Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970: UU415
Help
Entry
UU415 CDS
T00040
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III alpha chain 2
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
uur
Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970
Pathway
uur03030
DNA replication
uur03430
Mismatch repair
uur03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
uur00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
UU415 (dnaE)
03430 Mismatch repair
UU415 (dnaE)
03440 Homologous recombination
UU415 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
uur03032
]
UU415 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
uur03400
]
UU415 (dnaE)
Enzymes [BR:
uur01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
UU415 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
uur03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
UU415 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
uur03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
UU415 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
PHP
HHH_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAF30826
UniProt:
Q9PQ74
LinkDB
All DBs
Position
complement(477991..480900)
Genome browser
AA seq
969 aa
AA seq
DB search
MFINLNVHSHYSLLNSTLSIDDLIKYALDNKQPYVCLTDLNNMYGCIEFYDKAKAHNLTP
IIGLEFEYQNATLVAYAKNYNGYLKLIKWSSWIMTSKEFEIQDDFDDLIIVCKKGTIVFK
SPNFYQTHDQNAPNAIALQSVFYANKNDKIVFLAMLAIKNDLKLEDFKNCCDFDNNHFLN
DNLAQSFFSPIALNNLNKVLNELKVQIHDLPINIPVYDKQNSIISSEILKQLCISGLKKR
LNANDGQVNKIYVQRLKYELDVINEKQFDDYFLIVYDFINFAKSNGIIVGPGRGSAAGSL
VAYCLHITDIDPIKHNLIFERFLNPTRKSMPDIDTDIMDEKRDLVIEYLFEKYGNDHVAY
ILTFQRLKAKMAIRDVGRILGIDLKVIDKICKNIKPEYDEDLDLAIKKNTILKEMYLLHK
ELFEISKKLINAPRQIGTHAAGIILSDSLISNIIPIQLGINDRPLSQYSMEYLERFGLIK
MDLLGLKNLTIIDNVLKMIYENQNKKIDLFNINYNDKFVFEDLAKARTNGIFQLESPGMK
KVLLKVKPQNIEDISIVSALFRPGPQQNIKTFVERRFKREEFSYWNEATRKILEPTYGII
VYQEQVIELVKTIANFDIATSDNFRRAISKKDEKILIQLKDDFINGALNNNYKQPLVNQI
FEYIFSFAHYGFNHSHSLAYSYISYWLAYLKHYYTLEFLSVLLSHTSASKDKLLSYLNEA
KEFNISIKGPDIQYFSNDFVIDTQKQIIRFGFKTIKGFGDELLKKIKSALQKSTLSDYIS
YIDALKKGNVSLKNIEILIRVGTFDSFGINRLFLLNNLNEIFEKTGLNGHFFDLNLVGLD
YAKDMSVNDRYLDDEIQYLGIDLNSLNYANYKTEIDYNKLKYTIKDFYEINTNYETNILA
QVLNIKQSKTKNGNDIFYLETLIDNKKQTLTIFQNSKYLIDEISIGGIYVFGVKLLNHFN
FIVNIKQRI
NT seq
2910 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttattaatttaaatgtgcattcacattattctttacttaatagtactttaagtatt
gatgatttaattaaatacgcattagataacaaacaaccatacgtttgcttaactgattta
aataatatgtatggctgtatcgaattttatgataaagcaaaagcacataatttaactcct
attatcggattagaatttgaatatcaaaatgctactttagtagcttatgctaaaaattat
aatggctatttaaaattaatcaaatgatcatcttgaattatgacaagtaaagaatttgaa
attcaagatgattttgatgacttaattattgtttgtaaaaaaggaactatagtttttaag
