACEQCKGLGYNYVPDERKMIPNPNLS INEGGLDYFKNTVNTTNLDWQRFNSIIKHYKIDKTKPLKELDRKEIDLLLYGSDEAIEID ITSANNKKYSSIDYVEGVLELVNRRYQETSSELAREHYNKYMSEKVCKSCKGKKLSSQAL SVLINKINIIDFIEKNIDEAIDFLLHLDLNEAQTKIANPILKEVLDRLGFLKNVGLEYLT LARPASSLSGGEAQRIRLATQIGSKLTGILYVLDEPSIGLHQRDNDKLINTLKEMRDLGN TVIVVEHDEETMLAADYLIDIGPQAGVNGGYVIAAGTPQEVMQNPNSLTGQYLSKQKDIL VPKTRRSGNGHKVILKGAKHNNLKNVDLTIPLGKFICVTGVSGSGKSSLILETLVKAIEY TNFNPFVIPGEYKDLIGASNVDKIVVVNQDAIGRTTRSNPATYVGVFDDIRTVFENTIEA KARGYSKSRFSFNIKGGRCERCWGDGTIRIEMHFLPDVYISCEECHGKRYNDETLQVKFK GKSIYDVLKMPIDEALVFFENYPGIHRKLQLLVDVGLGYLELGASSTSLSGGEAQRIKLA KFLQRKPTGKTLFVLDEPTTGLHIDDVAKLIKILDKIVDGGDTVLVIEHNLDLIKVADYI IDIGPEGGNKGGKIIATGTPEQLLSKKDISYTAQYLEKYLKKN NT seq 2832 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atggacaaaattatcattaaaggcgctagagaaaataatttaaaaaatattgatctagaa attcctaaaaataaactagttgttattacaggtgtttcaggatcaggtaaatcatcgctt gcttttgatacgatttttgctgaaggaaaacgtcgttattttgaatcactttcaagttat gcccgccagtttttaggtggaaatgataaagctgatgttgaaagtattgaaggtttatca ccaaccattgctgttgatcaaaaatcaacaaatcaaaatccaagatcaattgttgggaca attacagaaatctatgattatttacgagttttatttgctcgtgttggaacacctttttgt ccaaatgggcatggtcaaattaaatcacaaactccaaaacaaattgctgatttcttattt agcttatcacctaaaagtaaaatacaaattcttgcaccaattgaaattaaaaaaggttat aaaattaatgatgttttaaataatttaagaaatcaaggttatttaagagttttagttaat 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