Vibrio anguillarum 775: VAA_01117
Help
Entry
VAA_01117 CDS
T01536
Name
(GenBank) Leukocidin S subunit
KO
K20952
rugosity and biofilm structure modulator C
Organism
van
Vibrio anguillarum 775
Pathway
van05111
Biofilm formation - Vibrio cholerae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
van00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
05111 Biofilm formation - Vibrio cholerae
VAA_01117
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prism_lec
Crystall_4
FG-GAP_3
FG-GAP
TcdB_toxin_midN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH33737
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2331430..2334495)
Genome browser
AA seq
1021 aa
AA seq
DB search
MIRLIFESVSHRSVVVIRCTSTDNYVTLSMFARYLHYAGLANRTFSLSNAVWLGRYAYLV
EGNFFMTIKYLVFAVGMISLGGSMVQAADQEGCIISRKTGDKYCLNIGQRSEYSLPSWIY
NHQVDVLAPSGVSVMLSDWDNLSYNRLAVFDHYTDNSELKNVKALNGQALDFSHPRSMRV
LASELYPEACIVSRENGERFCLKEGERSGYSLPSYIYGHAVDIVAPEGLGVILSDWDNLS
YNRLAVFGGNTSNAQLKSVKAYNGELLDFSHPRSMRVVSFDVPSDTISTQLKWSWQGGGF
KPLSNQVMATPVVAQLNDDNGDGNIDEKDIADLIVVTFEGSKYVNGGLVRALSGVDGSEL
WSYEQGEAIADARYSPAVADLDGDGVVEIVTTNTSSSYLNILDNNGHVKKQILKAQTGGR
SVGSITLADLDGDGSVEILSSDGVYNYESGLVFSHPWAPSSINVDIDGDNSQEVFSGGVM
YQNSGAVNWQYLANDMVWFSSLVNLDNDERPEIVASVPAAFATGENARFAVLEHDGTVKW
EVNNSTNPGGGVQAVSNFLGKAKVIENNEWSKVYGYRSHTNPSTITITSDAKLSVRSGLA
IDAVGSSAQSLIGGRGGNLSQPVNIKDVKSVDVTWGKYYWGGYHVVALDFRMSNSSIIRM
GSKKYAYSKQTESFNVPADSQIKSIKVWTEGWLVDGLQFELASRSGSNDIDVKGIVYAGY
TAVDMYNSKGDRVWSAANDDTGSGKIGVSAYDFDGDGIDEVIVQDHARVRILDGRTGQER
ASFAHSTSTLWEYPIVVDLAGDNNAELIVVANDFDKNYVVNHGVFVYESADSAKPWKNAT
RIWNQHAFHLTNVTQDGVVPTNATPSWLSHNTYRSSTLRATVGGESPIFGYSNTQQSQRV
VTADNQMYLRSGFAIDAIGTTANNLVGGPVQGTNGGVLRAPIALDQLQSVEVTSGLYNWG
GYHIVAIKFTMKDGSSVLLGSTHYASNKKVETYTVPQGKRIKQINVWTGGWLVEGLQFVF
D
NT seq
3066 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgattcgtctcatatttgagtctgtatctcatcgaagtgtcgttgtaataagatgcacg
tctactgataattatgtcaccttatccatgttcgcaaggtatctgcattatgctggcctt
gctaaccgtacttttagcctatcgaacgcagtttggttgggaaggtatgcatatttagta
gagggaaactttttcatgacaataaaatatttggttttcgctgtaggaatgatctcattg
ggtggctcaatggttcaagctgcagatcaggaaggttgcattattagccggaaaaccgga
gataagtactgcctaaatatagggcagcgttcagaatattcgctaccatcttggatttat
aatcatcaagttgatgttttagcacctagtggtgtttcagtgatgctcagtgactgggat
aatttatcttacaatcgcttggcagtttttgaccattatactgataacagtgagttaaaa
aatgttaaagcattgaacgggcaggctctagatttttctcatcctcgttccatgcgtgtc
cttgcatcggaactttatcctgaagcttgtatcgtgagccgtgaaaatggtgagcgtttt
tgtcttaaagaaggtgagcgttctggttattcgctcccttcctatatctatggacatgct
