KEGG   Ureaplasma parvum serovar 3 SV3F4: UP3_c0279
Entry
UP3_c0279         CDS       T03673                                 
Name
(GenBank) DNA topoisomerase IV, A subunit
  KO
K02621  topoisomerase IV subunit A [EC:5.6.2.2]
Organism
upr  Ureaplasma parvum serovar 3 SV3F4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:upr00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:upr03032]
    UP3_c0279
   03036 Chromosome and associated proteins [BR:upr03036]
    UP3_c0279
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:upr02048]
    UP3_c0279
Enzymes [BR:upr01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.2  DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
     UP3_c0279
DNA replication proteins [BR:upr03032]
 Prokaryotic type
  DNA Topoisomerases
   UP3_c0279
Chromosome and associated proteins [BR:upr03036]
 Prokaryotic type
  Chromosome partitioning proteins
   Other chromosome partitioning proteins
    UP3_c0279
Prokaryotic defense system [BR:upr02048]
 Toxin-antitoxin system (TA system)
  Type II TA system
   Type II TA system related factors
    UP3_c0279
SSDB
Motif
Pfam: DNA_topoisoIV DNA_gyraseA_C DGKD_4H PPP1R35_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAO73586
LinkDB
Position
complement(399157..401709)
AA seq 850 aa
MSDNHQKIINTPLDNIVGESYAKYAKYIIQDRALPDIRDGLKPVQRRILYAMSELGIFYD
KPYKKSARTVGEVIGKYHPHGDSSIYEAMVRMSQDWKNNLCLLDMHGNKGSIDGDNAAAM
RYTEARLSKIASVMLANLKKDVVKFSPNFDDSEKEPSILPSLFPNLLINGATGIASGYAT
NIPPHNPNEVFDALIYRIDHPDCSVEKLIKICPAPDFPTGGEIHDLNGCANAHKTGEGKF
IIRACIDFKINDNKINQIIISSIPYETNKALIIKEIEDIIYNKEVAGLIEVRDESDAKGI
SIIIDTKKDINLENVKNYLYKKTNLEISYNTKFIAIVHRTPTLVNLSTYLDAQINHSLDV
INKVDLYDLNKILLRIEIVEGLIKCVDLIDEIIKIIRASESRQDAKNTLIQVFNFTNNQA
EAIIMMRLHNLTRTDIFDLKNEWQSLQDEAKTLQERINSLQVRKNYLKQKMIEFKKTFGF
ERKTKLFDELVKVEINEDQMIEKQNLNLVISRDGYIKTVSKKSFESSKYDELGLKTNDIL
FYHNIINSHDKILIITSKAKLINLVAHKITSMRWKDVGEHLNNYVKFDANEKVIAVYIWN
EQFKIDEYQLVLASRLNLIKRIELSELDINKNSKQISIMKLNDNDNLISANLIKKGHNQF
IIAISKLGLALLFLVHEINCLNRLAKGIKIMKLKPNDEVSAILITPNNGYNVQLFLERGS
KCFNISELKLSKRATTPTNLYPITKKVQNVLAAFLVAHENVFYLLDQQQKINPYYLSNPK
PTKLDTKISIYENDQMITDVVKDCFLSDEAISDFKKINMYANEFDNEMLKINKNHDDSQL
ELIDEEEEKN
NT seq 2553 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagtgataatcatcaaaaaattattaatacacctttagacaacattgttggtgaaagt
tatgcaaaatatgcaaaatacattattcaagatcgtgctttacctgatattcgtgatggt
ttaaaacctgttcaacgtcgaattttatacgcaatgagtgaattaggaatcttttatgat
aaaccttataaaaaatctgcacgtacagtaggagaagtaattggtaaatatcatccacac
ggagattcatcaatttatgaagcaatggtgagaatgagtcaagattgaaaaaataatcta
tgtttattagatatgcatggtaataaaggttcaattgatggtgataatgctgctgcaatg
cgttatacagaagcccgattatcaaaaattgctagtgtaatgttagctaacttaaaaaaa
gatgttgttaaatttagtccaaattttgatgatagtgaaaaagagccatcaatattacca
tctctttttcctaatttattaatcaatggagcgacaggaattgcttctggttatgcaaca
aatattcctcctcataaccctaatgaagtctttgatgctttaatttatcgtattgatcat
ccagattgtagtgtagaaaaactaattaaaatctgtcctgcgccagattttcctacaggt
ggggaaatccacgatttaaatggatgtgctaatgctcacaaaactggtgaaggtaaattt
ataattcgtgcttgcattgattttaaaatcaatgataataagattaatcaaattattatt
agttcaatcccttatgaaacaaacaaggctttaatcattaaagaaattgaagatattatt
tataataaagaagttgctggattaatcgaagttcgtgatgaatctgatgctaagggaatt
agtataattattgatactaaaaaagatattaatttagaaaatgttaaaaactatttatat
aaaaaaaccaacttggaaatcagctataatacaaaatttattgcaattgttcaccgaact
cctacacttgtaaatctatctacatatttagatgctcaaattaatcatagtttagatgta
attaataaagtcgatttatatgatctaaacaaaattttgttacgtattgaaattgttgaa
ggcttaattaaatgcgttgatttaattgatgaaattattaaaattattcgtgctagtgaa
tcgcgccaagacgcaaaaaatactttaattcaagtttttaattttacaaataatcaagct
gaagcgattattatgatgcgtttgcataatttgacacgtactgatatatttgatttaaaa
aatgaatgacaatcgctacaagacgaagctaaaacgctacaagaacgaataaattcactt
caagttcgcaagaattatttaaaacaaaaaatgattgaatttaaaaaaacttttggtttc
gaacgcaaaacaaaattatttgatgaattagtaaaagttgaaataaacgaagatcaaatg
atcgaaaaacaaaatttgaatttagtaataagtcgtgatggatacattaaaactgtttct
aaaaagtcatttgaatcatctaaatatgatgaattaggattaaaaactaatgatattctt
ttttatcataatatcattaattctcatgataaaatcttaatcattacatcaaaagctaaa
ttaattaatttagttgctcataaaatcacttctatgcggtgaaaagatgttggtgaacac
ttaaacaattatgtaaaatttgatgctaatgaaaaagttatagctgtttatatatggaac
gaacaatttaaaattgatgaatatcaattagttttggcttctagattaaatctaattaaa
agaattgaattaagcgagttggatataaataaaaatagtaaacaaattagcattatgaaa
ttaaatgataatgataatttaatcagtgctaatttaatcaaaaaaggtcataatcaattt
attattgcaatttctaaattaggattagccctgctatttttagttcatgaaattaattgc
ttaaatcgtttagctaaaggaattaaaattatgaaattaaaaccaaatgatgaggttagt
gctattttaattactcctaataatggttataatgttcaactttttttagaacggggaagt
aagtgttttaatattagtgaattaaaattatcaaaacgtgcaactacaccaacaaattta
tatccaataacaaaaaaagtgcaaaatgttttagcagcttttttagttgctcatgaaaat
gttttttatcttttagatcaacaacaaaaaataaatccatattacttatcaaaccccaaa
ccaacaaaactagatactaaaattagtatctatgaaaacgatcaaatgatcactgatgta
gttaaagattgctttttaagtgatgaagcaattagtgattttaaaaaaattaatatgtac
gcaaatgaatttgataatgaaatgctaaaaattaataaaaatcacgatgattcacaatta
gaattaattgatgaagaggaagaaaagaattaa

DBGET integrated database retrieval system