Vagococcus coleopterorum: G7081_03015
Help
Entry
G7081_03015 CDS
T06513
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
Organism
vah
Vagococcus coleopterorum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
SNF2_assoc
Helicase_C
ResIII
SWIM
ERCC3_RAD25_C
TFIIE_beta
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QIL46110
UniProt:
A0A6G8AMB1
LinkDB
All DBs
Position
581186..584386
Genome browser
AA seq
1066 aa
AA seq
DB search
MKWSIPEKIVEQGRKYTNDGRVTAITQDLEENCWHAEVIGTAVYQVKLDGSPREEDQCTC
EDWQKKKYCKHTVAVELALRSKGLNRVLKQNPQLRSTYKAPTVGKLFSNSFSKLQTKQTE
ILLADEMPLTMEYVIESVPTSIHHPHKDIWVLSFKIGLRNERCYVVKNSQKFLECWQAEG
VYTIAEGLTVTLTRDSFSDADHSLLESIWDISHMQEVLGAVQYPTKGKLKPRHLFLDRDN
LVRTIDMLMKADKLQLKVANINDEKWQIKKDETPFKFKVEPKQKGYVLTVLTEVINYWEY
YSWVQIESGMFQLNPRQTEIFETLNQLLKRSDSLAILFEAEEVSDLFTFVLPQLSEIGVV
ELINDHLSQMVRYPLVNELLFSIADNNLMVQADAVYGDIRFSTNSDLSSGLDEQKTVIRD
TVQEQRLLKLLAKQQYQKSKNGYQKQLPKGEALFLFFTKELPNLRKISRVELASELQEQY
LDGLKYAPVIEVKEQGSWFDVDFDISGIAEEDISGLMLSLMEQKTYHQLSDGKIISLESE
SYQKTSHALKELRQYLTFEDNQFLIPKYRSLQLSEILNQTDRVQYDSEFAKLSYDLTHPQ
ELTVPVPKELNADLREYQEVGYRWLTMLRDYGFGGILADDMGLGKTIQTIAFLLNQKECG
TEGPALVVAPASLVYNWQNEFKKFAPTLKTIVIMGTQKEREQYLNEADGFDVLIVSYASL
RQDSSRYHQMQLSTLILDEAQTIKNPTTKTFQAMKKLKTTQRFALSGTPIENKLEELWSL
FAIVMPGFFPKRAKFNRMSASEVAKMIQPFVLRREKREVLKDLPDKIESNVLSVLTDEQK
ATYLAHLRQMQTKVKGMDSKAFKENHLQILAGLTRLRQICCDPRLFIEDYQGGSGKLDQV
KELVAAAKANGRRILLFSQFTGMLNILENELTDMEISTFYLHGGTKPKERIEMVDKFNQG
SKDVFLISLKAGGTGLNLTGADTVILYDLWWNPAVEEQAASRAHRMGQKQVVEVWRMISE
GTIEEKMYHLQEGKRRLFDEVMSDQDGSKLKKLSEDDIRDILLINE
NT seq
3201 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatggagcattcctgaaaaaatagtggaacaaggtagaaaatatacaaatgatggt
cgtgtgacagctattacgcaagatttagaagaaaattgttggcatgcggaagtaattggt
actgctgtttatcaagtgaaattagatggttcaccacgcgaagaagaccaatgtacgtgt
gaagattggcaaaagaaaaaatattgtaaacatacagtggctgttgaattagcccttcgt
tcaaaagggttgaatcgggtgttaaaacaaaatccacagttacgttcaacatataaagca
ccaacggtagggaaattattttctaatagtttttctaaattacaaaccaaacaaacggag
atcttgttagctgatgaaatgcctttaacaatggaatatgtgattgagtcagttccgact
tcaattcatcatcctcataaagacatttgggtacttagttttaaaatagggctaagaaac
gaacgctgttatgtcgttaaaaatagtcaaaaattcttagagtgttggcaagcagaagga
gtgtatacaattgcggaagggttaactgtcaccttaactcgtgacagtttttcagacgct
gaccatagtctattagaaagtatttgggatatttcacatatgcaagaagttcttggagct
gtgcagtatccaacaaaagggaagttaaaaccacgccatttgtttttagatagagataac
ttagtacgaactattgatatgttaatgaaagctgataagttacaattgaaagtagctaat
ataaatgatgagaagtggcagatcaaaaaagatgagacaccgtttaaatttaaagtggaa
