Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970: UU377
Help
Entry
UU377 CDS
T00040
Symbol
polC
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha chain 1
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
uur
Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970
Pathway
uur03030
DNA replication
uur03430
Mismatch repair
uur03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
uur00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
UU377 (polC)
03430 Mismatch repair
UU377 (polC)
03440 Homologous recombination
UU377 (polC)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
uur03032
]
UU377 (polC)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
uur03400
]
UU377 (polC)
Enzymes [BR:
uur01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
UU377 (polC)
DNA replication proteins [BR:
uur03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
UU377 (polC)
DNA repair and recombination proteins [BR:
uur03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
UU377 (polC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
RNase_H_2
HHH_3
KH_Mug60-KHD4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAF30786
UniProt:
Q9PQB4
LinkDB
All DBs
Position
430144..434472
Genome browser
AA seq
1442 aa
AA seq
DB search
METKNALFKKIVKISDQLLNKISIKKLTKDKKNNLFVYFDEFVDVTIIDELHQLSKTTLM
HDLQIWYINNLKEVDHKKILTFFKKISEQNANLIFLEQINDLNTKIEYNSNLNSLILKIN
DKLIYDHFIANKLEILNILKVWSLPYSNFEIHFENLSSLLNEKHEQAVNEIISHHIQQQK
HLEQQISQQQNFYNNQKANFNYYKNPSNKTITKLIDINPLMNNAKIRAYVFLKKIDILKS
GAIAYKLNVIDDSETLTIMTYLPSGEHPLKKFLDELKIDQLIEAEIDIVLDNMSKSGQVP
IGKIKKICCVEDKHVKKQITPRLELNFHTKMSSLDAIISTQELIDFAVKNQLKTIGITDR
NVVQAYPEIAKFSKKQDLKIIYGLETEELEDQIPLVLNVRDQNLDNATYVIFDIETTGLF
PNFDEIIEFGAVIMQNNKQIGEKIQFFIKPIQQINENVTNLTNISQEMVNNAIDEKTALL
KIKEIFDDHILVAHNGINFDINFINQRLLKWGLEPLKNPSIDTLMISRAINPFKSHRLGA
ICKKYEVDYNDESAHRADYDAIVLADVFKVMKNNLFNDFGITNLSEINTKLQTTMLKNRS
FGNWINLYIKNQANVKDMYELVSISHTDMYYTRPTITTSFLANKKDKLIISNSIHESDLI
NALYSKNDEEIKRLIQRYDFITLPSLGSQKHLVYAKKITIENVQKAFKKLIYLALELNKI
IIYSSSPYYFFKDDKKFYDVYVNTKGLEGKAHRFANEVYVPDLEYIDQKNAIDELAYLED
EKLINLIINENPVHINSWFDDSIQPLKEGLYAPKMEGVDQKTIDYVYHTAKKIYGENLPT
IVEQRIKKELNSIIKHGFSVVYWISHLLVEKSMQDGYGVGSRGSVGSSLVATFLNITDVN
PLTPHYLCPNCKKCEFITNADDGFDLAPKSCEQCQTPMLTDGHNIPFETFLGFDGDKVPD
IDLNFSGVYQAVAHNFIKSIFGETHSYRAGTIGTMAQTSAENTVKKYFENRFNENKIIRD
STVSLYVQKCIDSKRTTGQHPGGIIIVPKEYSIWDFSPYNFPANDINETWKTTHFAFEYL
HDSLLKFDILGHDNPTILKLLKDYTGIDERDVPMYDPLVMKSFSDISALNIKPSDVLNET
TGAISIPEFGTRFVRGMLVDTKPKSFADLIRISGLSHGESVWLGNAQSLIKSGKLLKDVI
ACRDDIMTYLIRQNVEPKTAFLIMEDVRKGKKIKPEHQIILKELKVPEWYIESANKIKYM
FPKAHATAYVMHAWKFAWYKIYYPLEYYAAFFSVRADNFDLFVINQGKEFIEKTYNDIEQ
RSKSRDPQKKVSSRELALQPIYEIVIELLARGFKISNISIEQSQATSYVIDKENNAIIPP
FIAIQGLGETVANSIIEARNQKVFSTIEDLKNRTKISRTDLKNLRVLGVLDHLSETEQLT
LF
NT seq
4329 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaacaaagaatgcattatttaaaaagattgtaaaaatttctgatcaattattaaat
aaaattagtatcaaaaaattaactaaagataaaaaaaataatttatttgtttattttgac
gaatttgttgatgtaacaattattgatgaattacatcaattatcaaaaacaacattaatg
catgatttacaaatttgatatattaataatttaaaagaagttgatcataaaaaaatatta
actttttttaaaaaaattagtgaacaaaatgctaatttaatctttttagaacaaataaat
gatttaaatacaaaaatagaatataactctaatttaaattcattaattttaaaaattaat
gataaattaatttatgatcattttatagcaaataaattagaaattttaaacatcttaaaa
gtttgatcactaccttatagtaattttgaaattcattttgaaaatcttagttcattatta
aatgaaaagcatgaacaagcagtaaatgaaattattagtcatcatattcaacaacaaaaa
catttagaacaacaaattagtcagcagcaaaatttttataataatcaaaaggcaaatttt
aattattataaaaatccttcaaataaaacaattacaaaattaattgatattaatccttta
atgaataatgcaaaaattcgagcttatgtttttttaaaaaagattgatatattaaaaagt
ggagcaatagcttataaactaaatgttattgatgatagtgaaaccttaacaattatgact
tatttaccaagcggtgaacatcctttaaaaaagtttttagatgaactgaaaattgatcaa
