Verrucomicrobia bacterium S94: EGM51_12880
Help
Entry
EGM51_12880 CDS
T05990
Name
(GenBank) RHS repeat protein
Organism
vbs
Verrucomicrobia bacterium S94
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
TEN_YD-shell
DUF6531
Transglut_core
RHS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QBG48242
LinkDB
All DBs
Position
complement(2947046..2953048)
Genome browser
AA seq
2000 aa
AA seq
DB search
MMKKKQVVTFLISTAMSFCSFGNTLIFTPADAVSPTFEGEDSVAFSVSNFVSALSLAEFD
IESPDAGRVDGSSLSSVRSASSEAFSNASSVIEELAYALEYNPTNIYEFVRNQIHSEFYV
GNKRSPERVIQDGAGNDCDQASLLIALLEASGYGASYNFGAVILPVFDNEGCNLSTMLNV
DSVDDAFAILSAEQLPVYYYDGDTLVNIAYTWVTLTNGSEVIELDTFFKPYEYTDGVGID
ALSSYVRSNLYAEVGGVVSNHSFSGFNEDGLYAYLTGLTTNLCAEFRSQLPNGSPADFFG
DKHIVQESGLNPPRFTVYSSTAYQNKDDLPTGSQQLGIYAEGEMHYISLPDLGTRTVYIE
INDSGYGRVLLGDEVWVEGSIGGMDGGRYVVPISIVFPIFTYSNSSYTLTGYDSLKTYTG
VLGAQYAFPIQFNDLGNKAASAACAEELAECLSGAGSGDPILLGLQQLGTDYFHLQGLFR
RLSEGLYGKISHQVYAAGVFIQSDYPNALCDVQHGADNLYTHETKIERTSAQGLISSALE
HGIWEQNQPGWLAVSSVRGIAEHCRKGGTVFRVTADNFASVEAQLSGYTSDELDSFEALL
TADTECLILPDTPVSVGQWTGIIYLGVSTNGGITAALDKTNGGAVDRSSRIGPTLINAQN
LADFKEAANIRTPKGADPVDMASGNYLLEKTDLTMDGPMPLVMKRNYSSGSADAKTALGY
GWNHSFNMYVQEHTSPDSLMDRSLEDIAGAAVAYQAMLDILQSEDTARSWTVASLIAEWA
VDRLAGTAVTVYTGQKAATFVKQPDGSFTPPEGMTVSLTETNGVYVMQERHGNTYAFNTN
GLIDTIEDPYGNTLTFEYSGGTNLNSVQSSFGPEMTFSYTDGLLTSVSDNAEPVRTVYYQ
YDSDENLTNVVDAAGFDWSMGYDSAHQITWVRDPENITLVRNAYNSVGQVTNQISASGHR
WLNRFIGNCSIEEDPLGNQTKYYFDSTGRTWSEEKADGSRTYTFFDGQGHITGTVNERGV
TNRFVYDTDHNLLMQVHAEGTAEQTITAYAYDSEHHLRLVTNAVGTAEQLVTEYAYTDEH
AVDYTVSAKGSEEEAVTDYSYTAQGLLRQLSEGNGKRITVYSDFDSYGNAQMVTSTDAGT
VSRVFNAKGDLKTLTVGGKTTAYGYDDLRQLIAVTNALGTADQTVISKAYYGNGLLRTST
DARGKTSIFYWTPAYKPAGTLFPDGGSSTNLYDEADRLVMSCDPEGSCVTNTLDSAGRPV
SVSSMYSVVTNQFDTLGNLTNSVVDPSGLQIESRFVYDSLGRMTHRFRPIGYEEYQMDGL
GRVTNRVDAASKEWKTEFDALGRVKNSFRPSGVNEEYGYDDLGNRTVFRNAEGKPVYFGV
DAQGRVTAITNAIGKVTAFTYDAVGNLDSRIDAAGVLTEYGYDALNRLTAITNQGVEVAA
FDHDANGNIIEHASPHASCTFGYDEMNRLVFSTQLCASVCSVVENQYDLNGNRTNIVYPG
GLSVGYHYGADNRLESVTTEYAENTESFVFNYDSANRLTGMDYPNGVHSTFGYDAESRIT
SIQHGDFVDREIHRNTLGFKTTECINAGIKSAVQETARRIKTHNDADQLIFERVQQGTNW
TDVAYSYSDNGCLTNITTEGSETQRFGYDYDNRIVNADGTSCSVEYLYDATGARIGRICT
AGVSPTAVTTNYFIIDYTDGLKRPLAETDSAGSVTRYYIWAGMRLLAHIEANGDAYCYHQ
DELGSTLALTDESGAVTDQFAYMPYGAATRTGSTDAPFQWLGGYGVYYDIDTELHLTLHR
AYSCSLKRFIGPDPLGIDGGVNIYMWANMNPLFFVDPYGLAAFYLHADNADFGDMGHGWF
TLENDAGERNSYGLYPKGGIGKLSAWFSDGVPASIHKTSGDQGNGFQDSPTSIADATLRI
PITQEQYDKVQKLADGLIAIEDQVVWSKHFNCVDYVQLYAAYAGINFGDDLKNIFGLSTP
NQLEKWINEQREKQNVEINK
NT seq
6003 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaaaaaaagcaggttgttacctttttaatttcgacagctatgtcattctgttca
ttcggaaatacattgatattcactccggcagatgctgtttctccaacattcgagggggag
gattctgtagcgttttcagtgtcgaattttgtttctgccctttctcttgctgagtttgat
atcgagtccccggatgcagggagggtcgatggctcttctttatcatctgtccggtcggct
tcctctgaggcgttttcaaatgcttcttcagtcattgaagaactggcttatgcgctcgaa
tataatcccactaatatttatgagtttgtacgaaatcagattcattcagaattttatgta
