Vibrio alfacsensis: D1115_17385
Help
Entry
D1115_17385 CDS
T05841
Name
(GenBank) EAL domain-containing protein
Organism
vaf
Vibrio alfacsensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
PTS_EIIC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AXY02778
UniProt:
A0ABM6YY97
LinkDB
All DBs
Position
II:483530..485566
Genome browser
AA seq
678 aa
AA seq
DB search
MNNRYFNRLFTAVSSNLYVNGLCNVLVMLLPVSLISAFSALIGNLLMMAGYEKMGETIAT
GSVIVWKLFPILLLVYFSQFLSSLHKVSRVNVITPSLMIYFIVCNEWGLLQEGTVVPSNY
PLGILAPIAVAWSVRFMQDRKWFFASDLPNVIDQSYNLLMATTVLVVFYAALGYLFGLIF
DVAEISAFLLPNIEPNSLFDGIIYELVRNLFWAIGINGHVIFASYKAELFEMTQIALQNH
ELFNTPIPVLTTNFFDFYAGLGGAGNTISLVLCMLFLTKNRSYKMLGAAVLVLSVFNINE
PVLYGLPIIFNPVLIVPFLLAPVIGLIIAYIATSTGMVAPISEIMSWMTPPLVSGYIATG
NMWTGTALQLVIILVGVLIYYPFFKQMDQISNTNVLFAKSITDDFFNYENVESGREIGDF
FPEITSKFAAQKRISDLRKTGEFVLYYQPQVDTRSGVIRSVEVLIRHRSVSGEITPPTFL
SDFSKLGLMSELDLWVVETTLKEVAQMAHHPQFKVSINLSPETCLVPDFTEKVLNMINKS
ALSYSQVEFEITEDMLIQDEHRTYQVLCSLREAGVKIALDDFGSGYSSIGYLSKFDFDKV
KIDRSLVLNLNNKNGRELFRLTTELIKITGAETVAEGVETEVELAFMSEQGINLIQGYYF
YKPMPFHDVVKLCSNSSQ
NT seq
2037 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaacaatcgatattttaatcgactttttactgcagtttcttccaatttatatgtcaac
ggactgtgcaatgtccttgtaatgttgctgccagtttctttgatctctgcttttagtgca
ttaattggtaatctgttgatgatggccggttacgaaaagatgggtgaaacgattgctaca
ggcagtgtaattgtttggaagctatttcctatattgctgctggtgtatttctctcagttt
ttatcttctttacacaaagtatcacgcgtaaatgttattacaccttccttgatgatctat
ttcattgtgtgcaatgaatggggattactgcaagaggggacggtcgtaccgagcaactat
ccgttaggaatattagctcctatcgcagtggcgtggtctgtacgctttatgcaagatcgt
aaatggttctttgcctccgatcttcctaatgttattgatcaatcatacaacttgttgatg
gcaacaacggtattggtggtgttttatgccgctcttggctatttattcgggctgatattt
gatgtcgctgagatcagtgcttttttattgcctaacatagaacccaattctttgtttgat
ggcatcatctatgaattagtgcgtaacttgttttgggctattggtattaatggccatgtc
atttttgcctcatataaagctgaactctttgagatgacccaaatagcgctgcagaatcat
gagctgttcaatacgccaatcccagttctaaccaccaatttttttgacttttatgcggga
ttaggtggggcgggtaacaccatttctttggttctatgcatgttgtttttaaccaagaac
cgtagctataagatgttgggtgcagcagtattggtgttgagtgtatttaatatcaatgaa
ccagttctctacggtttacccattatttttaaccctgtattgatcgtgccatttcttctt
gctccggttatcggacttattatcgcctatattgcgacgtcaacaggtatggtggcccca
atatcagagattatgagttggatgactccgcctttggttagcgggtatattgctacaggc
aatatgtggacaggaacggcgctgcaattggtcattattttagttggtgtgcttatctac
tatccattttttaaacagatggaccaaattagcaataccaatgtgttgtttgctaaatca
ataacagatgattttttcaattatgaaaacgttgagagtggcagagaaattggggatttt
ttcccagagatcaccagcaagtttgcagcccagaaacgcatcagtgatttgagaaaaaca
ggggagttcgttctctattaccaaccacaggttgatacgcgaagtggtgtcattcgttca
gtcgaagtgctgatccgccaccgctcagtatcgggagaaattacaccaccgacgtttttg
agcgatttttccaaacttggtttgatgagcgaactggatttatgggtggtcgaaacaaca
ttgaaagaagtggcgcaaatggctcaccacccccaatttaaggtttccataaacctctct
ccagaaacgtgtctggtgccagattttactgagaaagtactgaatatgattaacaaaagt
gcgttgtcgtattctcaagttgagtttgaaataacagaagatatgttgatacaagatgag
caccgtacttaccaggtattatgttcattgcgagaagcgggagttaagattgcactggat
gattttggctcgggttactcatccataggttatctgtcaaaatttgattttgataaagtg
aaaattgatcgctcattggtacttaacctaaacaacaaaaatggccgagagttgtttagg
ttgactacggaactcataaagatcaccggtgcagaaaccgtggctgagggcgttgaaacg
gaagttgaacttgcgtttatgtcggaacaaggcattaacttgatccaaggttattatttt
tataaaccgatgccatttcatgatgttgtgaaattgtgttcgaatagctcgcaataa
DBGET
integrated database retrieval system