KEGG   Vagococcus zengguangii: FA707_04915
Entry
FA707_04915       CDS       T05965                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit epsilon
  KO
K03722  ATP-dependent DNA helicase DinG [EC:5.6.2.3]
Organism
vao  Vagococcus zengguangii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vao00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:vao03400]
    FA707_04915
Enzymes [BR:vao01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.3  DNA 5'-3' helicase
     FA707_04915
DNA repair and recombination proteins [BR:vao03400]
 Prokaryotic type
  Other factors with a suspected DNA repair function
   DNA helicases
    FA707_04915
SSDB
Motif
Pfam: Helicase_C_2 RNase_T DEAD ResIII RNase_H_2 DEDDh_C DEAD_2 Helicase_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: QCI86345
UniProt: A0A4D7CQ99
LinkDB
Position
1052831..1055647
AA seq 938 aa
MKGGASMKHDSVYAVVDLETTGTNSKEDKIIQIGCVFVQNGQIIDIYRQDINPRIKLTKQ
IESLTRLTNQQLASAPYFEDIAAELMQKLTNCVFVAHNIYFDYQFLSQAFVQAGFEPLTM
PGIDTVELAQIFLPTLPSYRLTDIADFLEYEHDRPHQADSDALVTSELLIYIDQKIKQLP
ICTLEQIVTLSRVLGKETSDYLAMQLTQLKQNYPPLAPGLKVVNGLALRQKPDMSDLYPH
KVLTDFPVGVEAKTEAYGELLEVRESQSRMIDDVYQFFTNKTRENVEKNFAIEAPTGSGK
SFGYLYPMSFLATCDNPVVLSTTSILLEQQLINEAIPLVNRVNQNSLVGTMIKSSRYFID
LNKFNVTLQQAPRQKQFAIHQMSVLVWLLDTETGDLTELNLANLEHPFFRQVKHFGERFI
PTGSPFYEEDFWRYLKNRVNHSNVLIVNHAFLIKENFREFPWLPASDYLIIDEAHHLPEI
AEKMGREQLDFSKIKFIFHKLTHFEEVMANWTRIQGDKDWPINVQLLNQIVTESHQVLEN
LEADIVETTVLDGKYKLNEELLISQEQLENLPIYVVQDIYRLIRLLADLNALINQCRDFC
FQHWEKWLPSEQLSIQAWLDYQDELQTILAFVTDYIQNDNKQLIKWLFIDDDKYQIRLFK
SDVGASLVEDTTWYERYQKILYTGGTLSTGDQDNFLAKNLGIESIPMVKFKGTFDYEQQA
RLYLPTESAQFTNLSSPYYESYVAQSILELAKNNSVNILVLFTSLDMLKNVYYKIQSSLI
DDSIETLAQGITGSRERILKRFTKQGGQKVLLGADSYWEGVDLPGDALELIVVVRLPFES
PDRPYIKEKLRLYQERGLDGFQHYSLPKAILRLRQGIGRLIRSNDDHGAIVILDPRIETA
RYAKKIKQSLPDGLTLAVKPLDNIISELTDFIGKRNNR
NT seq 2817 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaggaggagcgtcgatgaaacacgactccgtttatgctgttgtcgatttagaaaca
accggcacgaattcaaaagaggataaaataattcaaattggctgtgtctttgtccaaaat
ggtcaaataattgatatttatcgtcaagatattaatcctcgtattaaattaaccaagcaa
atagaatctttaacaagattaaccaatcagcagctcgcaagtgcgccttattttgaggat
attgcagctgaattaatgcaaaaactaacgaactgtgtgtttgttgcccataatatttac
tttgactatcaatttttaagtcaggcgttcgttcaagctggatttgaaccgctaacgatg
ccgggaattgatacggttgaattggcacaaattttcttgcctactttaccaagttatcgg
ttaaccgatattgccgactttttagagtatgaacacgatcgtccgcatcaggcggatagc
