Vibrio anguillarum NB10: VANGNB10_cI0808
Help
Entry
VANGNB10_cI0808 CDS
T03657
Name
(GenBank) putative uncharacterized protein
KO
K20952
rugosity and biofilm structure modulator C
Organism
vau
Vibrio anguillarum NB10
Pathway
vau05111
Biofilm formation - Vibrio cholerae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vau00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
05111 Biofilm formation - Vibrio cholerae
VANGNB10_cI0808
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prism_lec
Crystall_4
FG-GAP_3
FG-GAP
TcdB_toxin_midN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDQ49722
LinkDB
All DBs
Position
1:952453..955323
Genome browser
AA seq
956 aa
AA seq
DB search
MTIKYLVFAVGMISLGGSMVQAADQEGCIISRKTGDKYCLNIGQRSEYSLPSWIYNHQVD
VLAPSGVSVMLSDWDNLSYNRLAVFDHYTDNSELKNVKALNGQALDFSHPRSMRVLASEL
YPEACIVSRENGERFCLKEGERSGYSLPSYIYGHAVDIVAPEGLGVILSDWDNLSYNRLA
VFGGNTSNAQLKSVKAYNGELLDFSHPRSMRVVSFDVPSDTISTQLKWSWQGGGFKPLSN
QVMATPVVAQLNDDNGDGNIDEKDIADLIVVTFEGSKYVNGGLVRALSGVDGSELWSYEQ
GEAIADARYSPAVADLDGDGVVEIVTTNTSSSYLNILDNNGHVKKQILKAQTGGRSVGSI
TLADLDGDGSVEILSSDGVYNYESGLVFSHPWAPSSINVDIDGDNSQEVFSGGVMYQNSG
AVNWQYLANDMVWFSSLVNLDNDERPEIVASVPAAFATGENARFAVLEHDGTVKWEVNNS
TNPGGGVQAVSNFLGKAKVIENNEWSKVYGYRSHTNPSTITITSDAKLSVRSGLAIDAVG
SSAQSLIGGRGGNLSQPVNIKDVKSVDVTWGKYYWGGYHVVALDFRMSNSSIIRMGSKKY
AYSKQTESFNVPADSQIKSIKVWTEGWLVDGLQFELASRSGSNDIDVKGIVYAGYTAVDM
YNSKGDRVWSAANDDTGSGKIGVSAYDFDGDGIDEVIVQDHARVRILDGRTGQERASFAH
STSTLWEYPIVVDLAGDNNAELIVVANDFDKNYVVNHGVFVYESADSAKPWKNATRIWNQ
HAFHLTNVTQDGVVPTNATPSWLSHNTYRSSTLRATVGGESPIFGYSNTQQSQRVVTADN
QMYLRSGFAIDAIGTTANNLVGGPVQGTNGGVLRAPIALDQLQSVEVTSGLYNWGGYHIV
AIKFTMKDGSSVLLGSTHYASNKKVETYTVPQGKRIKQINVWTGGWLVEGLQFVFD
NT seq
2871 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaataaaatatttggttttcgctgtaggaatgatctcattgggtggctcaatggtt
caagctgcagatcaggaaggttgcattattagccggaaaaccggagataagtactgccta
aatatagggcagcgttcagaatattcgctaccatcttggatttataatcatcaagttgat
gttttagcacctagtggtgtttcagtgatgctcagtgactgggataatttatcttacaat
cgcttggcagtttttgaccattatactgataacagtgagttaaaaaatgttaaagcattg
aacgggcaggctctagatttttctcatcctcgttccatgcgtgtccttgcatcggaactt
tatcctgaagcttgtatcgtgagccgtgaaaatggtgagcgtttttgtcttaaagaaggt
gagcgttctggttattcgctcccttcctatatctatggacatgctgtcgatatagtcgct
ccagaaggtcttggagtgatacttagtgattgggataatttgtcctataaccgtttagct
gttttcggtggtaatacatctaatgcacaactgaaatcagtgaaagcttacaatggtgaa