gtcgatatagtcgctccagaaggtcttggagtgatacttagtgattgggataatttgtcc
tataaccgtttagctgttttcggtggtaatacatctaatgcacaactgaaatcagtgaaa
gcttacaatggtgaactccttgatttttcacaccctcgttctatgcgagttgtgtcattt
gatgtaccttctgacaccattagcacgcagttgaaatggtcatggcaaggcggtggcttt
aagccattatcgaatcaagtgatggcgactccagttgttgctcaactgaatgatgataat
ggcgatggtaatattgatgaaaaagacattgctgaccttatcgttgtgacgtttgaaggg
agcaagtatgttaacggaggcctagttcgagctttaagcggtgttgatggctcggagttg
tggtcttatgagcaaggtgaagccattgctgacgcaagatattcaccagctgtcgctgat
ttagatggtgatggtgtagttgaaatcgttacaaccaatacatctagctcctatttaaat
attttggataacaacggtcatgtaaagaaacagattctcaaagcacaaactggaggccgt
tcagttggctctataaccctcgcagatcttgatggggacggtagtgtcgagattctatct
tcagatggcgtttataattacgagtcaggtcttgtatttagtcatccttgggccccatct
tctattaatgtggatatcgatggcgataattcgcaagaggtcttttctggtggtgtaatg
taccaaaacagtggtgccgtcaattggcagtatctagccaatgatatggtgtggttttca
tcgctcgttaatttggataacgatgagcgtccagaaattgtggcttcggtcccggcagct
ttcgcaacaggcgaaaatgcacgatttgctgttttagaacacgacggtaccgtaaagtgg
gaagtgaataacagtacaaatccaggtggtggcgtacaagctgtttctaatttcttaggt
aaagccaaagttatcgaaaacaatgaatggtcaaaagtctatggatatcgttctcatact
aatccatcgacgattactatcacatcggatgctaaattatcagtacgctctggtttagcg
attgatgctgtggggagctcagctcaatcacttattggtggccgtggtggtaaccttagc
caaccagtcaatatcaaagacgtcaaatctgttgatgttacttggggtaagtattattgg
ggtggttatcatgtcgttgcgctcgatttcagaatgagtaatagcagtattattaggatg
gggtcgaaaaagtacgcgtattctaagcagaccgagagttttaatgtgccagccgatagc
caaattaagagtatcaaagtgtggactgaggggtggctagttgatggtttgcaatttgaa
ttggcttctcgtagtggctctaatgatattgatgtgaaaggcattgtttacgctggatat
actgctgtggatatgtacaacagtaaaggtgatcgcgtctggtctgctgctaacgatgat
actggcagtggtaaaattggtgtttctgcttacgattttgatggcgatggtattgatgaa
gttattgttcaggatcatgccagagtgcgaattcttgatggacgaacgggccaggaaaga
gcctctttcgcgcattcgacctcaaccttgtgggagtacccgattgttgttgatcttgcg
ggggataacaacgcagagctgattgttgttgcgaatgattttgataaaaactatgtcgtt
aaccatggtgtgtttgtttatgaatctgcggacagtgcaaaaccttggaagaatgcaact
cgcatctggaaccagcatgctttccatctgacgaatgttactcaagatggtgtagtgcct
acaaatgcgacaccaagttggttgagccataatacataccgttcgagtacattacgtgca
acggtgggtggtgagtctccaatttttggttactcaaatactcagcaatcgcaacgtgtc
gtgacggcggataaccagatgtatctgcgttctggttttgcgatcgatgcgatcggcacg
acggccaataacttggtgggcggcccagtacaaggtactaacggtggtgtgctaagagca
ccgattgctcttgatcaattgcaatccgtggaagttacctctggtctttataactggggt
ggttaccacatagtggcgattaagttcacgatgaaggatggctctagcgtgttattgggt
tcaacccactatgcgagcaacaaaaaagttgaaacgtacactgtgccgcaaggtaaacgc
atcaagcagattaatgtttggactggtggttggttagttgaaggcttgcagtttgtattc
gattaa
DBGET
integrated database retrieval system