Veillonella atypica: B7L28_00480
Help
Entry
B7L28_00480 CDS
T04798
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
vat
Veillonella atypica
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vat00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vat02000
]
B7L28_00480
Transporters [BR:
vat02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
B7L28_00480
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
YadA_stalk
YadA_head
Collagen
ESPR
YadA_anchor
bZIP_1
ZapB
TolA_bind_tri
DivIC
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ARF98508
LinkDB
All DBs
Position
113840..123889
Genome browser
AA seq
3349 aa
AA seq
DB search
MNKIFKVVWSKTKECYVVVSEVAKNNGGKKKVLASVLAGLAMVGAGAIGTPVQAVFSDSG
SSINVYPNAKTGNYVGSNAVVVGFENRTDADIPGTDQLGRVIYGTGNIGAGNSALAVGNN
NEARGTAVVAIGHGANAKAKQSVALGNVARAEKDGTVAIGTYVNAETTNVGTATVPKYNT
KETGAYSTAVGAFSWTKGDYSTAYGYKAEATGGSAVALGRDSAASGSGSVAVGYTNKAKQ
NVAVALGTNNNVDGEEATAVGSSNTIATNANQATAIGRKNIVNRAGAFAAGFSNVTNGDR
NVAVGSENTTTGEESIGIGTKTIAGTGKTIAIGTVYNPGGGVEKQTIARGDDTINTATGQ
VNNIFALAIGNGAQADGKDNKASGMIAIGQDVLANNTNTIAMGIQAKATGSRSMAFGQAA
NASGSGAFALGQATNATSHGSIAMGNGAQSNGSGSTALGRTAKATTDGSVALGYNAEATG
DGAIAIGGDGKGAALDSTNTTFAGLGEKTTATAKNAVAVGHQATASIAGGVALGSESKTT
KDAGEIGYNPATGRTNDYKNLTNNTKAALTSTRAAISIGDDSASVTRQLTGLAAGTQDTD
AVNVAQLKAVNLKYAGDTGNSDVLLKDGTLNVKGSDYITTSADGTGITVKAKIGDSITAN
AAGKAEAPATNGLATTTNVAEAINKSGWNVVSSNNGGSVTGTQATKLVNPGNTVTLSAGK
NIVLDQNDKQFTYSLNKDVDLTNAGSLTIGDTKVTNGGLTITGGPSVTKTGIDAGSKVIS
NVADGAVNATSKDAVNGSQLHTVASKERHIKPGTYTVTGDTVTLNYVDGEGKDDTSITAK
ITGIANTDLSNITTNGETKIKNLAKSAIDMEDGKNTKASSREVNGVKTFKVDVEGDLTGI
TSITNAGPTKMEIGPNSINITGGTLNMGGNKITNVGPATSGTDAVNYDQLKNSRTVVTSK
DGSVTVTPTTNGDKTTYDLHVTAGAAASSWNIASDKVSATEGTVAAGSAASQNIKDTKTV
TMQAGKNLTVNQTNDGNGNASVAFALDKDLKDLTSVTTDKVTTKEIGLQDAGGNTTTIKK
DGDRITYSNDGGTTVNKVANLGDEKHITKGEYSVGADGKVTMTYTDGNGALVNGETAVIK
GIADQNLSNITNAGKNVITGLGTIVKAGDNVTVSEASDATTGQKTYTVNAVTPAVYTKAD
GTKVVKRSDGTYTTNLDGSSGNDVPASDVIISFQDAAGDTKNATSIVNNVGSAIKNQTGG
DFLTKLDNANTATPNAAVNVSDLKNTADGLTNKGLKFDANVGGAKTNKLGSTVKVQGAGT
GADANYSGANIKTFIDQDSSGNTTIDVKLDKNLTGINSITGDTNSGKLVFQDPAATGNNG
DAFKFTGGNINAGGNNITNLKSGIVNNNTTDDTNAANIGDVKTIAKDTDLHIAPTESDRT
GEHLGGAASGNTATGAAANAYKYDATTKQVVLEYNDGNGTNKTGTKAVIDLSNLPTGGDM
SSFKVTSSAESATVGTHAGDASQEIKNGKSVDFQAGKNMTVTQTNGNGNTTINYALNKDL
DVESVHVGKDGKDGKIGIDGKDGVDGLNGTNRVDIHVEKGAKGVDGTDGHDGVNGHNGKD
GMTRIVYEDKGGKQEVATLNDGMKYAGDDAQGTDKTKVIAKKLNETLDIIGGANKADLTD
DNIGVNNDGNGKLLVQLSKKLNGINTIKNGNTTITLNDTPNATTPAVTITGGNLSVDGNK