ttaatcgaggctgaaattgatattgttttagataatatgagtaagagtggtcaagttcct
attggtaaaattaaaaaaatttgttgcgttgaagataaacatgtaaaaaaacaaatcaca
cctcgtttagaactaaattttcatacaaaaatgtcatcacttgatgcaattatttcgaca
caagaattaattgattttgcggttaagaatcaattaaaaacaattggcatcactgatcga
aatgttgtacaagcatatcctgaaatcgctaaattttctaaaaaacaagatttaaaaatt
atttatggtttagaaacagaagaattagaagatcaaatcccattagttttaaatgttcgg
gatcaaaatttagataatgctacatatgttatttttgatattgaaacaacaggattattt
cctaattttgatgaaattattgaatttggggccgtgattatgcaaaataataagcaaatt
ggggaaaaaattcaattttttataaaacctattcaacaaattaatgagaatgttactaat
ctaactaatattagtcaagaaatggtcaataatgcaattgatgaaaaaacagcattatta
aaaattaaagaaatttttgatgaccatattttagttgcacataatggaattaattttgat
attaattttattaatcagagactgttaaaatgaggattagaacctcttaaaaatcctagt
attgatacattaatgatatcacgagcaataaatccatttaaaagtcatcgattaggagcg
atttgtaaaaaatatgaagttgattataatgatgaaagtgcacaccgtgcagactatgat
gccatagttttagctgatgtttttaaagttatgaaaaataacttatttaatgattttgga
attactaatttaagtgaaattaatactaaattacaaacaacaatgttaaaaaatcgtagt
tttggtaattgaattaatctttatattaaaaatcaagcaaatgttaaagatatgtatgaa
ttagtgtctatatctcatactgatatgtattatacaagaccaacaattacgacaagcttt
ttagcaaataaaaaagataaattaattatttctaactcgattcacgaatcagatttaatc
aatgctttatattcaaaaaacgatgaagaaattaaaaggttaattcaacgttatgatttt
ataacattaccatcattaggttcacaaaaacacttagtatatgctaaaaaaattacaatt
gaaaatgtacaaaaagcttttaaaaaattgatctatttagctttagaattaaacaagatt
attatttattcaagctcgccttattatttctttaaagatgataaaaaattttatgatgtt
tatgttaatacgaaaggtctcgaaggtaaagcacaccgatttgctaatgaagtttatgtt
cctgatttagaatatattgatcaaaaaaatgccattgatgaattagcttatttagaagat
gaaaagttaattaacttgattattaatgagaatcctgtgcatattaatagttgatttgat
gatagcatacaacctttaaaagaaggattgtatgctccaaaaatggaaggtgttgatcaa
aaaacaatcgattatgtttatcatactgctaaaaaaatatatggagagaatttaccaaca
attgttgaacagcgcattaaaaaagaattaaattcaattattaaacatggttttagtgtt
gtttattgaatttcacatttattagtagaaaaatcaatgcaagatggttatggtgttggt
agtcgtggttcggttggctcatcacttgtcgcaacgtttttaaatattactgacgttaat
ccgcttacaccacattatttatgtcctaattgtaaaaaatgtgaatttataacaaacgct
gatgatggatttgatttagctcctaaaagttgtgagcagtgtcaaactccaatgttaact
gatggacataatattccttttgaaacttttttaggttttgatggggataaagtaccagat
attgatcttaatttttctggagtttatcaagcagttgcacataattttattaaaagtatt
tttggagaaacacattcttatcgtgctggtacaattggtactatggcccaaacaagcgct
gaaaatacggttaagaagtattttgaaaaccgttttaatgaaaataaaattattcgtgat
tcaacggttagtttatatgtacaaaagtgcattgattctaaacgcacaactggtcaacat
cctgggggtattattattgttcctaaagaatatagtatttgggatttttcaccttataat
tttccagctaatgatattaatgaaacttgaaaaacaactcattttgcgtttgaatatcta
catgatagtttattaaaatttgatattttaggacatgataatccaacaattttaaaactt
ttaaaagattatacggggattgatgaacgtgatgtaccaatgtatgatccattagttatg
aaatcatttagcgatattagtgcgctaaatattaaaccgtctgatgttttaaatgaaaca
acaggagcaatttctattcctgaatttgggacacgctttgtacgtggtatgctagtggat
actaaaccaaaatcatttgctgacttaattcgtatttcaggattatcacatggagaaagt
gtttgattaggaaatgcacagtcattaattaaatctggtaaattgctaaaggatgttatt
gcttgtcgtgatgatattatgacatatttaattcgtcaaaatgttgaaccaaaaactgcc
tttttaattatggaagatgttagaaaaggtaaaaagatcaaaccagaacaccaaatcatt
ttaaaagaattaaaggttcctgaatgatacattgaatcagctaataaaattaaatatatg
tttcccaaagcacatgccacagcttatgttatgcatgcatgaaaatttgcttgatataaa
atttattatccactagaatactatgcagcattttttagtgttcgtgctgataattttgat
ttatttgtaattaatcaaggtaaagaatttattgaaaaaacttataatgatatcgaacaa
cgttctaaatcacgcgatccacaaaaaaaagttagttcacgtgaacttgctttacaacca
atttatgaaattgtgattgaattattagctcgaggttttaaaatttcaaatattagtatt
gaacaatcacaggcgactagttatgtaattgataaagaaaacaatgctattattccacca
tttattgcgattcaaggattgggtgaaacagtagctaattcaatcattgaagctcgtaat
caaaaagttttttcaacaattgaggatttaaaaaaccgtacaaaaatttcgcgtacagat
ttaaaaaatttacgagtattaggcgttttagatcatttaagtgaaactgaacaactaaca
ttattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