ccaaaacaaaagggatatgtgttaacggttctaacggaagttataaattattgggagtac
tactcatgggttcaaatcgaaagtggcatgtttcaattaaatccacgacaaacagaaatt
tttgaaaccttaaatcaattactaaaacgatcagatagcttagcaatcctttttgaagcg
gaagaggtgtcagatttatttactttcgtattgccgcagctttctgaaataggagtagtt
gagttaatcaatgaccatttgagtcaaatggtcaggtatcctttggtgaatgaattgtta
ttttcgatagctgataacaatttgatggtacaagcggatgctgtttacggcgacatccgg
ttttcgacaaatagcgacctaagtagtggtttagatgaacagaaaacagtaattcgcgat
acggttcaagagcaaagactgttgaaattattagctaaacaacagtatcaaaaatctaag
aacggctatcaaaaacaattacctaaaggtgaagcgttattcttgttctttacaaaagaa
ttaccaaacttaagaaaaatcagccgtgtcgagcttgcttctgagttgcaagaacaatat
ttagatggtttgaaatatgcaccggttattgaagtgaaagaacaaggctcatggtttgat
gtagattttgatattagtggcattgcggaagaagatatttcagggctgatgctaagtcta
atggaacaaaaaacgtatcaccaattgtctgatggcaaaatcatttctttagagtcagaa
agttatcaaaaaacaagtcatgccttaaaagaattacgacaatatctaacgtttgaagat
aaccagtttttaattccaaaatatcgtagcttacagttatcagagattttaaatcaaacc
gatcgtgttcagtatgattcagaatttgctaaattaagttatgatttaactcatcctcaa
gagctgacagttcctgtgcctaaagaattaaatgccgatttgagagaatatcaagaagtt
ggttatcgttggttgacgatgttaagagattatggatttggcggaattttagctgatgat
atgggactgggaaaaactattcagacaattgcttttttattaaaccaaaaagagtgtggt
acagaaggtccagcgcttgtggtggcaccggctagcttagtttataactggcaaaatgaa
tttaagaaattcgctccaacgctaaaaacgattgtcattatggggacgcaaaaagaacgg
gaacaatacttaaatgaagcagatgggtttgatgtgctaattgtgtcttatgctagctta
cgtcaggatagtagtcgttatcatcaaatgcagctaagtacattgattttagatgaagcg
caaactattaaaaatccaacgactaaaacttttcaagcgatgaaaaagttgaaaaccact
caacgatttgccttgagtggcacaccaattgaaaataaactggaagaattatggtcgcta
tttgcaattgtcatgccaggatttttcccaaaaagagcgaaattcaatcgcatgtcagct
tctgaagtagctaaaatgattcagccgtttgtcttgcgtcgtgaaaaacgtgaagtatta
aaggacttgccggacaagatagaatcaaatgttttaagcgtcttaactgatgagcaaaag
gcgacttatttagcccaccttcgtcaaatgcaaacaaaagtcaaagggatggattctaaa
gcgtttaaagaaaatcatctacaaattttggcaggattgacacgattacgtcaaatttgc
tgcgatccgagattgtttattgaagattatcagggtggttcaggcaagttggatcaagtc
aaagagctagttgctgcagcaaaagctaatggtagacggatcttattgttttcgcaattt
acagggatgctcaatattttagaaaatgaattaacggatatggaaataagcaccttctat
ttacatggaggaacaaaaccgaaagaacgaattgagatggtcgataaattcaaccaaggc
tcaaaagatgtttttttgatttccttaaaagcaggtggaacagggttgaatttaaccgga
gcagatactgttatcttatatgacttatggtggaatccagcggttgaagaacaagccgcg
agtcgagctcatcgtatgggtcaaaaacaggtggttgaagtgtggcggatgatttctgag
ggaacgattgaagaaaaaatgtatcatttacaagaaggtaaacgccgtttgtttgacgaa
gttatgtctgatcaagacggttcgaaattgaaaaaattatctgaagatgatattcgtgat
attttattaattaatgaatag
DBGET
integrated database retrieval system