ITNVANGDVNSNSKDAVNGSQLYTVDQKFNNKINLGADGSTETTKFALDNAGGIKFNIKG
DGSGTGGANQYISTTASGSDIKVDLTQDAKDKLNKTYDVKSTDKSVTVSSTTTNGVTTFD
LKVAPAAGTTSTWDIKSSADTANGGATATGHEANAKTIENTKTVEMIAGKNLTVKQTSDT
NGAKVEFALSDEITVGKDGTNGVDGKIGVNGKDGASVVIDGKDGSIGLTGPQGATGAPGA
SATLKVKDGVPGVDGAPGTNLTRIVYTDKNNVEHEVATHDDGMKFAGDDGQANQATNANV
IKKHLNNVVDIIGGATKADLTNNNIGVNNDGNGKLLVQLSKNLNGINTVKNGNTTITLND
APGGATNTPAVTISGGNLSVGGNKVTNVDDGTDNSDAVNVKQLKAAKTEVKAGKNVVVTS
ETSTTDGHTTYTVNASTPVVYTTPDGTTKLIKQPDGTFKDENGNVYNGPVIASFEDGTGA
RTGGNMIVNNVGSAINNHATPGVTSPTYLDKLDAAAGDNNTKNAAVNVTDLKNTKDGLVD
KGLKFDANVGGVKTNKLGSTVKVQGAGTSADADYSGTNIKTFIDQDGTGNTTIDVKLDKN
LKGINKISNGGSSITLNDTPSATVPAVTITGGNLSMGNGTTNNKIVNLAPGTADTDAVNV
KQLKDTELHITPGTYTPDTNKKVKLTYTDGSGALVSGKEAVIDLSGLSTGGATASTWNVK
SSANTTDGGAVGATHDANAQNIANGKTVEFQSGKNLVVNQTNDTTNGNATVEFSLSDKIT
VGKDGANGKDGSVGAKGADGSAVVMNGADGSIGLNGTNGANGISIKGKDGANGVGIDGKD
GVTRIVYTEKVPDPANPSTTKEVTHEVATMDDGLKFTGNNTGTVNKHKLGSLVKVQGEGV
SATDEAAFVSASGNIAVTAENNDTLTIRLNKNLKGLNSIQLGGNTIQSNGDNITFTTNGG
TTKTVATTDQLWTIQANGTDVPAKSGKVNLVAGDHITITPDAANGKMTISATGFGSMDGF
NVKTSAESTTVGTHAGDTTENIKNGKTVDMQAGKNLVVTQSNDGNGNTTVNYALNKDVDL
GTNGSLKAGDTTINKDGVTIANGPSITKTGVDAGNKKITNVADGDVNATSKDAVNGSQLK
KYTDAAKTTVEAGDTNVQVETDNSATDGHTNYKVSLKPVVEIGDTHKVKIDGHTGDITGL
TNVNLTDPTFATKGRAATEEQLKQVLTEAKNKAIEKVQAGTAAAGDTNIATVAPKAGDTF
GTAGATYEVSVSKNAVKDAAKEAVKVTSVSPAITVTPDTSVAHETTYKVGFDGNQAATQI
PLTYKQNGGNTRTVKLSDGLNFIDGTNTKARTAADGKVTFDVMGDLTGITSISNAAGGPK
MTFGGNSINVTGGNLDMGGKKITNIGKGTDPTDAARVGQLTKVTSNNHSVVVTKTTDADG
APVYDLAVTGTPGAPAADPRVDMLGEEIGRVGAQGAALSALKPIQYDPLEPTQIMAGYGN
YRGNSAVALGVAHYKNESTLIHGGVSWAGGSSHMMANAGVTWKVGNRDSEAAVADRYRKG
PISSAYAMQQEMAAMKAQNAGLKGEVSDLKAENEQMKAQIAAMMAKLGL
NT seq
10050 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagatctttaaagttgtttggagcaaaacaaaagaatgctacgttgtagtatct
gaagtagcgaaaaacaatggtggtaagaaaaaagttttagctagtgtattggctggcttg
gctatggttggtgcaggagctattggtacaccggtacaagcggttttctctgatagtggt
agtagtattaatgtttatccaaatgcaaaaactggtaactatgttggttcaaatgctgta
gtagttggttttgaaaatagaacagatgcagatattcctggtactgaccaattagggcgt
gttatctatggtacaggtaatattggtgccggtaactctgctttggctgttggtaataat
aatgaggctagaggtacagcagtagtagctattggtcatggtgctaatgcaaaagcaaaa
caatctgtagcacttggtaatgtagctcgcgcagaaaaagatggtactgtagcaattggt
acatatgttaatgcagaaactactaatgtaggtacggcaactgtgcctaaatataatact
aaagagaccggcgcatattctacagctgtaggtgcgttctcttggactaaaggtgattac
tctactgcgtatggctataaagcagaagcaactggtggttctgctgttgctcttggtcgt