agtcctaatttttatcaaacgcatgatcaaaatgctcctaatgcgattgcattacaaagt
gttttctatgctaacaaaaatgataaaattgtttttttagcaatgttagcaatcaaaaat
gatttaaagttagaagattttaaaaattgttgcgattttgataataatcattttctaaat
gataatctagcacaatcatttttttcaccaattgctttaaataatttaaataaagtttta
aatgaattaaaagtacaaattcatgatttaccaattaatattccggtttatgataaacaa
aattcaattatttcaagtgaaattttaaaacaattatgtattagcggattaaaaaaacgc
ttaaatgctaacgatggccaagttaataaaatttatgttcaaagattaaaatatgaatta
gatgttattaatgaaaaacaatttgatgattattttttaattgtttatgattttattaat
tttgctaaaagtaatggtatcattgtagggccaggacgtgggagtgctgctggttcgtta
gtagcttattgtttacatattacagatattgatcctattaaacataatttaatttttgaa
cgttttttaaatcctaccagaaaaagtatgccagatattgatactgatattatggatgaa
aaacgcgatctagttattgaatatttatttgaaaaatatggcaatgatcatgttgcttac
attttaacgtttcaacgtttaaaagcgaagatggctattcgagatgtagggcggattttg
ggaattgatttaaaagtaattgataaaatttgtaaaaatattaaacctgaatatgatgaa
gatcttgatttagcaattaaaaaaaatacgattttaaaagaaatgtatcttttgcataaa
gagttgtttgaaatttctaaaaaattaattaatgctcctcgccaaataggcacacacgct
gcagggataattttaagtgatagtttaatttcaaatattattccaattcaactaggtatt
aatgaccgtcctttatcacaatattcaatggaatatttagagcgttttggtttaattaaa
atggatttattaggtttgaaaaatttaacaattattgataatgttttaaaaatgatttat
gaaaatcaaaataaaaaaattgatctctttaacattaactataatgataaatttgtcttt
gaagatttagctaaagcaaggacaaacggaatatttcaactagaatcgcccggaatgaaa
aaagtactattaaaggtcaaacctcagaatattgaagatatttctattgtttcagctctt
tttcgtcctggtccacaacaaaatattaaaacatttgttgaacgtcgttttaaacgtgaa
gagtttagttattgaaacgaagccacaaggaaaattttagaaccaacttatggaattatt
gtttatcaagagcaagtgattgaattagttaaaactattgcaaattttgatattgctact
tccgataattttcgccgtgcaatatcaaaaaaagatgaaaaaattttaatccaattaaaa
gatgattttatcaatggtgctttgaataataattataaacaaccattggttaatcaaatt
tttgaatatattttttcgtttgcacattatggttttaaccattcacattcactagcatat
tcatatattagttattgattagcgtatttaaaacattattatacattagaatttttaagt
gtattattatcacatactagtgcatcaaaagataaattattatcatacttaaatgaagca
aaagaatttaatattagtatcaagggccctgatattcaatattttagtaatgattttgtt
attgatactcaaaaacaaataattcgttttggtttcaaaacaattaagggttttggtgat
gaattacttaaaaaaatcaaatctgctctgcaaaaatcaactttaagcgattatatttca
tacattgatgctttaaaaaaaggcaatgttagtttaaaaaacattgaaattttgatacga
gtcggcacttttgatagttttggaattaatcgtttatttttattaaataatttgaatgaa
atttttgaaaaaacaggattgaatggtcatttttttgatttaaatttagtgggtttagat
tatgcaaaagatatgagtgttaatgatcgttatttagatgatgaaattcagtatttagga
attgatttgaatagtttaaattacgcaaattataaaactgaaattgattataataaacta
aaatatacaattaaagacttttatgaaataaacacaaattatgaaacaaacattcttgca
caagttttaaacattaagcaatcaaaaactaaaaacgggaatgatatcttttatttagaa
acactaattgataataaaaaacaaacactaacaatttttcaaaatagtaaatatttaatt
gatgaaattagtattggaggtatttatgtttttggagttaaattattaaatcattttaat
tttattgtaaatattaagcaaaggatttag
DBGET
integrated database retrieval system
