Vanessa cardui (painted lady): 124530992
Help
Entry
124530992 CDS
T09161
Symbol
Fancd2
Name
(RefSeq) Fanconi anemia complementation group D2
KO
K10891
fanconi anemia group D2 protein
Organism
vcd
Vanessa cardui (painted lady)
Pathway
vcd03460
Fanconi anemia pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vcd00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03460 Fanconi anemia pathway
124530992 (Fancd2)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
vcd03400
]
124530992 (Fancd2)
DNA repair and recombination proteins [BR:
vcd03400
]
Eukaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
FA (Fanconi anemia) pathway
FANCD2-I complex
124530992 (Fancd2)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FancD2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124530992
NCBI-ProteinID:
XP_046961330
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(1566553..1570894)
Genome browser
AA seq
1351 aa
AA seq
DB search
MKIKRTPQREVSESPSKRVKSINSNDYFETTLDESGLQLHSPPEKCMTSHETILITRNLR
KNLQKHKDYPRNVSEFFENLKQRCDEQTYLKHFLYPNIVRTAGETSTESHLNDSLIKILL
NIPVLQNKLMDYIFEKAIDLAADSKCGPWIQAILKCFSNLDNVVDSDKIATNLINLLDVT
SEKMVRLEIITAIPDIIGDQAHENIASEMSRILSEDHDLVPAILDCLSYLCLSDEQYQEL
QKKTLNILMALPKCNHFPNFVKFLLMPGRTVDTAYYEAVLGLRNALGWPTSIAKPQDIAT
SQILTVSAIRTSVVSSKVIANAWLKVISNCQLSADHKPIDFVIILILYSTSEEKQKQVES
VIKKQVKLNILNEELLDDAFTMFKPILKDYLKTLISLTNSLLKCRGDVEVQQFASHIYTL
MLSKLEDCCQSVVAELLQLGLDSKQCVMNILTILNNVAVKDMTLLKPQSVQMLTLLDRMD
DMTLSEIRAVMNLVCGLAYSYENSVIRDDIHMIVRKELGSSNPTVKIQGILAGVHAVKYL
MASTDEEVSIESVEDVSYGTINHLPEGDLREAAQIIELISRSTRQFPDMIAFFYDELYKI
VQSVDYINSHFLNWITEAVTNDLQQNFIVDSLECNTFEDLKLDMQYCLNSDSEMDNVIAI
NIAGLTLNTKQDVSILILSPLFQLVQALHNKKHDGNLSSIDALLGCPVIMPIFDIDLIEN
MSNTTITQVLDCQVHCVNWFRELLNAFASQNDPALKSKILNRILNIQKLEKTIEEILLQS
NLVYKPPVSTFNLNNSKIHANEKKNIKVQNAKTKVQKKTQDVSVLTETLKSQASVRNNNV
VKSKTTRQVQSIPFRPLNLTLLNLLKCELTDGKNPEKNLTMEVFIFLLKYINCHLESILL
SKIKKNTFLTKKDDTEAYNIKKAEECAQLVNEMLPKLVNHMKFITTYLDENYFIELEKDD
NDLLYDSDMLSYLCGLEHILNICTTYFKWIGFKTQHKSLLKTSLRTIAHSLEGENSTYVQ
DLVLAVAKYLQRHEKYCIQLTTAVSLFEYFKAIQEYSSSPMLTQIIKELAKKFLSNQWKT
SDGVAEKGLFLNQCVDDFARVYFTNNQILELKNITLLLVNDVQEMAKVRNSTLNSFQCVN
KANFPIIYRNLGGALFLATKTQLNKRLTNCEHLDLWKNVGLILKCMLEIAKTLESRNNLA
AFFKKTLPIIKLFITHGIPIMELEFKNKTQEILELLKTLQQITRFLQSLCCHSRLKKDTA
LINKVPYVRQLLETLLYKVKAMLAANNCSEAFWMGNLKNKDIHGEIISTQENEENDGSGD
DCDEQLPEDDDSDVTDDEMLNPDSRSLSDIV
NT seq
4056 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagataaaaaggacacctcagagagaagtcagtgaaagccccagcaaaagggttaaa
agtattaacagtaatgattactttgaaactactttagacgaaagtggcttacaattacat
tcaccgcctgaaaagtgtatgacatcacatgaaacaattttaattactcgaaatttaaga
aaaaatttgcaaaaacataaagattatccgcgaaacgtgtctgaattctttgaaaactta
aaacaaagatgtgatgagcaaacatatttgaaacactttttatatccaaacattgttcga
acagccggcgaaacatctactgaatcccatttgaatgacagtctaattaaaatcttattg
aatattcctgtactacagaacaaattgatggattacatctttgaaaaagccattgattta
gctgctgattctaaatgcggaccatggatacaagcaatattgaaatgtttttcaaattta
gataatgtagttgacagcgataaaattgctacaaatctcataaatcttttggatgtaaca
tcagaaaaaatggttcgtttggaaattattacagctattcctgatataataggagatcag
gcacatgagaacattgcctcagagatgagtcggatattgagcgaggaccatgaccttgta
ccagctattttagattgtctatcttatctatgtttatctgatgagcaataccaagaatta
caaaagaaaacattaaatattttaatggcattgccaaaatgtaatcactttccgaatttt
gttaaattccttctaatgcctggacgaactgttgacactgcatattatgaagctgtgctc
ggtctaaggaatgcacttggttggccaacatcaattgcaaaaccacaagatattgctact