gactctgctgcaagtggatcaggttctgtagcggtaggttatacaaataaggcaaaacaa
aatgtcgctgttgcacttggtactaataataatgttgatggggaagaagcgacagcagta
ggttccagtaatacaattgcgacaaatgctaatcaagcaacagctattggtcgtaaaaat
atagtcaatagagcgggagcttttgcagctggtttttctaatgttacaaatggtgatcgc
aacgtagccgttggtagtgagaatactactacaggtgaagagagcattggtattggtaca
aaaacaattgctggtacaggtaaaacgattgctattggtactgtatataatcctggtggt
ggtgttgaaaagcaaactattgctcgtggtgatgacacaattaatacggctacaggccaa
gtaaataatatctttgctcttgcaattggtaatggtgctcaagcagatggtaaagacaat
aaggcatctggtatgattgctatcggtcaagatgtgttggctaataatacaaacacaatt
gcaatgggtattcaagcaaaagcaactggtagccgttctatggcatttggtcaagctgct
aatgcatctggttctggtgcgttcgctcttggtcaagcaactaatgctacatcccatggt
tctattgcaatgggtaacggtgcacaatccaatggtagtggttccacagcacttggtcgt
actgctaaagcgacaactgatggttctgttgcattaggttataatgctgaggcaaccggt
gatggtgcaattgctattggtggtgatggtaaaggtgctgctttagattctactaataca
acatttgcgggtttaggtgaaaaaacaactgcaactgctaaaaatgctgttgctgtaggt
catcaagctactgcatctattgcaggtggtgttgctcttggttctgaatctaaaacaaca
aaagatgcgggtgaaattggttataacccagcaacgggacgaactaatgactataaaaat
ttaacaaataatacaaaggctgctttaacttctacacgtgctgctatttctattggtgat
gatagtgctagcgttactcgtcaattaacaggccttgcagctggtactcaagatactgat
gctgttaacgtagcacaattaaaagccgttaacttgaaatatgctggtgatactggtaat
agcgatgtattgttgaaagatggtacattgaacgtaaaaggtagcgattatattactaca
tctgctgatggtacaggtattacagtaaaagctaaaattggtgattctattactgctaat
gctgctggtaaagcagaagcgcctgctacaaatggtcttgcaacaactacaaatgtagct
gaagcaattaataaatctggttggaatgtagtttcttccaataatggtggtagtgtaaca
ggtactcaagctactaaattggtaaatcctggtaatactgttacattaagtgctggtaaa
aatattgttttagatcaaaatgataaacaatttacatattctttgaataaagatgttgac
ttgactaatgctggttctttaaccattggtgatactaaagtaactaatggtggtcttaca
attactggtggtccatctgttacaaaaactggtatcgatgcaggcagcaaagttattagc
aatgttgctgatggtgcggtaaatgctacatctaaagatgccgtaaatggtagccaatta
catacagtagcttctaaagaacgccatattaaacctggtacttatactgtaactggtgat
actgtaacattgaattatgttgatggtgaaggtaaagatgatacaagcatcacagctaaa
attacaggtatcgctaatactgatctttccaatatcactacgaatggcgaaactaagatt
aaaaacttagctaaatctgctattgatatggaagatggtaagaatacaaaagcatctagc
cgtgaggtaaatggtgtaaaaactttcaaagttgatgttgaaggcgatttaactggtatt
acatccattactaatgcaggacctactaaaatggaaattggtcctaactccatcaatatc
actggtggtacattaaacatgggtggtaataaaatcactaacgtaggacctgctactagc
ggtacggacgctgttaactacgatcaattgaaaaattcccgtacagtagtaacatctaaa
gatggttctgtaacagttacacctacaacaaatggtgataaaactacatatgatttacat
gttacagctggtgcagccgcatcctcctggaacattgcttctgataaagtatctgctact
