KEGG   Vibrio anguillarum NB10: VANGNB10_cI0291
Entry
VANGNB10_cI0291   CDS       T03657                                 
Symbol
mshQ
Name
(GenBank) MSHA biogenesis protein MshQ
  KO
K12287  MSHA biogenesis protein MshQ
Organism
vau  Vibrio anguillarum NB10
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vau00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:vau02044]
    VANGNB10_cI0291 (mshQ)
Secretion system [BR:vau02044]
 Type II secretion system
  MSHA pilus biogenesis protein
   VANGNB10_cI0291 (mshQ)
SSDB
Motif
Pfam: DUF6701 Laminin_G_3 Bactofilin Sialidase
Other DBs
NCBI-ProteinID: CDQ49209
LinkDB
Position
1:352491..356876
AA seq 1461 aa
MSGGVCAQQYNLSNNQYPPCNTSWQKSGNSYTCSGNGQVTLNDGDVIVADVDSTLIANDG
FYLINNQVGNASNRISLQANYGAIASQGSQNTIYGDVSANSSNVTFNNTNLIGNVTTGGN
VTINGGSVQGNLTSNDRTVVITGANVVGNITAQSGIVITGSVYSGNITMTSNNSVTFNSV
DMTSGSVSGASHFTANNSQLGRPDSQVSISTTSNDITLNDSTAYGDFNAAINNAGGQVNV
NNSSITGTCSPISNPLNACDPSPVARYHFDEVQWSGAFNEVKNAFGSSLHGRAMNGALTS
SQSPALPANINNYGTCGYGEFVANQNQYVQVAHDSQLSFSDQLTISAWVYPVSRPANGGL
HTIVAKDTNYEFHLDSQGRVFWYWERSSGGANTLTTSNVIPLNTWTHITIRYNRSASSNE
RQKIYINGVVAATNSDNQPLKTNTVNLEIGRDYNSDNRTFSGRLDEVAIYNQALTDSQIV
NLYNERHLCQSSGLQCFSDDFQSQPLDEQWRVFSSSGNFTPSITNNRMRLTQAVQNQATA
STFQRIFPAAGNRVEVEFDYFAYGGNGADGVAIVFSDASVTPQVGAFGGPLGFGYKVNEQ
KPGFAGGWLGIGLDEYGNYSIEGGGNGPGRRRQAVVLRGSGSGYSGYNYLAGTCNNGTTN
TNGDCLNPRVDNTNGNPQHRYRIVIDSTQASTSLVTVSRKVGTDSWKTLIGPVDVMSFAA
QQNVPTDLFMSITGSTGSSTNNHEIDNFEVCALNSRPVGEQINHFRISLPAQGLTCAASD
VSVTACADENCNNLFTDPVIAYLVPNSLPSATGGWVNGSTISFSNGVGNAQLRRNSAGNV
TVDVSGSVPTAMSFNNTLCSHNGNAGPFLASNCTMNFADSGFILDVPNSYANQSVTGTIK
AVRKDNASQLCLPSFQNVQKPVSFWSDYLTPNGGQGFSALSVGVNSVAVGQSSNTATPVV
LNFNQNGEASINVSYREAGSLALNARLTGSGDEQDLQLTGQTTFIRVPRALVLSATSYYG
VSGACPNADISCDIFARADENFNLNIKAVAAEPNEDNDFTNNLGLTNYQQQSITLDHVLR
EPASGSAGAIGTLNYDHELGEVTTVQQSVTEVGVFDFLLVPPTSYLGIDLIEAGLPIAVT
STGPIGRFIPAYFAVSPMTVTLAAACNSGENSFTYLGQPFSYASNPGLYLQPKSGSGSDT
LNYLIGDWWRYNNQWSDRAYNDAVDGLTIDFTNELIGPVTRQAASTSGVILNNEQLRYQK
PVDLSVPFNADFNLLLSVNDLRDSDDVCYRTSYSEPCLDYTFENIDQTMTLYWGRLTIED
VYGPETQGLQQKIISEYNTSAGFVTNTHDNCTELPQLSVFEFESEDFSVNQAGSKPPVTV
TMQPDTSPLTLDQGVRRLDYTAPGVGNRGVIKALLDLEEHGLPWLRRYNSQSGTWDDSIS
GRVQFGLYRGSDRVIWWREKN
NT seq 4386 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagcggtggggtttgtgcccaacaatataatttatccaataatcaatatcctccttgt
