Vibrio alfacsensis: D1115_13595
Help
Entry
D1115_13595 CDS
T05841
Name
(GenBank) TRAP transporter fused permease subunit
Organism
vaf
Vibrio alfacsensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DctM
DUF3394
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXY02017
LinkDB
All DBs
Position
I:2807208..2809787
Genome browser
AA seq
859 aa
AA seq
DB search
MSTNNTPSQDVQEMVAQSDTGARRPVGLQGRILWFVPLCWSLFQLWYASPLPFIFNFGVL
NDTEARAIHLTFATFLAFTAYPAMKNSPRDHIPLIDWILALAGSFAAAYIYIFYTELAGR
SGAPTTVDIVVSVTGMALLLEATRRALGPPLMVVAAVFLLYTFAGPHMPDVIAHKGASLN
KAMSHLWLTTEGVFGVALGVSTSFVFLFVLFGAMLERAGAGAYFIKVAFSLLGHMKGGPA
KAAVVASGLSGLVSGSSIANVVTTGTFTIPLMKRVGFPGTKAGAVEVAASTNGQLTPPIM
GAAAFLMVEYVGISYVEVIKAALLPALISYIALIYIVHLEACKAGMTGLPRRHNPTLVQS
LLSFTGTILGLCVISALVYYGVGWTKDVFGAAATPIVTIALLIAYVGLVKISANHIKDGA
IEIDAELTEVPDPGPTIKSGLHYLLPIVVLVWCLTVERFSPGLSAFWATVFMIFILLTQR
PLIALLSKQGDLVEQTKDGFIDLAESLVSGARNMIGIGVATAAAGTVVGVVTLTGIGLVM
TDFVEFISGGSLILMLVFTAVISLILGMGLPTTANYIVVSTLMAPVIVTLGAAHGLIIPL
IAVHLFVFYFGILADDTPPVGLAAFAAAAIAKSDPIRTGIQGFTYDIRTAILPFMFVFNT
QLLMMGIDSWWHLALTVISSIIAMLIFSAATQGWWFTKNKWWETILLLILTFSFLRPGYW
WDMLYPAKVLSPGVEIAQITEGLNVGESIELRVAGENLEGNYVEKTVRLPFEDNATSAED
RIASMGLMLTENDGKMIVDMVEFGSPAESSGIDFDWEIKSVIQNAERPMKEWVFVPSLLI
LLVLAMNQKRRARNEQLSA
NT seq
2580 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgacgaataatactccgtcacaagatgtgcaagagatggtagctcagtcagacaca
ggagcacgccgcccagtaggcttacaaggccgaattttatggtttgttcccctctgctgg
tcactatttcaattgtggtatgcctctccgctaccatttattttcaattttggcgtattg
aacgacacggaagcacgagcgattcatctcacttttgccacttttcttgctttcacggct
tacccagcaatgaagaactctccgcgtgaccatattcctcttatcgattggatattggcg
cttgccggaagttttgctgctgcctacatttatattttttacactgaactcgctggtcgc
tcaggcgcaccaaccaccgttgatatcgtcgtctcggttacggggatggctttattgctt
gaagcaacccgacgcgctcttgggccaccattaatggtcgttgctgctgttttcctgctt
tacacttttgcaggaccacacatgcccgacgtcatagcacataaaggggcaagcctgaat
aaagctatgtcgcatttatggttgactaccgagggggtattcggcgtcgcactgggtgta
tcgacttctttcgtcttcttattcgtcttgtttggtgccatgttagagcgagcaggcgct
ggcgcttattttataaaagttgcgttttcgctacttggtcatatgaaaggtgggccagca
aaagcggcggttgtggcttctggcttgtcagggctggtatcaggatcttctatcgccaac
gtcgttaccacagggacctttaccattcctttgatgaagcgagtaggcttccctggaacc
aaagcaggcgcggtagaagtcgcagcgtcaaccaatggccaattaacgccacctatcatg
ggggcggcagcattcctaatggtggaatacgtaggcatttcatatgttgaagtcatcaaa
gccgccctacttccagcgcttatttcttacatcgcactcatttacattgttcaccttgaa
gcctgtaaagcaggtatgactgggctaccgcgccgtcataatcctaccttggtgcaaagc
ttattgtcttttactggtacgattctcggtctgtgcgtcattagtgctcttgtctattac
ggggtgggttggaccaaagatgtatttggtgctgccgcaacgccaatagtgaccatcgcg
ttactgattgcttatgttggccttgtgaaaatatccgctaaccacatcaaagatggcgcg
attgaaattgatgccgagctgacagaagtgccagatccaggcccaacgattaaatcaggc
ctccattacctactaccgatcgtcgtgctggtttggtgtttgactgtcgagcgtttctct
ccggggttatctgcattctgggcaacggtatttatgatctttattttgctgactcagcgc
ccattgattgcattgctatcaaaacaaggtgacttggttgagcaaactaaagacggcttc
atcgacttagccgagagcttggtctctggtgctcgcaacatgatcggtatcggtgtagca
actgcggcggcaggtactgtggttggtgtggttacccttactggcatcggcctagtaatg
acggacttcgtggagttcatttccggtggtagcctaattttgatgttggtgtttaccgcc
gtgatcagtttgattttgggcatgggcctgccaaccacagcaaactatattgtggtatcc
acactaatggcacctgtgattgtgaccctaggggcggcacatggcttaatcattccattg
attgcagtgcatctatttgtgttttatttcggtatccttgccgatgatacaccgccagtt
ggcttagctgcttttgccgccgccgccattgcaaaatcagacccaattcgcaccggtatt
caaggttttacctacgatattcgtaccgctattttgccatttatgttcgtgttcaatact
cagctattaatgatggggattgattcatggtggcatctcgccttaaccgttatttcgtcc
atcattgccatgttgatcttctctgcagcaacacaaggttggtggtttacgaaaaacaaa
tggtgggaaaccattctattattaatattgacgttctcattcctacgtccgggatattgg
tgggacatgctctatccagcgaaagttctttcgcctggggttgagatagctcaaatcacc
gaggggttaaatgtaggagaatccattgagctacgtgttgcaggtgaaaatttggagggt
aattacgttgaaaaaaccgtacgccttccatttgaagacaacgcaacctcagcagaggat
cgtattgcctcaatgggcttaatgctgaccgaaaatgacggcaagatgatcgttgatatg
gtcgagtttggtagccctgcggagtcttctgggatcgattttgattgggagataaagtcc
gtcattcaaaatgccgagagaccaatgaaagagtgggtatttgtcccaagcttgttgata
ttgcttgtgcttgccatgaaccaaaaacgtcgtgctcgtaacgaacaactgagcgcataa
DBGET
integrated database retrieval system