ggaaacaaacgctcaccggagcgggtaattcaggacggtgcgggaaatgactgcgatcag
gcctcgctgctgattgcgctgctggaagcttcggggtatggcgcatcctataatttcggg
gccgttattctgcctgtatttgataatgaagggtgcaacctaagcactatgctgaatgtc
gacagtgttgatgatgcatttgccatattgagtgcggaacagctgcccgtgtattattat
gatggggatacactggttaatattgcttatacctgggtgacgctgaccaatggcagtgag
gtgatcgagctggatacctttttcaaaccgtatgaatatacagacggggtcggaatagac
gcactttcttcttatgtgcgcagtaatctttatgccgaagtggggggtgttgtttctaat
cacagtttttcaggttttaacgaggatggtctgtatgcctatctgacagggttgactacg
aatttatgtgctgaattcaggtctcagcttccgaacggttcgccggcggattttttcgga
gataagcacattgtgcaggagtcgggtttgaaccctccccgttttaccgtttattcgtcc
acagcatatcagaataaggatgatctgccgacaggcagtcagcagttgggaatttatgcg
gaaggtgagatgcattatatttcattgccggatctgggcacgcggacggtttatattgaa
attaatgattccggttatggacgggttcttctgggggatgaagtctgggtggaagggagt
atcggcgggatggacggaggtcgctatgtggtgccgatcagcatcgtgtttccgattttt
acttacagcaattcttcgtatacgctgaccggttatgacagtttaaaaacctacacgggc
gttttgggggcgcagtacgctttcccgattcagtttaatgatcttgggaataaagccgct
tctgcggcctgtgctgaagagctggcggaatgtctttccggggcgggttccggagatccc
attctgcttggactgcagcagctgggtacagactatttccatcttcagggccttttccgt
cggttgagcgaagggctgtatggaaaaatctctcatcaggtttacgcagccggagtattt
atccagtcggactatcctaatgcactctgtgatgttcagcatggagctgacaatctgtat
actcatgagaccaaaattgaacgtacatcggctcaggggctgatcagcagtgcgctcgaa
cacggtatctgggaacagaatcagccgggctggctggctgtatcgagtgtgcggggcatt
gccgagcactgccggaaaggcggaaccgtattccgtgtcactgcagataattttgcctct
gtcgaagcgcagctgagcggctatacctccgatgaactggattcttttgaagcattgctg
accgctgataccgaatgtctgattctcccggatactccggtcagtgtcggccaatggacc
ggaattatttatctgggggtatctacaaacggcggcattaccgccgcgcttgataaaacc
aacggaggggctgtagaccggtcctcccggatcgggccgacccttatcaatgcccagaat
ctggccgactttaaagaggctgcgaatatccggaccccgaaaggcgctgatccggtcgac
atggcatcaggaaactatctgctggaaaaaaccgatctgaccatggacggcccgatgcct
ctggttatgaagcggaattacagttcgggttctgctgatgcaaaaacagcactgggatac
gggtggaatcattcttttaacatgtatgttcaggagcatacttcgcccgacagtctgatg
gaccgctctctcgaagatattgccggcgccgccgtggcgtatcaggcgatgctggatatt
cttcaaagtgaagacacggcccgttcatggactgtggccagcctgattgccgaatgggca
gtggaccggctggcgggaacggctgtgacggtttacaccggtcagaaggcggctacgttt
gtaaaacagccggatggttcgttcacacctcccgaaggaatgaccgtgtcgctgacggaa
accaatggggtttatgtgatgcaggagcgtcatggaaacacatacgcattcaacaccaac
ggcctgattgacaccattgaagatccttacgggaatacgcttactttcgaatattccgga
ggcacaaatcttaactccgtgcagagcagtttcggtcctgaaatgaccttcagctatacg
gacgggctgctgacctcggtcagcgataacgcggaaccggtccgcaccgtttattatcag
tatgattcagatgaaaacttaaccaatgtagttgatgccgccggttttgactggagcatg
ggatacgacagtgcgcatcagatcacctgggtaagggatcccgaaaatattactctcgtc
cggaatgcgtataattccgtcggtcaggtcacgaatcagatttccgcaagtggacaccgc
tggctgaaccgttttatcggaaactgcagtatcgaggaagatccgctagggaatcagacc
aaatattatttcgacagcaccggccgcacctggagcgaagaaaaggctgatggttcccga
acctacaccttctttgacgggcagggacatattaccggcacggtcaatgagcggggtgta
accaatcgttttgtttacgacaccgatcacaacctgctgatgcaggttcatgcggaggga
accgctgaacagacgatcacagcatatgcctatgattcggagcaccatctgcggctggtg
acgaatgccgtcggtacagctgaacagcttgtcactgaatatgcctacacggatgagcat
