Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970: UU501
Help
Entry
UU501 CDS
T00040
Symbol
uvrD
Name
(GenBank) DNA helicase II
KO
K03657
ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA [EC:
5.6.2.4
]
Organism
uur
Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970
Pathway
uur03420
Nucleotide excision repair
uur03430
Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
uur00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03420 Nucleotide excision repair
UU501 (uvrD)
03430 Mismatch repair
UU501 (uvrD)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
uur03400
]
UU501 (uvrD)
Enzymes [BR:
uur01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.4 DNA 3'-5' helicase
UU501 (uvrD)
DNA repair and recombination proteins [BR:
uur03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
GGR (global genome repair) factors
UU501 (uvrD)
MMR (mismatch excision repair)
Other MMR factors
UU501 (uvrD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
AAA_30
AAA_11
Viral_helicase1
AAA_12
PcrA_UvrD_tudor
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAF30913
UniProt:
Q9PPY9
LinkDB
All DBs
Position
complement(617250..619481)
Genome browser
AA seq
743 aa
AA seq
DB search
MGLGIDYSRLNQEQKEAVTADLGPQLVIAGAGTGKTSVLTLRIAYLITEKNIHPSRILGF
TFTNKAADEMKERVGKTIGVSIPYLSTFHSMCVKILQQDIHYLNYHNNIKIIDTDDQEVL
LKEIFDQLNIEKKSQVIKKIIKTISKVKNKFFDQNDMLNEKNHKYLELVDLNDAQRLVDI
YKIYCDRCFKLNYVDFDDLINLTHKLFIEFPEVLEKWQNKFDYILVDEFQDTNKIQYDLI
SLLATKHQNLFVVGDPDQMIYSFRGAEQWIINNFSQNFKNTKVTILKTNYRSTQPILNTA
NRLIDANNNNYKKNLTAFNTNDNNLPIYLRGQNPIDEANWIARKIRELLEEGTPANQIAV
LFRSNHYSRTIEQSMMRESIPYTILGSKKFYERAEIKDMIAYLKVVNDLDELSFLRIINT
PRRAIGPTTFEHVKHYAINNNLFLFEALAEVEKNHLINNTQKKNILNFVNLIKEIRDEME
DLKIHEILELIYKKVNYEAYLLENEKAEDKIDNVYELKRAMKMYVDRHPDDTINDYLNSI
ALYLNKDGKDSKENVLLMTVHNSKGLEYENVFVAGMNEGLLPSDRAINDDPIKGVEEERR
IAYVALTRAKKNLYISSACCYDPLARRQVFESRFINEIGFNNLKIINSSFKNNKPEDMPL
KSFLKQQEERSWFDSKQKQKEVEDNFYQTMKNDFEIGERIVHTSFGDGVIIGIDGDILTI
AFSKYRQPKQINFNHKTIVRRIG
NT seq
2232 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggattaggaattgattattcacgcttaaatcaagaacaaaaagaagcagttacagca
gacttaggaccgcaattagtaattgcaggggcagggacaggaaaaacatctgttttaact
ttacgtattgcttatttaattactgaaaaaaatattcatccatcacggattttaggtttt
acttttactaataaggctgctgatgaaatgaaagaacgtgttggaaaaacaattggcgtt
tctattccttatttaagtacttttcattcaatgtgtgtaaaaattttacaacaagatatt
cattatttaaattatcataacaatattaaaattattgatacagacgatcaagaagttttg
cttaaagaaatttttgatcaattaaacattgaaaaaaaatcgcaagttattaagaaaata
attaaaacgattagtaaagttaaaaataaattttttgatcaaaacgatatgctaaatgaa
aaaaatcacaagtatttagaattggttgatttaaatgatgcacaaagattagttgatatt
tataagatttattgtgatcgatgttttaaattaaattatgttgattttgatgatttgatc
aatttaactcataagttatttattgagtttccagaagttttagaaaaatgacaaaataaa
tttgattatattcttgttgatgaatttcaagatactaataaaattcaatatgatttaatt
agtttattagcaactaaacatcaaaatttatttgtggttggcgaccctgatcaaatgatt
tattcatttagaggtgctgaacaatgaattattaataattttagtcaaaattttaagaat
acaaaagtaacaattttaaaaacaaattatcgttcaactcagccaattttaaatacagct
aatagattaatcgatgctaataacaacaattataaaaaaaatttaactgcttttaatact
aatgacaataatttaccaatttatttacgagggcaaaacccaattgatgaagctaattga
attgctagaaaaattagagaattgttagaagaaggaacgccagctaaccaaatcgctgtt
ttgttccgaagcaatcactattctcgtacgattgaacaatcaatgatgcgcgagagcatt
ccttatacaattcttggcagtaaaaagttttatgaacgtgctgaaattaaggacatgatt
gcttatttaaaagtagttaatgatttagatgaactatcttttttaaggattattaataca
ccacgtcgtgcgattggtccaactacttttgaacatgttaaacattatgcaataaataat
aatttatttttatttgaagcattagctgaagttgaaaaaaaccatttaataaataacaca
caaaaaaagaatattttaaattttgttaatttaattaaagaaatccgtgatgaaatggaa
gatttaaaaattcatgagattttagaattaatttacaaaaaagttaactatgaagcttat
ttattagaaaacgaaaaagcagaagataaaatcgataatgtttatgaattaaaacgcgct
atgaaaatgtatgttgatcgtcatccagatgacacgattaatgattatttaaattcgatt
gctttatatttgaataaggatggtaaagatagtaaagaaaatgttttattaatgacagtt
cataattctaaaggtctagaatatgaaaacgttttcgttgctggtatgaacgaaggactt
cttccttctgatcgagcaattaatgatgatccaattaaaggagttgaagaagaacgaaga
attgcttatgtagccttaacacgagcaaaaaaaaatctttatatttcatctgcttgttgt
tatgatccattagcaagaagacaagtatttgaaagtcgttttattaatgaaattggtttt
aataatttaaagattataaatagtagttttaaaaataataaaccagaggatatgccatta
aaatcattcttaaaacaacaagaagaacgttcatggttcgattcaaaacaaaaacaaaaa
gaagttgaagataatttttatcaaacaatgaaaaacgattttgaaattggtgaaagaatt
gttcacacaagttttggtgatggtgttattattggaattgatggtgatatcttaacaatt
gctttcagtaaatatcgtcaaccaaaacaaattaattttaatcataaaacaatcgtaaga
agaataggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