agccagattttgactgtttctgccataaggacatctgttgtatcatcaaaagttattgca
aatgcttggttaaaagttatttcaaattgtcaactcagtgctgaccataaaccaattgat
tttgtaatcattttaattttgtattccacaagtgaagaaaagcaaaagcaagtggagagt
gtgattaaaaaacaagttaaattaaatattttaaatgaagaattgttagatgacgctttt
acaatgtttaaaccaatattgaaagattatttaaaaaccctcataagtttaacaaattct
cttttgaaatgtcgaggcgatgttgaagttcagcaatttgcttcacatatttatacttta
atgttgtctaaacttgaggattgctgtcagagtgtagttgcagaattactgcaactagga
ctagacagcaaacaatgtgttatgaacatactaacaattttaaataatgttgcagttaaa
gacatgacattattaaaacctcaaagtgttcaaatgttgactctacttgatagaatggat
gatatgacattatcagaaatacgagctgttatgaatttagtttgtggtcttgcgtatagt
tatgaaaattcagtcattagagatgacatacatatgattgtcagaaaagaattaggaagt
tcaaacccgacagtgaagattcaaggtattctggctggtgtacatgctgtgaaataccta
atggcctccactgatgaagaagtttccatagaatccgttgaagatgttagttatggaact
attaaccatctaccagagggtgatcttcgggaggcagcacaaattatagaattaattagt
cgcagcacaagacagtttcctgacatgatagcattcttttatgatgaactgtataaaata
gtgcaatcagttgattatataaattcacattttctcaattggattactgaagctgtgact
aatgatttacagcaaaattttattgttgatagcttggaatgtaacacatttgaggatttg
aagctggacatgcaatattgtctcaattcagatagtgaaatggataatgttatagccatt
aatattgctggattaacactaaatacaaaacaagatgttagcattttaattttgtctcca
cttttccaacttgtccaagcactacacaacaaaaagcatgatggaaatttatcaagtata
gatgcattgttgggatgtccagttattatgccaattttcgatattgatttaattgagaat
atgagtaatacaacaataacacaggttttagattgtcaagtacattgtgttaattggttt
cgagaattgttgaatgcatttgcttctcaaaatgatcccgctttgaaatcaaagatttta
aacagaatattaaatatacaaaagctggaaaaaactatagaagaaattctgttgcaaagt
aatttagtgtataagccaccagtgtctactttcaatttaaataatagtaagattcatgcc
aatgagaaaaaaaatattaaagtacaaaatgccaaaacaaaagtacagaaaaaaacacaa
gatgtttctgttcttaccgagactttaaaaagtcaagcaagtgtacgaaataacaatgtt
gtgaaaagcaaaaccacaaggcaagtccaaagcataccatttagaccactgaacttgaca
ttactgaatcttctaaaatgtgaattgactgatggtaagaaccccgaaaagaacctaaca
atggaagtttttattttcctattgaaatatataaactgtcatttagaaagcatattactt
tcgaaaattaaaaaaaacacatttctcacgaaaaaagatgacacagaggcttataatatt
aaaaaagcagaagaatgtgcccaacttgtcaatgaaatgctgccaaaacttgtaaatcat
atgaagttcattacaacatacttagatgaaaattatttcattgaacttgaaaaagatgat
aacgaccttttatatgatagtgatatgctgagctatctatgtggccttgaacacatattg
aacatctgtactacatattttaaatggattggttttaaaacccaacataaaagtttgttg
aaaacatctctacgtactattgcacacagcctggaaggagaaaactcgacttatgttcaa
gatttagtattagctgttgctaaatatttacagagacatgagaaatactgcattcagctt
accacagctgtgtcattgtttgagtatttcaaagcaattcaggaatattcttcaagtccc
atgttaacgcaaataattaaagagctggcaaagaaattcctttctaatcagtggaaaacc
tctgatggtgttgctgaaaagggtctatttcttaatcagtgtgttgatgattttgctaga
gtttattttacaaacaatcaaattttagaactgaaaaatataacacttttattagtcaat
gatgtacaagagatggcaaaggtacgtaacagtacattaaattcatttcaatgtgttaat
aaggcgaactttcccataatatatagaaatttaggaggtgcacttttcctagcaaccaaa
acgcagttaaataaaaggttaactaattgtgaacatttagatttatggaaaaatgtggga
ttaattttgaagtgtatgttagaaattgctaaaacacttgagagcagaaacaatttagct
gccttttttaagaaaactcttccaattataaagctatttattacccatggaatacctata
atggagttggaattcaaaaacaaaacacaggaaatactggaattattgaaaactttacaa
caaatcacaagattcctgcagtcattgtgttgccattctagattgaaaaaagatactgca
ttaattaataaggtaccatatgtaaggcaactgttggaaactcttttatataaagttaaa
gctatgttggctgcaaataactgttctgaagcattttggatgggaaatcttaaaaataag
gatatccatggagaaattatttccacccaggaaaatgaagaaaatgatggatcaggggat
gattgtgatgaacaactaccagaggatgatgatagtgatgttacagatgatgaaatgctt
aatcctgattcacgaagtcttagtgacatagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system