gccgttgattatacggtttcagccaaaggttccgaggaagaggctgttacagattactcc
tacaccgcacagggactgcttcgtcagctctcggaaggaaacggaaaaaggattacggtc
tattctgatttcgattcctacggtaatgcacaaatggttacttcaaccgatgccggaaca
gtcagccgggtctttaacgcaaaaggcgatctgaaaaccctgaccgtcggcggaaaaacc
accgcatacggttatgatgatctcaggcagctcattgcggtaacgaatgcgctgggtacc
gctgaccagacggtcatctctaaagcctactacggcaatgggctgctcagaacctcaacc
gatgcccgggggaagacgagcatattttactggacgcctgcttataaaccggcaggaacc
ctgttccccgacggaggaagctccacaaacctgtacgacgaggcggaccgccttgtgatg
agctgtgaccccgaaggcagctgcgtcaccaacacccttgattccgccggacggccggtt
tccgtgtcttcgatgtattccgtggtcacgaatcagtttgataccctcggaaacctcact
aactccgtagtcgatccttccggtcttcaaatcgaaagccgctttgtctatgattcactc
ggccggatgacgcaccgtttccgccccatcggttatgaagaatatcagatggatgggctg
ggtcgtgttaccaaccgggtcgatgcggcttcaaaagagtggaaaactgaatttgacgca
ctcggccgggtgaagaactccttccggccctccggagtgaacgaagaatacggttatgat
gacctcgggaaccgaaccgttttccgcaatgccgagggtaagcccgtttatttcggggtc
gatgcccaggggcgcgtcaccgcgatcaccaatgccatcgggaaggtgaccgcattcacg
tatgatgccgtgggtaatctggattcacgcatagatgccgccggggtgttaacggaatac
ggatatgatgcgctgaaccggttgacggcgatcacgaatcagggtgtggaagtcgccgcg
tttgatcacgatgcgaatggaaatatcatagagcatgcgtccccgcatgcctcatgcacc
ttcggctatgatgaaatgaaccggctcgtattcagtacgcagctctgtgcctcagtgtgt
tctgtggtggaaaatcagtacgatctgaacgggaaccgcacgaacatcgtctatccgggt
ggattatcggtcgggtatcattacggagcagacaatcggctggagagcgtgaccacggaa
tacgctgaaaacacggaaagctttgtgttcaattatgattccgccaatcggttgaccggc
atggattacccgaacggtgtgcattccacctttggttacgatgcagaaagccgcatcacc
tcgattcagcatggagattttgtggatcgggaaatccatcgcaacacgctcggcttcaaa
accaccgaatgtatcaatgcaggaattaaatccgccgtccaggaaaccgcgcgcagaatc
aaaacgcacaacgacgccgaccagctcatcttcgaacgagttcagcagggcaccaactgg
accgacgttgcttattcctattccgacaacgggtgcttaacgaatatcaccacagagggc
tcagaaacacagcgcttcggatatgactatgataatcggatcgtgaatgcagacggaaca
tcctgctccgttgagtatttatacgacgctaccggcgcacgcatcggtcggatctgtacc
gcaggcgtctcgcctaccgccgtcaccacgaactacttcatcatcgactacaccgacggc
ctgaaacgcccgctcgctgaaaccgattcagccggctccgtcacgcggtactacatctgg
gccggcatgcggctgctggctcatatcgaagccaacggcgatgcctattgctatcaccag
gacgaactcggcagcacgctcgcgctgacggacgagtccggcgcggtaacggaccagttt
gcgtacatgccttacggagctgccacgcgcaccggatcaacggatgctccgttccagtgg
ctgggtggctacggcgtgtactatgacattgacaccgaattgcatttaacccttcataga
gcgtattcctgttctttgaaacgtttcatcggtcccgacccgctcggtattgacggcggc
gtcaacatctacatgtgggccaatatgaatccgctattcttcgttgatccgtatggctta
gcagctttttaccttcacgcagataatgcagatttcggagatatggggcatggatggttt
acgttggaaaatgatgccggtgagcgaaatagttatggactttatcctaaggggggtatt
ggtaagctgagtgcttggttttcagatggagttcctgcttcaatacacaaaacttcgggg
gatcagggaaatggttttcaagactcgccaacctcaattgccgatgcaacactgaggatt
cctattacccaagagcagtatgataaagtccagaaattggctgatggactcatcgcgata
gaagatcaagttgtttggagtaaacacttcaactgtgttgattatgtacagctttacgca
gcctatgccggaattaattttggtgacgacctcaagaacatctttggcctttcaacgcct
aatcagttggaaaaatggattaatgagcagagggaaaagcagaatgtcgaaattaataaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
