Vibrio campbellii ATCC BAA-1116: M892_03020
Help
Entry
M892_03020 CDS
T02837
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
vca
Vibrio campbellii ATCC BAA-1116
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGU96120
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(682343..687907)
Genome browser
AA seq
1854 aa
AA seq
DB search
MGRIPFFNGLKFDKTNSYSFNFLRIGSSYEPIPINVNFIDYNADGYIDFYVDGKVHINQR
VGELFDKSKSLSMVKNVYRVSDINGDGIDDYVTHAEDRPPFKKSKVHLSTGFEVDRINII
QEYARTFKIEYKPASDKSVHKQKRYFDYPYLNTTPSKQLVANVVKEPKGYAATRYSYHYE
GAKSHALGGGFLGFAKITEVETNNGSFVVGNKYDFVTTTTVSEYHQLDLKRAGELKKVSV
YKQGKGAKSFVYRESDKVSATDFSYTSVDRTNSAFQVYPNKVVKKSYENGALQKTETITR
KLNAFGALTKEESTLVNAKDTRDAFTTTIDNTYVSSGYTTTSVTYNTISRHQVSDMSAKF
ARYQDGLTGYCSTSNDDVYFKPNDKFALIHGEVDTPILVTRHNEYYRYRVAKSQSNSYSG
ITQRSGELTQISRAEFERQATKPCGDFTFGNIIGDSHPELSTTTANLSQRVTQSGNEYWQ
VGAVKRTTSKTTAQQHGLSKLTLQDYAYTQNGLVSSVRTSGSEYEPGSGSGRTLTTAYQY
DAWGNIRQESQYGSDLARRTTTYGYEQNGLKLKTTTNAKGHTTTWEYDTQGRLLSETSPL
RGRKTRYQYDMFGRVKVATLPGTGNTVSTDYQLGAVCMNALETTAHCITEKKADGSEQQI
QFDYADREVRRLHRAFDGRWVVVDSEWDRNGRKRFVTAAKFLNQAGDAPRVTFDYDLYNR
EVRRIEPANRGGLAIFTTRYDGYKIEGTDARGFKRSTTHNVMGQVIRKNEPLGAYQTYQY
YPDGKLRRTVDSEGNVTQVKYDNLGYRTELDDPDIGHWHYRYNALGQLVYKRDANGIVTT
MGYDTLGRKVAQSDGNEASEWRYDERGALGKLSWMSGKGQRTDYFYNSNGLLQEKAVTVG
QEIFSTQYEYDKLERLGREVRPDGQTLKSALGKKDDQRLAVEYLYNQFGYLGAVRSPKTF
VDDIFTSAKFREDIRQLLTGAINQANTYLQRASRYARQEQFFRTKQLEYERKRVDVYNLD
SASAALLKDNYRYKQWCDGQNTCYLRPATWVMLHDDITIPLDVTLEGQVYRITSEKDGDI
WDAFTSGLQAHDLTATAISEQELAGLSLTPMKDMLLSGDYDEDGQPDIMHQDDIYSAKAD
DELRGELLFAAEDLEQAANIANRHYKQYKALAADMIGLSEKVAKLSGLYCEFANDLAGNR
VDASLRKECRSNGGVSQADMLDTILTNAELATANKNNAYVYYWQRQSTDAFDHTLSEMLG
NGLMNTYDYDADTGRMNAIATYQGNHVYSSDRISKPSRNQHIRYLRYQYDEHNNVTQRFD
DQLGITDIWTYDALDRVETNTMVLIDKARHGLNNPDLTGKRSFEYDKLGNIRRKSDVGVY
QYSGVGAGPHAVTNANGLDYSYDAVGNMTSAKAKGSKSNERTMRWSPFNKPIKIVREGKS
VEFSYDANHDRYLKRSSDGKVTFYFGKTYEREKDLKTGEIQHKHFIFAEGKLIALNTQTV
DSKNQLKNKQVRYLHYDALDSVDMVTDGYGLVVEKRSYDTWGKQRHVEWQDKSAASVVQS
AITNRGYTGHEEITEVGLIHMNGRVYDQELGRFTSADPLVQSPYVVNSFNRYAYVMNNPL
KYTDPTGLSSEDSGVNSGDSETNGDSEDKGSSSGRQEGNRGGDSKSEDAEGDKTKSDDVS
SDSIASKAKEVRDEMAAVYGLAGMIHNGASEDVVNSTANSLNMNAKDVRAAMRTAKVMAA
VGGAFGKGKGKVNVNVNVQGRVEKKTPSVDELSEEAAKPSKNGFTEAGRNLQKHSNRPGS
KWNQDDINTNNPNLANPRAQNLVDDALTTPGTTVTSNPRGGVGCKYTRWQDNSL
NT seq
5565 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggcgcatacctttttttaatggtttaaagtttgataaaacaaatagttacagcttt
aactttttgagaataggtagtagttatgagccgattcccatcaacgtaaattttatcgac
tataacgcagacggatatatcgatttttatgtcgatggaaaagtgcacatcaaccaacgc
gtaggtgaactttttgataaatctaaatcgcttagcatggtaaaaaacgtgtatcgagtt
agtgatatcaatggtgatggaatcgacgattatgttacgcatgctgaagaccgaccaccg
tttaaaaagtcaaaagtacacttatctacgggctttgaggttgaccgcattaacattatc