gaaggtactgttgcagctggttctgcagcatcccaaaatattaaagatactaaaacagta
acaatgcaagcaggcaaaaacttgactgtaaaccaaactaacgatggtaatggtaatgcg
tctgttgcatttgctcttgataaagaccttaaagatcttacaagcgtaactactgataaa
gtaactacaaaagaaatcggcttacaagatgcaggtggtaatactactacaattaagaaa
gatggcgaccgtattacatactctaatgacggtggtacaactgtaaataaagtagctaac
ctcggtgacgaaaaacatatcactaaaggtgaatatagtgtaggtgctgatggtaaagta
accatgacctatacagatggcaatggagcccttgtaaatggtgagacagctgttattaaa
ggcattgctgatcaaaatttatctaacatcactaatgcaggtaagaatgtaattactggt
cttggcacaatcgtaaaagctggtgacaatgtaactgtatctgaagcatctgatgctaca
acaggtcaaaaaacatatactgtaaatgctgtaactccagcagtttacacaaaagctgat
ggcactaaagtagttaaacgttctgatggtacatatacaactaaccttgatggttcttct
ggtaatgatgtacctgcaagcgatgtaattatatctttccaagatgcagctggcgataca
aaaaatgccacttctatcgttaataatgttggctctgctatcaaaaatcaaactggtggc
gacttcttaacaaaattagataatgctaacacagcaactccaaatgctgcagttaacgta
tccgatttgaaaaatactgcagatggtttgacaaacaaaggtttgaaattcgacgctaac
gttggtggtgcaaaaactaataaattaggctccactgtgaaagtacaaggtgctggcact
ggtgcagatgctaattatagcggcgctaatatcaaaactttcatcgaccaagatagttct
ggtaacactacaatcgatgtaaaactcgataaaaacttaactggtatcaattctattact
ggtgatactaactctggtaaattggtattccaagatccagcagctactggtaacaatggt
gatgctttcaaatttactggtggtaatatcaatgctggtggtaataacattacaaacctc
aaatctggtattgtaaacaataatactacggatgatacaaatgctgctaacatcggtgat
gttaagacaattgctaaagacactgatttacacattgctccaacagaatctgaccgtaca
ggtgagcatcttggtggtgctgcttctggtaatacagcaacaggtgcagcagccaatgct
tacaaatatgatgcaactacaaaacaagttgtattggaatataacgatggtaatggtact
aataagactggtactaaagcagttatcgacttgtctaacttgcctactggcggtgacatg
agttccttcaaggtaacttcctctgcagaatccgctacagtgggtactcatgcaggtgat
gctagccaagaaatcaaaaacggtaaatccgttgatttccaagctggtaaaaacatgact
gttactcaaacaaatggtaatggtaatacaactattaactatgcattgaataaagatctt
gatgtagaatccgttcacgttggtaaagacggtaaagacggtaagattggtatcgatggt
aaagacggtgtagatggccttaatggtactaaccgtgtagacattcatgtagaaaaaggc
gctaaaggcgttgacggtactgatggtcatgatggcgtaaatggtcataacggtaaagac
ggcatgactcgtatcgtttatgaagataaaggtggtaaacaagaagttgctacacttaat
gacggtatgaaatatgctggtgatgatgcacaaggtactgataaaactaaagttatcgct
aagaaacttaacgaaacattagatattatcggtggtgctaacaaagctgacttgactgat
gacaatatcggtgtaaacaacgatggtaatggtaaattactcgttcaattatctaaaaaa
cttaatggtattaatactattaaaaatggtaatacaacaattacattgaatgatactcct
aatgcaactactcctgctgtaacaatcactggtggcaatttatctgttgatggcaataag
attactaatgtagccaatggtgatgtgaactccaattctaaagatgctgtaaatggtagc
caattatacactgttgatcaaaaattcaataataaaatcaatttaggtgctgatggtagt
acagaaactactaaattcgcattagataatgctggtggtatcaaatttaacatcaaaggt