ctccttgatttttcacaccctcgttctatgcgagttgtgtcatttgatgtaccttctgac
accattagcacgcagttgaaatggtcatggcaaggcggtggctttaagccattatcgaat
caagtgatggcgactccagttgttgctcaactgaatgatgataatggcgatggtaatatt
gatgaaaaagacattgctgaccttatcgttgtgacgtttgaagggagcaagtatgttaac
ggaggcctagttcgagctttaagcggtgttgatggctcggagttgtggtcttatgagcaa
ggtgaagccattgctgacgcaagatattcaccagctgtcgctgatttagatggtgatggt
gtagttgaaatcgttacaaccaatacatctagctcctatttaaatattttggataacaac
ggtcatgtaaagaaacagattctcaaagcacaaactggaggccgttcagttggctctata
accctcgcagatcttgatggggacggtagtgtcgagattctatcttcagatggcgtttat
aattacgagtcaggtcttgtatttagtcatccttgggccccatcttctattaatgtggat
atcgatggcgataattcgcaagaggtcttttctggtggtgtaatgtaccaaaacagtggt
gccgtcaattggcagtatctagccaatgatatggtgtggttttcatcgctcgttaatttg
gataacgatgagcgtccagaaattgtggcttcggtcccggcagctttcgcaacaggcgaa
aatgcacgatttgctgttttagaacacgacggtaccgtaaagtgggaagtgaataacagt
acaaatccaggtggtggcgtacaagctgtttctaatttcttaggtaaagccaaagttatc
gaaaacaatgaatggtcaaaagtctatggatatcgttctcatactaatccatcgacgatt
actatcacatcggatgctaaattatcagtacgctctggtttagcgattgatgctgtgggg
agctcagctcaatcacttattggtggccgtggtggtaaccttagccaaccagtcaatatc
aaagacgtcaaatctgttgatgttacttggggtaagtattattggggtggttatcatgtc
gttgcgctcgatttcagaatgagtaatagcagtattattaggatggggtcgaaaaagtac
gcgtattctaagcagaccgagagttttaatgtgccagccgatagccaaattaagagtatc
aaagtgtggactgaggggtggctagttgatggtttgcaatttgaattggcttctcgtagt
ggctctaatgatattgatgtgaaaggcattgtttacgctggatatactgctgtggatatg
tacaacagtaaaggtgatcgcgtctggtctgctgctaacgatgatactggcagtggtaaa
attggtgtttctgcttacgattttgatggcgatggtattgatgaagttattgttcaggat
catgccagagtgcgaattcttgatggacgaacgggccaggaaagagcctctttcgcgcat
tcgacctcaaccttgtgggagtacccgattgttgttgatcttgcgggggataacaacgca
gagctgattgttgttgcgaatgattttgataaaaactatgtcgttaaccatggtgtgttt
gtttatgaatctgcggacagtgcaaaaccttggaagaatgcaactcgcatctggaaccag
catgctttccatctgacgaatgttactcaagatggtgtagtgcctacaaatgcgacacca
agttggttgagccataatacataccgttcgagtacattacgtgcaacggtgggtggtgag
tctccaatttttggttactcaaatactcagcaatcgcaacgtgtcgtgacggcggataac
cagatgtatctgcgttctggttttgcgatcgatgcgatcggcacgacggccaataacttg
gtgggcggcccagtacaaggtactaacggtggtgtgctaagagcaccgattgctcttgat
caattgcaatccgtggaagttacctctggtctttataactggggtggttaccacatagtg
gcgattaagttcacgatgaaggatggctctagcgtgttattgggttcaacccactatgcg
agcaacaaaaaagttgaaacgtacactgtgccgcaaggtaaacgcatcaagcagattaat
gtttggactggtggttggttagttgaaggcttgcagtttgtattcgattaa
DBGET
integrated database retrieval system