caagaatacgcccgcacatttaaaatcgaatacaaaccagcgtcggataaatctgtacac
aaacaaaagcgatactttgattacccttacttgaatacaacaccaagcaagcagttggtt
gccaacgtggttaaggagcccaaaggatatgcagcaaccagatactcctaccactatgag
ggagcaaagtcgcatgcgctaggcggtggctttttagggtttgcaaaaattaccgaagta
gagactaacaacggctcatttgttgttggcaataaatacgactttgttaccacaacaacg
gtcagcgaataccaccagctagatttaaagagagcgggagagctaaaaaaagtctcggtt
tacaaacaaggtaaaggtgcaaaatcgtttgtttatcgagaatctgataaagtgagtgcc
acggacttcagctacacatcagtggacagaaccaatagtgcttttcaggtctacccaaac
aaagttgttaagaaaagttatgaaaatggggcattacagaaaacagaaaccattactcgt
aaattgaatgcgtttggcgcattaacgaaagaagaaagtacgctagttaacgccaaagat
acgcgtgatgcttttaccaccaccattgacaacacctatgtttctagtggatatacgacg
acatctgttacatacaacacgatatcgcgtcatcaggtgtcggatatgtcggcgaagttt
gcacgttatcaagatgggctgacagggtattgttcaaccagtaacgatgatgtttacttt
aagccaaacgataaattcgccctcatacatggtgaggtggataccccaattttagtgacg
cgtcataacgaatattaccgttaccgtgtagctaaaagccaatccaattcttacagtgga
atcacgcagcgaagtggagagctaactcaaatcagtcgtgccgagttcgagcgccaggcc
actaaaccttgtggtgactttacctttggcaatattattggtgattcacaccctgaattg
agtacaacaacggctaacttatcacagcgagtgacgcagtcgggtaatgaatattggcaa
gttggggcagtaaagcgcacaacaagtaagacgacagcccaacagcatggcttaagcaaa
cttaccctacaagattacgcctacacgcagaacggcttggtaagtagtgttagaaccagc
ggctcagaatatgagcctggttctggttcaggtcgcacgctcacgacagcttatcaatat
gacgcttggggtaacattcgccaagaaagccagtacggcagcgatcttgctcgccgaacc
acaacctatggttatgagcaaaatggcctcaaacttaaaactactaccaacgctaaaggg
cataccactacgtgggagtacgatacccaaggtcgtctgctgtctgaaactagtccacta
agagggcgcaaaacacgttaccaatacgatatgtttggacgtgtaaaagtggcgacattg
ccgggtactggtaataccgtttccacggactatcagttaggtgcggtttgtatgaacgca
cttgagaccacggcacactgtattacggaaaaaaaagccgatggctcagaacagcaaata
cagtttgattatgccgacagagaagtccgtcgccttcatcgagcttttgatggtcgctgg
gtagtggtagattctgaatgggatcggaacggtcgtaagcgttttgtcacggcggcaaag
tttttaaaccaagctggtgatgcgccacgagttacgtttgactacgacctctacaaccga
gaagtccgccgaatagaaccagcaaatcgcggtggattagcgatatttaccactcgttac
gatggctacaaaatagaaggcacggatgctcgtggctttaaacgtagcaccacccacaat
gttatggggcaggtgatccgtaaaaacgagccacttggtgcttatcaaacgtatcagtac
taccctgatggcaagctaaggcgtacggtagattctgaggggaacgttactcaagtaaaa
tacgacaacttaggttatcgaacagagctagatgatccggatatcggccattggcactat
cgctacaacgcactagggcagcttgtttataagcgagatgcgaatggaatcgtcaccact
atgggttacgatacgctggggcgtaaagttgcgcagagcgacgggaacgaggcatcagaa
tggcgatacgatgagcgtggtgccctaggtaaactatcttggatgagtggtaaggggcaa
aggacagattatttctataactccaacggactattacaagaaaaagcagtcacagtcggg
caagaaattttctcgacgcaatatgagtacgataaacttgagcgtctaggacgagaagtc
cgtcctgatggtcaaacgttaaagtctgctcttggtaaaaaagacgaccagcgcttagcg
gtggagtatctttacaaccaatttggctatttgggcgcggtaagaagcccaaaaactttc
gttgatgatatctttaccagcgccaaatttcgcgaagatatccgccaacttcttacaggg
gcgatcaaccaagcgaatacgtatctacaacgtgcgagtcgatacgcaagacaggagcaa