aatacctcgtggcaaaaatctggcaacagttatacctgtagcggtaatggtcaagtgacg
ttaaatgatggtgatgtgattgtcgccgatgttgactcaacactgatcgccaatgacggt
ttttatttgattaataaccaagtgggtaacgcatcaaataggataagtctgcaagcgaac
tacggagcgatagccagccaaggctctcaaaatacgatttatggggatgtttcagccaat
agcagcaacgtaactttcaataacaccaatttaattggtaatgttacgacgggaggaaac
gtcactatcaacggtggtagcgtgcagggtaatttaaccagtaatgatcgaacggttgtt
attactggagcaaacgtggttggtaatattacggcgcaatcaggcattgtcattacagga
agtgtgtatagcggcaatattacgatgacctctaataactctgtgacgtttaattcggtg
gatatgacttccggttctgtatcaggggcaagtcatttcacggcaaacaatagccagcta
ggaaggcctgattctcaggtcagtattagtactacctctaacgatatcaccttaaatgac
tcaacggcttatggtgattttaatgcggcaattaataatgctggtggccaagttaatgtc
aacaatagttcaattactggtacatgttcccccatatctaatccattgaatgcttgtgat
ccctctcctgtagcgcgctatcattttgatgaagtgcaatggagtggggctttcaatgaa
gtcaagaatgcgtttggctcttctcttcacggccgcgcaatgaatggagcgcttaccagc
tctcaatcaccggcgctacccgccaatattaataattacggtacttgtggttatggcgag
tttgttgccaaccaaaaccaatatgtacaagtggctcatgatagccagttatccttctcg
gaccagctaacgatatctgcgtgggtgtaccccgtcagtcgcccggcgaatggtggcttg
cataccatagtggcgaaagatactaactacgaattccaccttgatagccaagggcgagtt
ttttggtattgggagagaagttctggcggtgccaatacattaaccacatccaatgttatt
ccgctaaatacttggactcatatcaccattcgctataaccgctcagcaagtagtaatgag
agacaaaaaatctatattaatggtgtggttgcggcgacaaacagcgataatcaaccactc
aaaaccaatacagtgaatttggagattggtcgagattacaattccgacaacagaactttc
tccggaaggcttgatgaggtggctatttataatcaagctctcactgatagtcagattgtc
aatctgtataacgaacgccatctgtgccaaagttcagggctgcaatgttttagcgatgat
ttccaaagtcagccattggatgagcagtggcgagtattcagtagcagtggcaactttacg
ccttcaatcaccaataatcgcatgcgattaacacaagcggtgcaaaaccaagccaccgct
tcaacattccaacggattttcccagcggcagggaaccgtgtagaggttgaatttgactat
tttgcctatggcggtaatggtgctgatggggtggcgatcgtcttttctgatgcctctgtc
actcctcaagttggagcatttggtggtcctttaggttttggttataaagtcaatgagcaa
aaacccggatttgcgggcggctggttaggcattggattggatgaatatggtaattattcg
attgaaggtggcgggaatggcccaggtcgtaggcggcaagctgttgtattaagaggttct
ggttccggctatagcggttataactatttagcaggcacgtgtaataacggcacaaccaat
accaatggagattgcctaaatccgagggtagacaataccaatggtaatcctcagcaccgc
taccgaattgttattgactcaactcaagcttcaacgtcgctggtgaccgtaagccgtaaa
gttggcactgacagttggaaaactttaattgggccagttgatgtgatgtcatttgcggcg
caacaaaatgttcctacggatctgtttatgtccattacaggttctacaggctcttcgact
