Vibrio alfacsensis: D1115_13645
Help
Entry
D1115_13645 CDS
T05841
Name
(GenBank) translocation/assembly module TamB
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
vaf
Vibrio alfacsensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vaf00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vaf02000
]
D1115_13645
Transporters [BR:
vaf02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
D1115_13645
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
T2SSN
SCP2
DUF748
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXY02027
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2818466..2822230)
Genome browser
AA seq
1254 aa
AA seq
DB search
MIKMMLKWSKWFSLGLLSLLLLVTIFIATVLFTHPGLKLALWGAEKALPQLKVESIQGSL
FPRFELKGVSFVDESLNIDANVERLELAINFRCLTDPKVCVDELALEGVNFQMPELPPSD
APVEETPPLRSVSTPVPIFINNVSFNDIKLNILGNHIDWQAFSTALSMQGDRLVIAPTAL
KTINIALAPSEDTPKADTASKPKAESEPKDIVLPEVWIPLTVEAKRLDIHDFKLAGDTPV
VVHHLGLEAKAGGDQVEVKTLELDMPEVEGQLSTQVTLSADYPIQAQIDALIKQEDVKGQ
KLSLSASGSVGDLSIEATLSDRVKAKIDGQVQPLKSELPFDIHLKEVAAQWPLRGKSDYQ
VEVPNLTAKGSLNGYAVNLETKASGKDMPDVDVTLNGKGTLEQIDLDRLVVKTLGGELSG
KVMANWAAPINWQADLNLKNIQPGLQWQEAEGDISGSLSTSGSLTEQGGWQVNLPKLDID
GILRGYPLNIEGQLEASDKNGKGEDIQLNTQGLALSHGPNKLRAKGKIDKQIMMDVEVNF
PDFSKSVPDLSGKMNGAVALRGSLKQPDINVDLALNQLDWQQQAKVESITLKGDVMPLPA
PKADVSLIATNIAYDDVVIDRADLELSGDEKLHQLTLDVVSDIVSSSLEIEGTFKQKPEM
IWDGALRRLTLSTPQGPWTLQKSTSVKVNIDKQITDVQAHCWLQANSKVCLTENISVGKS
GEAKLAITNFDFDQIQQFLPQETKLQGSLNANAFAKWAPNIKPEVTLDVELPKGHVEQAL
EQPIKVGWDSVNLQAKLAEDKLNAKWLLDVTDNGDLSGQVELNDVSSDSPTIDGKVLLST
FNLDFLAPLIGEYSLFKASMNTDLTLSGDVMHPKVNGKFLIDQMKLQGEVTPIDINSGKV
AINFTGHQANLDAGIMTPDGKLEINGDADWRDLENWNTKARVFAKELKVDMPPMVRIKVE
PDMTIDVTPKLAKVTGNINLPWGRIFIDELPPSAVGVSRDTVILNQDMQPVDGEPALPFN
VETDINIKIGDEFQLSAFGLKGELQGNLNVTQKDKGPFIVGEVNIVDGSYRSFGQDLVIE
EGKIMMNGPADQPYVSIKAIRNPDNTQDDVTAGVRVTGPASDPTVEIFSDPAMPQANALS
YLLRGQDIDAESGGNAMTTTLIGLSLAKSGKVVGEIGEAFGVQDLQLDTAGSGDDSQVTV
SGYILPGLQVKYGVGIFSSLGEFTVRYRLMKDLYVEAVSGVDSAVDLLYQFEFD
NT seq
3765 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcaaaatgatgcttaagtggagcaaatggttctcgctaggtttactgagtctattg
ctgctagtaacgatctttattgcaacggtattgtttactcacccaggcctaaaattggca
ttgtggggagcagaaaaagcgctacctcaactgaaagtcgaatccattcaaggttcatta
tttcctcgttttgagctgaaaggggttagctttgtcgatgagtctttaaacattgatgcc
aacgttgaacgtttagagttagcgattaactttcgttgtttgaccgaccctaaagtgtgt
gtggatgagcttgcattggagggcgtgaattttcaaatgcctgaattgccaccatcggat
gcgcccgttgaagagacgccgccattacgttcggtgagcacgccagtacctattttcatc
aacaacgtcagtttcaacgacattaaactgaacattttgggcaatcatattgattggcaa
gcgttttccacagcgttgtcgatgcaaggcgatcgcttggtgattgcgcctacggcatta
aaaacgataaatattgcgttagcaccgagtgaagacacgcctaaagcagataccgcttcg
aaacccaaagcagagtcggagccaaaagacattgtattgcctgaagtttggattccatta
accgtcgaagccaaacgcttagacattcatgactttaaacttgcgggtgatacaccagtc
gttgttcatcacctaggtcttgaagcgaaagcgggtggtgaccaggttgaggtaaaaaca
cttgaacttgatatgccagaagtggaagggcagttaagcactcaagtgacgctctctgcg
gactatccaatacaggctcagatcgatgctttgattaagcaagaggacgtaaaaggtcaa
