Ureaplasma parvum serovar 3 SV3F4: UP3_c0242
Help
Entry
UP3_c0242 CDS
T03673
Name
(GenBank) DNA primase
KO
K02316
DNA primase [EC:
2.7.7.101
]
Organism
upr
Ureaplasma parvum serovar 3 SV3F4
Pathway
upr03030
DNA replication
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
upr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
UP3_c0242
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
upr03032
]
UP3_c0242
Enzymes [BR:
upr01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.101 DNA primase DnaG
UP3_c0242
DNA replication proteins [BR:
upr03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Initiation Factors
Initiation factors (bacterial)
UP3_c0242
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNAG_N
zf-CHC2
Toprim_2
Toprim_4
Toprim
Vps36-NZF-N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAO73549
LinkDB
All DBs
Position
complement(328967..330892)
Genome browser
AA seq
641 aa
AA seq
DB search
MSKITNNVFLTIRNAVNISDVIQNYIKVIKKGNNYWAICPFHNDTNESLSINDKKQIFKC
FACNHAGDVIKFVAEYKKISYTLAAQEIVQLMNLDLNLLNHLQKISPQEIKKNKVFDLNK
QIQKWFINFLNNKNNIHVIDYLTKRNLNKNDLAYFKIGYAPNNDELLNLIKSNYNNLIQE
NDEFELNKLIENSFLVIDKNGNYHDFFNDRIIFSIYDHLNNVVGFSGRIITNEKTPKYLN
TKTTSVFKKDEVLYNFHNVITIENNHQLFIVEGFMDVITIHKSNKPNVVATMGVELTNKH
LELIKSYGIKDLILCFDNDQAGFLATKKQIMKLINSPFNIFIVNHKDNDCKDMDEYANKH
GYNATSKLLDQQLHISEFLLLEISNTNKSTPSLKHSYKQECFTIIKKYGDIFYVDKYVDF
MKQTFSIEENLLKKVIEELLINKQCNSIQNKKNIQSYQKQTQVTNKLTTSNPKVILTKID
KHFNHLVVIILMNRVFLNRLDTQVRNRLTKEQSLVINIIEDFYLYHFKINNILKNTDSFI
EFINKNYSKYTNVINQLTKMVQIIKYNPKFDNIVAFELAKNNFIYEWLNNQIKRLKLINL
NLNMNNNQEQIINNEKLIKQYNDEKILLDNLINASLFHKNQ
NT seq
1926 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaaaataactaataatgtttttttaacaattcgtaatgctgtaaatatttctgat
gttattcaaaattacattaaagtaattaaaaagggtaataattattgagctatttgtcca
tttcacaatgatacaaatgaatcattatcaattaatgataaaaaacaaatctttaaatgt
tttgcttgtaatcatgctggcgatgtgattaaatttgttgctgaatataaaaagatctct
tatactttagcagcacaagagattgttcaattaatgaatttagatttaaatttattgaat
catttacaaaaaatttcgccacaagaaattaaaaaaaataaggtttttgatttaaacaaa
caaattcaaaaatgatttattaattttttaaataataaaaataacattcatgttattgat
tatttaactaaacgaaatttaaataaaaatgatttagcatattttaaaatcggttatgct
ccaaataatgatgaattattaaatttaataaaatctaattataataatctgatacaagaa
aatgacgagtttgaattaaataaattaatagaaaattcctttttggtaattgataagaat
ggtaattaccatgatttttttaatgatcgtattatttttagtatttatgatcatctcaat
aacgttgttggttttagcggacgtataattacaaatgagaaaacaccaaaatatttaaat
actaaaaccacttctgtatttaaaaaagatgaagttctttataattttcataatgttatc
accattgaaaataatcatcaattatttatagttgaaggttttatggatgtcattacaatt
cataaatctaacaaaccaaacgttgtagcaacaatgggtgttgaattaactaataaacat
ttagaattaattaaaagctatggaattaaagatttaattttatgttttgataacgatcaa
gcaggttttttagctactaaaaaacaaattatgaaattaattaattccccattcaacatt
tttattgttaatcataaagataatgattgtaaagacatggatgaatatgcaaataagcac
ggttataatgcaacaagtaagttattagaccaacaacttcatattagtgaatttttatta
ttagaaattagtaatacaaacaaatctaccccctcactaaaacacagttataaacaagag
tgttttacaatcattaaaaaatatggtgatattttttatgtagataaatatgttgatttc
atgaaacaaacattttcaattgaagaaaatttattaaaaaaagttattgaagaattatta
attaacaaacaatgcaattctattcaaaacaaaaagaacattcaatcatatcaaaaacaa
acacaagtaactaataaacttactacttcaaacccaaaagttatcctaacaaaaattgat
aaacattttaaccacttagtagtaattatattaatgaatcgggttttcttaaaccgtctt
gatacgcaagttcgtaaccggttaactaaagagcaaagtttagtgattaatattatagaa
gacttttatttgtaccattttaagattaataatattttaaaaaacactgattcttttatt
gaatttattaataaaaactacagtaaatatactaatgttattaaccaacttacaaaaatg
gtgcagattattaaatataaccctaagtttgataatatagtagcatttgaactagctaaa
aataattttatatatgaatgattaaacaaccaaattaaacgtttaaaactcatcaatcta
aatttaaatatgaataataaccaagaacaaatcataaataatgaaaaattaataaagcaa
tataatgatgaaaaaattttattagacaatttaatcaatgcttctttatttcataaaaat
caataa
DBGET
integrated database retrieval system