gatggttctggtacaggtggtgctaaccaatacatcagtacaactgctagtggctctgat
atcaaagtagatttgacacaagatgctaaagataaattaaataaaacatatgatgtaaaa
tctactgacaagtcagtaacagtaagttctacaacaactaatggtgtaacaacattcgac
ttgaaagtggctccagctgctggcacaacttctacttgggatattaaatcctctgcagat
actgctaatggtggtgctactgcaacaggccatgaagcaaatgctaaaacgattgaaaat
acaaaaacagtagaaatgatcgctggtaaaaacttaactgttaaacaaactagcgatact
aatggtgcaaaagttgaatttgctttatccgatgaaatcacagttggtaaagatggtact
aatggtgttgacggtaaaattggcgtaaatggtaaagatggtgcatccgtagttatcgat
ggtaaagacggatctatcggcctaacaggtcctcaaggcgctacaggtgctcctggtgct
agtgcaacattaaaagtaaaagatggtgttcctggtgtcgatggtgctcctggtactaat
ttgactcgtatcgtttacacagacaaaaataatgttgaacatgaagtggcaacacatgat
gacggcatgaaattcgctggtgatgatggtcaagcaaaccaagcaactaatgctaatgtt
atcaaaaaacatctaaataatgttgtagatattattggtggcgctactaaagctgatcta
actaataataatatcggcgtaaacaatgatggtaatggcaaattactcgttcaattgtct
aaaaatcttaatggcattaatactgttaaaaatggtaatacaacaatcacattgaatgat
gctcctggtggtgctactaatacacctgcagtaacaatcagtggtggtaacttatccgtt
ggcggtaacaaggttactaatgtggatgatggtacagataatagtgatgcagttaacgta
aaacaattgaaagcagctaaaacagaagtaaaagctggtaagaatgtagttgttacatct
gaaactagtacaacagatggacatactacttatacagtaaacgcttctacacctgttgtt
tacacaacaccagatggtactactaagttgattaaacaaccagatggtactttcaaagat
gaaaacggcaatgtgtataatggtcctgtaatcgcatccttcgaagatggtactggtgct
agaactggtggcaacatgatcgttaacaacgttggttctgctatcaataatcatgcaaca
cctggtgtaacatctcctacatacttagataaattagatgctgcagctggtgataataat
acaaaaaatgcagctgttaacgtaactgatttgaaaaacactaaagatggtttagtagat
aaaggcttgaaattcgacgctaatgttggtggtgtaaaaactaacaaattaggttccact
gtgaaagtacaaggtgctggcactagtgcagatgctgattatagcggcacgaatattaag
actttcatcgaccaagatggtactggtaacactacaatcgacgtaaaactcgataaaaac
ctaaaaggtatcaataagatctccaatggtggttcttccattacgttgaacgatacacct
agtgcaactgttccagctgtaactattactggcggcaacttgtccatgggcaatggcaca
acaaataataaaattgtgaatttggctcctggtacagcagatactgatgcggttaatgtg
aaacagttgaaagatactgaattgcatattactcctggcacatatacacctgatactaat
aaaaaagttaaattaacatatacagatggtagtggcgctttagtatctggtaaagaagca
gttatcgatttatctggtttgtccacaggtggtgctacagcttctacttggaatgttaaa
tcatctgctaacactacagatggtggtgctgttggtgctactcatgatgcaaatgctcaa
aatattgctaatggcaaaactgtagaattccaatccggtaaaaacttggtagtaaaccaa
actaacgatactactaatggtaatgctactgttgaattctccttatctgataagatcact
gttggtaaagacggtgctaatggtaaagatggttctgttggtgctaaaggtgcagacggt
tctgctgttgttatgaatggtgcagatggttccatcggtctcaatggtacaaacggtgct
aatggtatctccattaaaggtaaagatggtgctaatggcgttggtattgatggtaaagat