ttcttccgcactaagcagttagagtatgaaagaaaacgggttgacgtttacaaccttgat
agcgcatctgcagcgttactaaaagataattaccgttataaacagtggtgtgatggacag
aacacgtgctacttacgcccagcaacttgggtaatgttgcacgatgacatcactatccct
ctggatgtcacgctcgaaggtcaggtttatcgaattaccagcgaaaaagatggtgatata
tgggatgcctttacatcagggctacaagcacatgatctgacagcaacagccatttctgag
caggaattagctgggcttagccttacgccgatgaaggacatgcttttatctggcgattac
gatgaggatggccagccagacataatgcatcaagacgatatttattcggcgaaagcggac
gatgaactgcgtggtgaattattattcgcagcagaagatcttgaacaagccgctaatatt
gctaaccgccattacaagcaatacaaagcactggcggctgacatgattgggttgtcggag
aaagtcgcgaaactgagtggcttatattgtgagtttgctaatgacttagctggtaaccga
gtagatgcgagtcttcgtaaagagtgcagaagcaatggtggtgtgagccaagccgatatg
ttggatacgattttaaccaacgcggaattggctacggcaaataaaaataacgcctacgtt
tattattggcagcgtcaatcgaccgatgcttttgaccacacactcagtgaaatgctgggt
aacgggttgatgaacacgtacgattacgatgcagacaccggacgcatgaatgcgatagca
acttatcagggtaatcatgtctacagctcagatagaataagcaagccatctcgaaatcag
catattcgttacttgcgttatcaatacgatgagcacaacaacgtcactcagcgctttgat
gatcaactcggtatcacagacatttggacctatgatgcgttagacagagtcgagaccaac
accatggttctgattgataaggctcgccatggtcttaacaacccggatctgacaggtaaa
cgcagcttcgaatatgacaagctgggtaatattcgccgcaaatcagacgtgggtgtttat
caatactctggagtgggagcgggtccgcatgctgtcaccaatgcaaatggtttagactac
agctacgatgctgtgggtaacatgaccagtgcgaaagcgaaaggcagcaaatccaatgag
cgaacgatgcgttggtcgccgttcaataagccgatcaaaatcgtgcgtgagggtaagtcg
gtagagttttcttatgatgcgaaccacgaccgttacttaaagcgaagctcagacggtaaa
gttaccttctactttggcaaaacttatgaacgagagaaggaccttaaaacaggggaaata
caacacaagcactttattttcgctgagggtaagttaattgcgttaaacacccaaactgtt
gatagcaaaaatcagcttaagaataagcaagtgcgctacttgcactacgatgcgctggat
tctgttgacatggtgaccgacggttacggcttagttgtagaaaaacgcagctatgatact
tggggtaaacagcgccacgttgagtggcaagataaaagtgccgcgagcgttgtccagtct
gcgattaccaaccgaggttacactgggcatgaggaaatcactgaagttggattaatacac
atgaacggacgtgtgtacgaccaagagttagggcgctttacgagcgcagatccacttgtt
cagtcgccgtatgtggtgaatagcttcaaccgctatgcatatgtgatgaataacccgctc
aagtacacagacccaacaggtttgagtagtgaggactctggggttaattcaggtgattca
gagaccaatggggatagcgaagataaaggctcaagtagcggcaggcaagaaggtaatcgt
ggcggtgattcaaaaagcgaagatgctgaaggcgataaaaccaaatccgacgatgtgtca
tctgatagtattgctagtaaggctaaggaagtaagagatgaaatggcggcagtctatggt
cttgcaggcatgattcataatggagcttcagaagatgttgtaaactccacggcaaacagc
ctaaacatgaatgcaaaagacgtccgggctgccatgcgaacggcgaaggttatggccgct
gttggtggagcttttggaaaggggaaaggtaaagtaaatgtaaatgtaaatgttcaaggt
agagttgaaaagaaaactccgtcagtagatgagctatctgaagaagctgcaaaaccaagt
aaaaatggttttacagaggctggtcgaaatcttcaaaagcatagcaaccgacccggaagt
aagtggaaccaggatgatataaataccaataacccaaatctggctaaccccagagcacag
aacttggtggatgacgctctcacgaccccagggactacggttacctctaatccgaggggg
ggggtgggatgtaaatacaccagatggcaggacaattcgttataa
DBGET
integrated database retrieval system
