Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970: UU570
Help
Entry
UU570 CDS
T00040
Name
(GenBank) conserved hypothetical
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
uur
Ureaplasma parvum serovar 3 ATCC 700970
Pathway
uur03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
uur00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
UU570
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
uur03019
]
UU570
Messenger RNA biogenesis [BR:
uur03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
UU570
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
RNase_J_C
Lactamase_B
RMMBL
Lactamase_B_2
ODP
Card1_endonuc
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAF30984
UniProt:
Q9PPR9
LinkDB
All DBs
Position
complement(709862..711652)
Genome browser
AA seq
596 aa
AA seq
DB search
MENTKKSPTYVYALGGLEEIGKNTYVVEHEDEIILIDAGIKFANASLPGFDGTVANFDYL
IKNNHKIHSLVVTHGHEDHIGGIPHILRHVKIKTIYAPTLAAKLIERRLSEYKDIKPPRI
IVFEDESMYKTKYFEVDFYRVCHSIPDSFGICVKTPNGYIVTTGDFRFDFATAGDETNLA
KISQISNRGISVLMCESTSAEIPGFSESERYVIDNIRDYMVNIKGRTFISTFASNLGRVE
EIIAIAVGLNKKICIIGKSMEANIKTSRKLGYLNVPESSFITHKELPFYKDHEIVVILTG
SQGEKMAALNVMANNNHSKITLKPSDTIILSSNPIPGNYAQVEAMVNKLYKLGLTVYENS
PNKKIHASGHATRSEHQLMIKAINPSYLFPIHGEYKMFRALKQNAVDQGFDKDHVIIAPN
GQKLQLLDGVLSHTNIYVDAEPKFINGYEISSKISKLLSERVVLSSDGILNLVLNADFKK
AKLNSAVSISTRGCFFAKESTNLINKISNVAKSSLEEALAKKEFDEKKLKEIVSGNVKSI
VWKWRKKNPIINVTIINNDLVEQFRKDNNYVEFIKQAEVEEIEQEVDIDDLISNGL
NT seq
1791 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaataccaaaaaaagtcctacatatgtttatgctttaggggggctagaagaaatt
ggtaaaaacacttatgttgttgaacatgaagatgaaattattttaattgatgcgggcatt
aaatttgctaatgcatctttaccaggatttgatggaactgttgccaattttgattattta
ataaaaaacaatcataaaattcattcattagtagttactcatggtcatgaagaccatatt
ggggggattcctcacattttgcgacatgttaaaattaagactatctatgcaccaacatta
gcagcaaaattaattgaacgtcgtttaagtgaatataaagatattaaacctccgcgtatt
attgtctttgaagatgagtcaatgtataaaacaaaatattttgaagttgatttttatcgt
gtttgtcattcaattcctgattcatttggaatttgtgtaaaaacaccaaacggatacatt
gtaacaactggtgattttagatttgattttgctacagctggtgatgagactaatttagct
aagatttcacaaatttctaatcgtggaatctcagtattaatgtgcgaatcaacaagtgct
gaaattcctggatttagtgaaagtgaacgatatgttattgataacattcgtgattatatg
gtaaatattaaaggacgaacttttatttcaacatttgcttctaatttaggtcgtgttgaa
gaaattattgctatagctgttggtttaaataaaaaaatctgtatcattggtaaatcaatg
gaagctaatattaaaacaagtcgaaaattgggttatttaaatgttcctgaatcttcattt
atcacacataaagaattgccattttataaagatcatgaaattgttgtaattttaactggt
tcacaaggtgaaaaaatggcggctttaaatgttatggctaataataaccactcaaaaatt
actttaaaaccatcagatacaattatcttatcatcaaatccaatcccaggaaactatgct
caagtcgaagcaatggttaataaactttataaactcggattaacagtttatgaaaattca
cctaacaaaaagattcatgcttctggtcatgccacacggagtgaacaccaattaatgatt
aaagcaattaatccatcatatttatttccaatccatggggaatataaaatgtttcgtgct
ttaaaacaaaatgctgttgaccaaggttttgataaagaccatgtcattattgcaccaaat
ggccaaaaattacaattattagatggtgttttaagtcatactaatatttatgttgatgct
gaacctaaatttattaatggttatgaaattagttctaaaattagtaaattattaagtgaa
cgtgttgttttatccagtgatggtattttaaatctagttttaaatgctgattttaaaaaa
gctaagttaaactctgctgtaagtatttcaacacgaggatgtttttttgccaaagaatca
actaatttaattaataaaatttctaatgtagcaaaatcaagtttagaagaagcgttggca
aaaaaagaatttgatgaaaaaaaactaaaagaaatagttagtggaaatgttaaatcaatt
gtttgaaaatgacgtaagaaaaatccaattattaatgtcacaattattaataatgatttg
gtcgaacagtttagaaaagacaataattatgttgaatttatcaaacaagctgaagttgaa
gaaattgaacaagaagttgatattgatgatttaatttcaaacggtttataa
DBGET
integrated database retrieval system
