Vibrio anguillarum NB10: VANGNB10_cI1231
Help
Entry
VANGNB10_cI1231 CDS
T03657
Name
(GenBank) Putative uncharacterized protein
Organism
vau
Vibrio anguillarum NB10
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_4
HemolysinCabind
Big_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CDQ50145
LinkDB
All DBs
Position
1:1448656..1454061
Genome browser
AA seq
1801 aa
AA seq
DB search
MELGSFSLGTTLTFGQMIVVDANGNVRVLQPGEKTLPGEIIISASNATPNDVGNNNDVQI
SRVNADGRNVDITNDINEIFAALEQGQDPTQLGEDLATAAGESNGSSPTGSVSIARDASE
TIAATEFSTSALTALGLSETQSLTLLESYSQSALGSIVTGINGANDGAKITGDDSGSVTE
DAADNTATGTLTSKDVDNTDNEFQAQTDAPGQYGTFSVDANGKWTYVLDNSNEKVDALNE
NQTLTETFTVKSEDGTEQQVTITINGANDKADIQGAVSGSVTEDAADNTATGTLTSKDVD
NTDNEFQAQTDAPGQYGTFSVDANGKWTYVLDNSNEKVDALNENQTLTETFTVKSEDGTE
QQVTITINGANDKADIQGAVSGSVTEDAADNTATGTLTSKDVDNTDNEFQAQTDAPGQYG
TFSVDANGKWTYVLDNSNEKVDALNENQTLTETFTVKSEDGTEQQVTITINGANDKADIQ
GAVSGSVTEDAADNTATGTLTSKDVDNTDNEFQAQTDAPGQYGTFSVDANGKWTYVLDNS
NEKVDALNENQTLTETFTVKSEDGTEQQVTITITGTNDAAIIAISSIAPLSEEGLSGGLQ
DDIGSSDTSDAVKASGTITIDDVDSDSVEITLSGPVGIMSGGMEVVWEWDAQNHKLIGST
FGSDSKSVIEIELTAPNASGKGEWNYTVTLLNPVDHPDGSQEDTLSLDLGVFVSDGQTTT
ESKLSIIIEDDAPSNHVMEPIAATVTDIPDVLIGQFDLTSYRGDRTTIDGGQFTITAKGF
SSALSSTLVSANINGDSEGIGVSSKDSPYHNLTNEVDFRKFSDGSSASEELVIKLDPNTV
AYGAKIEFSKMFGGEGESGIVEFWRDGKLIATQSFTSDENRGDYAKDFSVQQGGFDTMVI
KATDNGNSFNHKDNSDFTVKNIEFLGSDAPQPIAYGSGVVEPQWGADGRGALQLVGLDES
ATLKTVTGSDITVGLVGANTLTGKDAEGHLVFKLEFTPTTGKWEFYQYQNIQSPSGDGDI
DFQVKVTDADGDSAVLGFAVKPVSPPVIGELTLNVSEEGLQGGIADDASITGSQDTTNQT
SVEGQLNIANTSELSMGIPVGTYTSNGVAITWNLSSDKQRLIGTVADNKVVEITVDNQGK
VTSQLHAVFDHTNNGGEDDLVIDIPIEAQNSSGISSTSTITIVIEDDAPIANADVASINV
LADSFNFNGVSAKWSNIAGGSNITIYDSRDADPDLDQVRWGTSAGYGQSGYGFIDNDSGL
AGNIALNELVQLGTFTHYNYPIYDSITGATLDVTFSVTDAYGRVTPVTITVNFAHNETPN
NQSDPRDIITIESQSVTFEFEGKMYTVEVLGFVDKNGNVINSIKTDENASNQFDLVAKIV
EGSGYHLPSALGNVMHNDLHGADGSLTVIGCVNGETSSSINTGVGTKVIGLYGELILMAD
GSYTYQVTEDASKIPLNAQEVFSYTVRDNDGDAANSTLTISVNAVDKNGVPVGLPLTVEG
NDLNDMIVIRNGENSQHPDRFDVAFGGNLLGTVRDVHGNENHIHVGQGYNNGSQNQTVSG
GSGNDHIETGSGNDVIYAGMTGSHGYSSDDDLELSASEIANHHVMTGNLSGTDSMLDNDG
LLLSNDVSSRNADVVNSGSGNDRIFGQSGSDILFGHTGDDYIDGGSHNDGLRGGKGNDTL
IGGLGSDILTGDSGADIFKWVEMETATDRVTDFHRSEGDSLDFSDLFEDMSKDEITVLLD
GLSSADHQGVADDVSIRVIGNEHESHLTIVKSGQTLTVDFDGASAADITSSLMDNLNHLK
D
NT seq
5406 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacttggttctttttctttaggtacaacattaactttcggtcagatgatcgttgtg
gatgcaaatggcaatgtacgggtgcttcagccaggagaaaaaaccttgcctggtgaaata
atcatcagtgccagtaacgctaccccaaacgatgtaggcaataataatgatgtacaaata
tcaagagttaacgccgatggtcgcaacgtagatataactaatgacatcaatgaaattttc
gcagcattagagcaaggccaagacccaacacagctaggcgaagatcttgcaactgcagcg
