Ureaplasma parvum serovar 3 SV3F4: UP3_c0055
Help
Entry
UP3_c0055 CDS
T03673
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
upr
Ureaplasma parvum serovar 3 SV3F4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
upr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
upr03032
]
UP3_c0055
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
upr03400
]
UP3_c0055
Enzymes [BR:
upr01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
UP3_c0055
DNA replication proteins [BR:
upr03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
UP3_c0055
DNA repair and recombination proteins [BR:
upr03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
UP3_c0055
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
DUF6364
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAO73362
LinkDB
All DBs
Position
complement(74777..77299)
Genome browser
AA seq
840 aa
AA seq
DB search
MALKKPKKSRLTTEEIKQQLEGSTIKEQSITKEVETSFLDYSMSVIVARALPDVRDGFKP
VHRRALFAAFENGMTHDKPYKKSARWVGDVIGKYHPHGDQAVYQTIVRMAQDFSMRYLLV
DGHGNFGSIDGDSAAAMRYTEARLSKISYELLKYIDKETVDFVPNYDASEQEPSVLPSGF
PNLLTNGTTGIAVGMATNIPPHNLTEVCQAIKAYAKNHNVTISEIMEYLKGPDFPTGAEI
YGDSGIIKYFNTGRGSVTIRSKYEIEDIGQGRVAIVVTEIPYMVNKANLIEKIVELVTNK
QIEGISDLRDESSRDGIRIVIEVKRDVIPEVLLNKLFKTTPLQTNFSVNNLALVNGVPMV
LNIKEMIKYYFEHQIEILVRRTNFDLKKAKERIHIVEGLVIAVNNIDEVIKIIKASGDDD
IASKSLIQRFDLTELQTKAILEMRLRALTGLNIDKLKKEYEDLILVIKDLEDVLNNYNRQ
VNIICENLDYLIEKFGDERRTEIMYGVSSHIDDEDLIPVEDIVVTMSKRGYFKRLPIDTY
KNQRRGGVGVQGLKTYEDDDVEKILVANTHTDLLFFSDLGRVYRLRGHEVPLGSRQSKGI
PAINFLPIEKSESILTILPIDNYDQGSLFFTTSKGIIKRANLSDFESIRANGKIAITLKD
GDKLFSVMQTLGNDEVFIGASNGNVIRFNENDAREMGRIATGVKGINLENDEYVVGTGLS
SHGEYVLAVGSKGLGKLTDINDYRLTKRGAKGVNTLKVNDKTGNLVSIKVVNREEEALII
TTSGKVIRLSIKDISVIGRNTSGVKLISLENKEEVKSIAIFKKEEINDEQLLQENDYNLK
NT seq
2523 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcattaaaaaaaccaaaaaaaagtcgtttaaccaccgaagaaattaagcaacaatta
gaaggttcaacgattaaagaacaatcaattacaaaagaagtcgaaacatcatttttagat
tattcaatgtctgtaatcgttgcacgtgctttgcctgatgtgcgtgatggatttaagccc
gtgcatcgccgagctttatttgctgctttcgaaaacggaatgacacatgataagccttat
aaaaaatctgcacgttgagttggggatgtaattggaaaatatcatccacatggagatcaa
gctgtttatcaaactattgtaagaatggcacaagacttttcaatgcgttatttattagtt
gatggtcatggtaattttggttcgattgatggtgatagtgcagctgcgatgcgttataca
gaagcacgattatcaaaaatctcttatgaattattaaaatacattgataaagaaacagta
gattttgtacctaattatgatgcatcagaacaagaaccaagtgttttaccatcaggtttt
ccaaatttattaacaaatggaactacaggaatagctgttgggatggcaacaaatattcca
ccacataatttaactgaagtttgtcaagcaataaaagcttatgctaaaaaccataatgtt
actatttctgaaattatggaatatctaaaaggtcctgattttccaacaggcgctgaaatt
tatggtgatagcggtattattaaatattttaatacaggtcgtggttcagtaacaattcgt
tcaaaatatgaaattgaagatattgggcaaggacgtgtagcaattgttgtgacagaaatt
ccttatatggttaataaagctaatttaattgaaaaaattgttgaattagtaacaaacaaa
caaatcgaaggaatttctgatttacgtgacgagtcaagtcgtgatggaattcgaattgtt
attgaagttaaacgtgatgttatacctgaagttttattaaacaaattatttaaaacaaca
cctttacaaacaaattttagtgttaataatttagctttagttaatggtgtaccaatggta
ttaaacattaaggaaatgattaaatactattttgaacaccaaattgagattttagtaaga
agaacaaattttgatttaaaaaaagcaaaagaacgaattcatattgttgaaggtttagta
attgctgttaataatatcgatgaagtaattaaaattattaaagcctcaggtgatgatgat
attgcttcaaaatcactaattcaacgtttcgatttaacagaattgcaaacgaaagcaatt
ttagaaatgcgtttacgcgctttaacaggactaaatattgataaattaaaaaaagaatat
gaagatttaatattagttattaaagatttagaagatgttttaaacaactacaatcgtcaa
gttaatattatttgtgaaaatttagattatttaattgaaaaatttggtgatgagcgtcgt
acagaaattatgtatggagttagttcgcatattgatgatgaagatttaataccagtcgaa
gatattgttgtaacaatgtcaaaacgtggttattttaaacgtttgccaattgatacatat
aaaaatcaacgacgtggtggtgtaggtgtacaaggattaaaaacgtatgaggatgatgat
gttgaaaaaatcttagttgctaatacccatacagatttattattcttttctgatttaggt
cgtgtttatcgattacgaggacatgaagtaccattgggatcacgacaatcaaaaggaatt
ccagcaattaattttttaccaattgaaaaaagtgaaagcattttaactattttaccaata
gataattatgatcaaggttcattattctttacaacaagtaaaggaattataaaacgagct
aatctaagtgatttcgagtcaattcgtgctaatggtaaaattgctattactttaaaagat
ggtgataaattattttcagtaatgcaaacactaggtaatgatgaagtatttatcggcgca
tcaaatggtaatgtaattcgtttcaatgaaaatgatgcacgtgaaatgggaagaattgcg
acaggtgttaaaggaattaatttagaaaatgatgaatatgttgtaggaacagggttatct
agtcatggagaatatgttttagctgttggttctaaaggattaggtaaattaactgacatc
aatgattatcgtttaactaagcgtggagcaaaaggtgttaatacactaaaagtaaatgat
aaaacaggtaacttagtaagtattaaagttgttaatcgtgaagaagaagctttaattatt
acaactagtggaaaagttattcgtttatcgattaaagacattagtgtaattggaagaaat
acatcaggagttaaattaatttcattagaaaataaagaagaagtaaaatcaattgctatc
tttaaaaaagaagaaattaatgatgaacaattattacaagaaaatgattacaatctaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