aaactatcgttgtctgcttcgggatcggttggggatttgtctattgaagcgacgttgtcg
gatcgggttaaagcgaagatcgatggccaagttcagccgcttaaaagtgagctgccattt
gatatccatctaaaagaggtagcagctcagtggccattaagaggtaaaagtgattatcaa
gtcgaggttccgaatcttacagccaaaggttcgctcaatggctatgcggtgaacttagaa
actaaggcctcgggtaaagatatgcctgatgttgacgtcacgctaaatggtaaaggcacg
cttgagcagattgatttagaccgtttggttgtaaaaacattgggtggtgagctttcaggt
aaggtgatggcaaattgggctgctccaatcaactggcaagcggatttgaacctgaagaac
attcagccagggttacaatggcaagaagccgagggtgatatcagtggtagcttgtcgaca
tcgggatccctcactgagcaaggtgggtggcaagtcaacctacctaaactggatattgac
ggtattttgcgtggctaccctctgaacatagagggacagttagaggcgtcggataaaaat
ggtaaaggcgaggatatccagcttaacacccaagggttagcgttatctcatggccctaat
aaattgcgtgcgaaaggaaaaatcgacaaacagatcatgatggatgttgaggttaacttc
cctgatttttcgaaaagtgtgccagaccttagcggtaaaatgaatggtgcagtggcatta
cgaggaagcttaaagcagcccgatatcaatgtcgatcttgcgctgaatcaactcgattgg
cagcaacaagcgaaagtggaaagcattaccttaaaaggggatgtgatgcctttgcctgcg
ccaaaagcggatgtcagtttgatcgcaacgaatattgcttatgatgacgttgtgattgat
cgtgctgatctcgaactttccggagatgagaagctacatcaacttacattagatgtggta
tcagacattgtttcgagcagccttgaaattgaggggacgtttaaacaaaaaccagaaatg
atatgggatggtgctttgcgtcgtctcaccttaagcacccctcaaggcccttggacgtta
caaaaatcgacatccgttaaagtgaacatcgataagcaaatcacggatgtacaagcgcat
tgttggttgcaagcaaactctaaagtgtgtttaaccgaaaacatcagtgtgggtaagagt
ggcgaagcgaaactcgccattacgaactttgactttgaccaaatacagcaattcttacct
caagaaacaaaactacaaggctcgttgaatgctaatgcgtttgcaaaatgggcgccaaac
atcaaaccggaagtcacgttagatgttgaattgccaaaaggtcatgtagagcaagcatta
gaacagcctattaaggttggttgggatagcgtgaatctacaagctaaacttgccgaagat
aaattgaatgcgaaatggcttcttgatgtgaccgacaacggcgatctctctggccaagtt
gaattgaacgatgtgtcatcggacagcccaacgattgacggtaaagtgttgctatcgacg
ttcaatttagacttcctcgcgccgttgattggtgagtacagcttatttaaagcgagtatg
aatacggatttgacactgtctggtgatgtgatgcatccgaaagtaaacggtaagttcttg
attgatcagatgaaactgcaaggggaagtcacgccgattgatatcaactctggcaaggtg
gcgattaactttactggtcatcaagcgaatttagatgcgggcattatgacgccggacggt
aagcttgaaattaatggtgatgccgattggcgtgaccttgaaaattggaatacaaaagca
cgcgtgtttgcgaaagagcttaaagtggatatgcctccaatggttcgtatcaaggtggaa
cctgacatgaccattgatgtgacgccaaaattggcgaaagtcacaggcaatatcaactta
ccttggggacgtattttcattgatgagttgccaccaagtgcggtgggtgtttcgcgagat
acggtgatcttaaatcaagacatgcaaccggtcgatggcgaacctgcattgccatttaac
gttgaaacggacatcaacataaaaattggtgatgagttccagctgtcagcgtttggttta
aaaggtgagctgcaaggtaacctcaatgtgacgcaaaaagacaagggaccatttattgtt
ggtgaggtgaatatcgttgatggttcctatcgctcttttggccaagacttggtgattgaa
gagggtaagatcatgatgaatggccctgccgatcagccgtacgtctcgatcaaagcgatc
cgtaaccctgacaatacgcaagatgatgtgacggcaggtgtacgtgtaacaggcccagca
agcgacccaacggtagaaattttctcagatcctgccatgccgcaagcaaatgcactatct
tatctattacgaggtcaagatatcgatgcggagtcgggtggcaatgcgatgaccaccacc
ttgattggtttgagccttgcgaagagcggtaaagtggtcggtgagattggtgaagccttt
ggagtacaagacttgcagttagatacggctggctctggtgatgactcacaagtgacggtt
agtggctatattcttccaggcttacaagtgaagtacggcgtggggatctttagctctctg
ggtgaatttaccgtgcgttatcgtctgatgaaagacttgtatgttgaagcggtgtctggc
gttgatagcgccgtggacttactatatcaatttgagtttgattga
DBGET
integrated database retrieval system