gatgcacttgtgactagcgaattgctgatttatattgatcaaaaaattaaacaattacca
atttgtaccttagaacaaattgtcacattaagtcgtgtcttaggaaaagaaacctcagac
tacttagccatgcaattaacacaacttaaacaaaactacccgccattagctccagggctt
aaagttgttaatggtctagctttacggcaaaagcctgatatgagtgatttatacccacat
aaagttttaacagactttcccgtaggtgtagaagcgaaaacagaagcttatggtgagtta
ctagaggtacgtgaaagtcaatcacgtatgattgatgatgtgtaccaattttttaccaat
aaaacacgagaaaatgttgaaaaaaactttgccattgaagcaccaacgggaagtggaaaa
tcatttggctatttgtacccgatgagtttcctagcaacgtgcgacaatccggttgtgttg
agtacgacctcaattttgcttgaacagcaattaattaatgaagcaattccgcttgtcaat
cgagtcaatcagaatagtcttgtcggtacaatgattaaaagttctcgctactttatcgat
cttaataaatttaatgttaccttacaacaagccccacgacaaaaacaatttgccatccat
cagatgagcgttttagtatggctacttgatacagaaacgggtgatttaacggagcttaac
ttagctaatttagaacatccattcttcagacaagtgaaacactttggtgaacgatttatt
ccgacaggttcacctttttatgaagaagatttttggcgttatttaaaaaatcgtgtgaac
cattcgaatgtgctgattgtcaatcatgcctttttaataaaagagaattttcgtgagttt
ccttggttaccggcaagtgattatttaattatcgatgaagcccatcatttacctgaaatt
gccgaaaaaatgggacgtgaacaattagatttttcgaaaattaagtttattttccataaa
ttgacgcattttgaagaagtaatggctaattggacgcgcattcagggggataaagattgg
ccaattaatgtccaactattaaatcaaattgtgacagagtctcatcaagtgttagaaaat
ctagaggctgatatcgttgaaacaactgtattagatgggaaatataagttaaatgaggag
ctattgataagtcaagaacagttagaaaatttaccgatatatgtagttcaagacatttat
cgtttgattcggttattagctgatttaaatgcgttgattaaccaatgtcgggacttctgt
ttccaacattgggaaaaatggttgccaagtgagcaattaagtattcaagcttggctagac
tatcaagatgagcttcaaaccattttagcgtttgtgaccgattatatccaaaatgataat
aaacaattaattaaatggttatttatcgatgatgataagtatcaaattcgtttatttaaa
tcggatgtcggcgcatcactcgtggaggatactacctggtacgaacgttatcagaaaatt
ctatacacaggtggtaccttatcgacaggtgatcaggataattttttagcaaaaaattta
gggattgagtcgattccaatggtgaaattcaaagggacatttgattacgagcaacaggca
cgactatatttgccaactgaaagtgcgcagtttactaatttatcaagtccttattacgaa
tcatatgtcgcacagagtattcttgaattagcaaaaaataattcggtcaatatacttgtg
ttattcacgtcattagacatgctaaaaaatgtttattataaaattcaatcatcgttaatt
gatgatagtattgaaacattagcgcaaggaatcacgggttcaagggaacgcattctgaaa
cgcttcaccaaacaaggtggacaaaaagttttacttggggctgattcttattgggaaggg
gtcgacttacctggagacgctcttgaattaatcgtagttgttcgcctaccatttgaatca
cctgatcgtccgtatatcaaagaaaaattacgtctctatcaagaacgtgggttagatggt
tttcagcattactcattacccaaagcgatattacgtttgcgccaagggattggtcgtctt
attcgtagtaatgatgatcatggggctattgtaatacttgacccaagaattgagactgca
cgttatgccaaaaaaattaaacagtcactgcccgatggcttgacgttagctgttaagccc
ctggataatattatcagcgaattaacagattttatcggtaaaagaaacaacaggtaa

DBGET integrated database retrieval system