ggtgaatcgaacggttcaagcccgacgggttcagtcagcatcgctcgcgacgcttcggaa
accatagccgcaacagaattctccacgtcagcactcaccgcgctaggcctctctgaaaca
caaagtttaacgctattagaaagctattctcaaagtgctttagggtcaattgtgacgggc
atcaatggtgcgaacgacggcgcgaaaatcacaggcgatgatagcggcagcgtgaccgaa
gacgcggcggataacaccgcgacgggcaccttgacctcaaaagacgtggacaacaccgac
aacgagttccaggcgcaaaccgatgcgccgggccagtacggcacgttcagtgtggatgcg
aacggcaagtggacctacgtgctggataacagcaacgagaaggtcgacgcgttgaacgag
aaccagactctgactgaaaccttcacggtgaaatcggaagacggcacagagcaacaagtg
accatcaccatcaatggtgcgaacgataaggcagacatccaaggcgcggtgagcggcagc
gtgaccgaagacgcggcggataacaccgcgacgggcaccttgacctcaaaagacgtggac
aacaccgacaacgagttccaggcgcaaaccgatgcgccgggccagtacggcacgttcagt
gtggatgcgaacggcaagtggacctacgtgctggataacagcaacgagaaggtcgacgcg
ttgaacgagaaccagactctgactgaaaccttcacggtgaaatcggaagacggcacagag
caacaagtgaccatcaccatcaatggtgcgaacgataaggcagacatccaaggcgcggtg
agcggcagcgtgaccgaagacgcggcggataacaccgcgacgggcaccttgacctcaaaa
gacgtggacaacaccgacaacgagttccaggcgcaaaccgatgcgccgggccagtacggc
acgttcagtgtggatgcgaacggcaagtggacctacgtgctggataacagcaacgagaag
gtcgacgcgttgaacgagaaccagactctgactgaaaccttcacggtgaaatcggaagac
ggcacagagcaacaagtgaccatcaccatcaatggtgcgaacgataaggcagacatccaa
ggcgcggtgagcggcagcgtgaccgaagacgcggcggataacaccgcgacgggcaccttg
acctcaaaagacgtggacaacaccgacaacgagttccaggcgcaaaccgatgcgccgggc
cagtacggcacgttcagtgtggatgcgaacggcaagtggacctacgtgctggataacagc
aacgagaaggtcgacgcgttgaacgagaaccagactctgactgaaaccttcacggtgaaa
tcggaagacggcacagagcaacaagtgaccatcaccatcacgggcaccaacgacgcggcg
atcatcgcaatctcaagcattgctcctctctccgaggaaggcttatctggtggacttcaa
gatgatattggatcctcagatacaagcgacgcagttaaggcatctggcaccatcacaatt
gatgatgtagatagcgattccgtagagatcactctttcgggcccagtgggcatcatgtcg
ggaggtatggaagtcgtttgggaatgggatgctcaaaatcacaagctgataggctctaca
tttgggagtgattctaaatccgttattgaaatcgaacttactgctcctaatgcaagtggc
aagggcgagtggaactatacagtcactttactcaaccctgtcgaccatccagatggctcc
caagaagatacactgagtttagatcttggcgtatttgtttcagatgggcaaaccacaacg
gaaagcaaattatcgatcatcattgaagacgatgcacctagcaatcatgtgatggaacca
attgctgccacagtaactgatattcctgatgtgttaattggccagtttgatctaacgagt
taccgtggtgataggactacgattgacggtggtcaatttactattactgcaaaaggattc
tcttcagctttatcatctacgttagttagtgcaaatattaatggtgacagcgaaggtatc
ggcgttagtagtaaggattctccgtaccataaccttactaatgaagttgattttcgtaag
ttttcagatggcagttctgcatccgaagagttggttattaaactcgatcctaacacggta
gcttatggtgcgaaaattgagttcagcaaaatgtttggcggtgagggcgaaagcgggatt
gttgagttttggcgagatggaaagctgattgcaactcaaagttttacctctgatgaaaac
cgtggagattacgctaaagacttttctgtgcagcagggtggctttgatacgatggttatc
aaagctactgataatggtaactcgttcaaccataaagataatagtgactttaccgttaaa
aatatcgagtttcttggttcggatgcgccgcagccaattgcttatggttctggtgtcgtt
gaaccgcaatggggggccgatggtcgaggggcactgcaattagttggcctggatgaatct