ggtgtaactcgtattgtttacactgaaaaagtacctgatccagctaaccctagtacaact
aaagaagttactcacgaagtagcaactatggatgatggtttgaaatttactggtaacaac
actggtactgttaacaaacataaacttggttccttagtaaaagtacaaggtgaaggtgta
tctgctactgatgaagctgcatttgtttccgcaagtggcaatatcgcagtaactgctgag
aataatgatacattaacaattcgcttgaacaaaaaccttaaaggtttgaacagcatccaa
cttggtggtaacactattcaaagcaatggtgataacattactttcacaactaatggtggc
actacaaaaactgtagctactacagatcaattgtggacaatccaagctaatggtactgat
gttcctgctaaatctggcaaggtaaatcttgtagctggtgatcatatcacaattactcct
gatgcagctaatggcaaaatgacaatcagtgcaactggctttggttctatggatggattt
aatgtaaaaacatctgcagaatctactacagtaggtactcatgctggtgatacaacagaa
aacatcaaaaatggtaaaactgtagatatgcaagctggcaaaaacttggttgttactcaa
tccaatgatggtaatggcaatacaactgttaactatgcattgaacaaagatgttgatctt
ggtacaaatggttccttgaaagctggcgatactactattaataaagatggtgtgacaatt
gctaatggtccttccattactaagactggtgtagatgcaggtaataagaaaatcactaac
gtagctgatggtgatgtaaatgcaacatctaaagatgcagttaatggttcccaattgaag
aaatacactgatgcagcgaaaacaacagtagaagctggcgatactaacgttcaggttgag
actgataattcagcaacagatggtcatactaattacaaagtatccttgaagcctgttgta
gaaattggtgatactcacaaggttaaaatcgacggtcatactggtgacatcactggttta
acaaatgtaaatcttactgatcctacatttgcaactaaaggtcgtgcagcgactgaagaa
caattgaagcaagttcttactgaggctaagaataaagctatcgaaaaagtacaagctggt
actgcagctgctggtgatacaaatattgctacagtggctccaaaagctggcgatacattc
ggtacagctggtgcaacatatgaagtgtctgtatctaaaaatgcagttaaagatgcagct
aaagaagctgttaaagtaacttctgtaagccctgctattacagtaactccagatacatct
gtagctcatgaaactacttataaggttggtttcgatggtaatcaagctgcaactcaaatt
ccattgacatacaaacaaaacggtggtaatactcgtacagttaaattgtccgatggcttg
aacttcattgatggcacaaatacaaaagctcgtacagctgctgatggtaaagttacattt
gatgtaatgggtgatttaacaggtattacatccatctctaatgctgctggtggtcctaaa
atgacattcggtggtaactccatcaatgtaacaggtggtaaccttgatatgggtggtaag
aaaattactaacattggtaaaggtacagatccaactgatgcggcacgtgtaggtcaattg
actaaggtaacatctaacaaccactctgttgtagtaactaaaactacagatgctgatggt
gctccagtttacgatttggcagtaacaggcactccaggtgctcctgcagctgaccctcgt
gtagatatgcttggcgaagaaatcggtcgtgtaggtgctcaaggcgcagctctctccgcg
ttgaaacctatccaatacgatccattggaaccaactcaaatcatggctggttatggtaac
taccgtggtaactccgcagtggctcttggcgtagctcattacaaaaatgaatctacatta
atccatggtggcgtatcctgggctggtggttctagccacatgatggcaaacgctggtgta
acttggaaagttggtaaccgtgatagcgaagctgctgtagcagatcgttaccgcaaaggc
cctatcagttccgcgtatgcaatgcaacaagaaatggcagctatgaaagctcaaaatgcc
ggattaaaaggcgaagtatctgacttgaaagcagaaaatgaacaaatgaaagctcaaatt
gctgcaatgatggcaaaattaggtttataa
DBGET
integrated database retrieval system