Vibrio cholerae O1 El Tor FJ147: IR04_09970
Help
Entry
IR04_09970 CDS
T03827
Name
(GenBank) membrane protein
KO
K20947
polysaccharide biosynthesis protein VpsF
Organism
vcf
Vibrio cholerae O1 El Tor FJ147
Pathway
vcf05111
Biofilm formation - Vibrio cholerae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vcf00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
05111 Biofilm formation - Vibrio cholerae
IR04_09970
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJZ99458
LinkDB
All DBs
Position
I:1068208..1069428
Genome browser
AA seq
406 aa
AA seq
DB search
MSERNLNRWMILIILSAFLLGAFLLENMGIQYVSEGGSPILKIHVYSYLTMGIFALLILW
VGLFNLIKPLNELKKAWWLAMVSMLAVILYGFMRFGTSGLAYLIDTIFIPLVLVPIVYGL
SDTAKNRLLALLGYLLFLNACIAIIELILAQSIVAVEIGSFSTFRSTAFLAHPLNNALIT
ASLTPIVMRYTRIPVALYVSVIVLALFAFGGRAALGIFLLGNFLMLLPKLRDFLGQGIRY
HKLKFAYLQALVYFSVIAVILTLVLSPIGERILSKLYLDKSAEARFDVFILLEQLSPSEW
VFGASHGLLSDIAFYIGINVVENYLIGWVLNFGLLGAIGLLLATYTVPVRLIYRQELPAQ
VALLSFMLISLTNNALTVKTPALVLFVVALVCRYRSSDRSLASKSH
NT seq
1221 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagcgaacgtaatctcaatcgatggatgattctgattatcctcagtgcgtttctgttg
ggggcttttttactcgaaaatatgggtattcagtacgtttcagaaggcggaagccccata
ctcaaaattcatgtctattcctatttgactatggggatttttgccctgttgatattatgg
gtaggacttttcaatcttattaagcctttgaatgagcttaaaaaggcatggtggctggcc
atggtatcgatgctggccgttattttatacggctttatgcgattcggtacgtcgggactc
gcttatcttatcgatacgatttttatccctttggttttggttcctattgtatacgggtta
tccgatacagctaaaaatcgattacttgctctactcggctatcttctatttcttaatgct
tgtattgctattattgagcttatattggcgcagagtattgtggcggtagagattggaagt
ttttcaactttccgttcgaccgcctttttggcgcatccactgaacaatgcgctcattacg
gcgtcattaacgccgattgtgatgcgttatacacgaattccggtggctttgtatgtctct
gttatcgtgctagccctgtttgcttttggagggcgagctgcgttggggattttcctattg
gggaattttctgatgctgttgcctaaattacgtgactttttaggccaaggcattcgttac
cataagttgaaattcgcttatctgcaggccttagtctatttctctgtaattgccgttatt
ttgaccctggtgttaagtcctataggtgagcgaatactgtctaaattgtatctcgacaaa
agcgccgaagcgcgattcgatgtttttattttgcttgaacagctttcaccttcggagtgg
gtatttggagcctctcatggattactgagtgatattgccttttatatcgggatcaatgtc
gtggaaaattatttaattggctgggttcttaactttggcttactaggggcgatcggctta
ttactggcaacttacactgttccagtgcgcttgatttaccgacaagaacttcctgctcaa
gttgctttactcagttttatgttgatatcactgactaacaatgcgctaacggtgaagact
cctgcactcgtgttattcgttgtcgctttagtttgtcgttatcgttcatctgatcgttcg
ttggcgagcaagagtcattag
DBGET
integrated database retrieval system