aataaccatgaaattgataatttcgaagtctgtgcgctcaattctcgtccagttggtgag
caaattaatcactttcgcatctctttgccagcacaaggtttaacttgtgcagcctctgac
gtgtctgtgacggcgtgtgccgatgaaaattgcaataacttatttaccgatccggttatt
gcttatttagtccctaactctctacctagtgcaacgggcggttgggtgaatggttcaact
atctcatttagcaatggggttggtaacgcccaacttaggcgtaacagcgcaggtaatgtc
accgttgatgtttctggttccgttcccacggctatgtctttcaataacactttatgcagc
cacaatgggaatgctggcccctttttggccagtaactgcacgatgaactttgctgacagt
ggcttcattttggatgtacccaattcctacgccaatcaatcggtaactgggaccattaaa
gcggtacgaaaagataacgcttcacaactgtgtttgcctagttttcaaaatgtacagaaa
cccgtttccttttggagtgattacttgacccctaatgggggacaaggttttagcgcttta
tcagttggtgtgaatagtgtggcggtagggcagtcatccaatactgcgacgccagtggtg
ctcaatttcaaccaaaatggtgaggcgagcattaacgtctcctatcgtgaggctggtagc
cttgctttgaatgcccgtttaacgggaagtggcgatgagcaggatttgcaactaacaggt
caaacgacttttatacgagttcctcgtgcgttggtgctcagcgcgaccagctattatggt
gttagtggagcgtgtcctaatgccgatattagctgtgatatttttgctagggcggatgaa
aactttaatctcaatatcaaagcggttgcggctgagcccaatgaagataatgattttacc
aataatttgggtttaactaattaccaacagcaatcaataactctggatcatgtactgaga
gagccagctagtggttctgctggtgctattggtacactgaattacgatcatgagctggga
gaggttacaaccgttcaacagagtgtgactgaagttggtgtgtttgattttttattagtg
ccaccgacttcttatcttggcatcgatttaattgaagctggtttgccgatcgctgtgacg
tcaacagggccgataggccgctttatcccagcttattttgctgtctcaccgatgacggtt
acattagcagcagcttgcaacagtggtgaaaactcttttacctatttaggacaaccgttt
tcttatgcgagtaatcccgggctctatttacagcctaaatcaggtagtggttctgatacg
cttaattatttaattggcgattggtggcgttataacaaccaatggtcggatagagcttat
aatgatgctgttgatggcctcacgatcgattttacgaacgaattgataggaccagtgacg
cgtcaagcagcatcaactagtggtgtgatccttaataacgagcaactgcgttatcaaaag
ccagtggatctgagtgtgccgtttaatgcagactttaacttactcttatcagtcaatgac
ctaagagatagtgatgatgtttgttatcgaacgtcttactcagagccttgcttagattat
acctttgaaaatatcgaccaaaccatgacactgtattggggacgtttaaccattgaagat
gtctatggccctgaaacacaaggcttacagcaaaaaatcatcagtgagtataatacctca
gccggatttgtgaccaacactcatgataactgtactgagttacctcagctaagtgttttt
gagtttgaatcggaagattttagtgttaaccaagctggatctaagcctcccgttaccgta
accatgcagccagatacaagcccattgactttagatcaaggggtgagaaggctagactat
accgcgcctggggtaggcaatcgcggtgtgatcaaagcgctactcgatttagaagagcat
gggctgccttggttacgccgttataattctcaaagcggaacctgggatgatagtatctca
ggccgagtacagtttggattgtaccgaggcagcgaccgggtaatctggtggcgtgaaaaa
aattaa

DBGET integrated database retrieval system