gcgacactcaaaacggttactggctctgacattactgttggattagtaggagcaaatact
cttactggtaaagatgcagaagggcatttagtcttcaaactcgagtttacaccgacaacg
ggaaaatgggagttttaccagtatcaaaatatacaatcgccgtcaggtgatggagatatt
gatttccaagtgaaagttactgatgccgatggtgacagtgctgtgcttggttttgcggtc
aagcctgtgtctccaccggttattggtgaattgacgctcaatgtttctgaagaaggatta
caaggcgggattgcggatgacgcatctatcactggttcacaagacacgactaaccagacc
tcagtggaagggcagcttaatattgcgaacacctctgagctttctatggggattccggtt
ggtacttacacttctaatggtgtagctattacctggaacttatcttcggataaacagaga
ctgattggaacggttgctgacaataaagtggtcgaaattaccgtagataaccaaggcaag
gtgactagtcagttgcatgctgtattcgaccacacgaataatggtggagaagatgacctt
gtgattgatattcccattgaagcacaaaattcaagtggtatttcgagcacaagtacaatc
accattgttatcgaagatgatgcccctatcgctaatgcggatgttgcttcaatcaatgta
ttagccgattcatttaattttaacggtgtttcggctaagtggagcaatatcgcaggtggt
tcaaatattacaatttatgattcgcgcgatgctgaccctgatttagaccaagtacgctgg
ggaacgagtgcagggtatgggcaatcagggtatggttttattgataacgatagtggattg
gctggaaacatagctctcaatgagctagtccaactaggaacctttactcactataattac
cctatctatgactcgattacgggggcaacactagatgtaacgttttcagtaaccgatgct
tatggtcgagtaacgcctgtgacgattacggtgaattttgcccataacgaaacaccaaat
aatcagtctgatccaagggatatcattactattgaaagtcaatctgtgacttttgaattt
gaaggtaagatgtatacagttgaagtcttaggttttgttgataaaaacggtaatgttatc
aactcgataaagacagacgaaaatgcatccaaccagtttgacttggtggcaaagattgtt
gaaggaagtggttaccatttgccaagtgctttaggtaatgtaatgcataacgatttgcac
ggtgccgatgggtcattgacggtcatagggtgtgtgaatggagaaacatcaagcagtatt
aataccggtgttggcactaaggttattggtttgtatggcgagctgattctgatggctgat
ggtagctatacttatcaagtgactgaggatgcctctaagatccccctcaacgcacaggaa
gtttttagttataccgtgagagataatgatggtgatgctgccaatagtactttaacgatt
tcggtcaacgctgtagataaaaatggtgtacccgtaggtttaccattgacggttgaaggc
aatgatttaaatgacatgatagttattagaaatggtgaaaactcacagcacccagataga
ttcgatgttgcttttgggggtaatttgttaggtacagtacgtgatgttcatggcaatgaa
aaccatattcacgtcgggcaaggttataataatggctctcaaaaccaaactgttagtggt
ggatcggggaacgatcatattgagacgggctctggaaatgacgtcatttatgcaggaatg
acgggatctcatggttacagtagtgatgatgatttggaactttctgcgtctgagattgcc
aatcatcacgtaatgacaggcaatctttctggcactgattcaatgttagataatgatggt
ttgttattatcgaacgatgtatcaagccgtaatgctgacgttgttaatagcggtagtggc
aatgatcgaatatttggtcaatctggctctgatatcctttttggtcatactggtgatgat
tatattgatggtggttctcacaacgatggtttgagaggtggtaaaggtaacgacaccctt
attggcggccttggtagtgatatcttaacgggtgatagtggcgcagacatattcaaatgg
gttgagatggaaaccgcgactgaccgcgttactgacttccatcgttcggaaggggattcg
ttagatttttccgacttgtttgaagacatgtctaaagacgagatcacagtattacttgat
gggctgagtagtgcagatcatcaaggtgttgcggacgatgtatctatccgtgttatagga
aatgaacatgaatcgcacctaacgattgtcaagtcgggtcaaacattgaccgtggacttt
gatggtgcgtcagctgcggatatcaccagtagcttgatggataacctaaaccatttaaag
gactaa
DBGET
integrated database retrieval system