Vibrio cholerae O1 El Tor N16961: VC_0414 Help Entry VC_0414           CDS       T00034                                  Name (GenBank) hypothetical protein   KO K12287   MSHA biogenesis protein MshQ Organism vch  Vibrio cholerae O1 El Tor N16961 Brite KEGG Orthology (KO) [BR:vch00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02044 Secretion system [BR:vch02044]     VC_0414 Secretion system [BR:vch02044]  Type II secretion system   MSHA pilus biogenesis protein    VC_0414 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  DUF6701 DUF7305 Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  AAF93587 UniProt:  Q9KUV0 LinkDB All DBs Position I:438229..441987 Genome browser AA seq 1252 aa AA seqDB search MNKWLAKTLVGLGCFALLSAYALAFQDIDHSIYFPSVVQGHGSCSGAPNPQLIQYNSARI NGTNNSVVDFCSINATNERPNTRCDNNLCQVSGNTVPSLSLAGINAFKTSSVSGTEIGWC NSGQSILLSKTNIGTVQLYASCTLSFTGQTEYKIKSLDMGSGATLVLSSGDYWIESLQLN QGGEVVVDGDVRLFIRNNSDWNSAQINVSGSGNLTIVGYNNITLNQSNQVKAYLYVGGTL TLHNTSVINGRVTSRRLFMEANTEINQNEQQGYACFTDDFNRSSLGQNWIPYTSSGNFTP SIISNRMRLTEAITNQATAVTYQRIFPAAGNLVTVEFDYYAWANLTGNGADGVSVIFSDA TVTPRTGGFGGSLGYAQRTDTNPDTPGFAGGWLGVGLDEWGNYSNATEGRQGGPGFRQQA VAIRGSESANYQYLVGTAANLNPKLDVRRTCQWWGCSFSGAGPGHRYFITIDSRSGGGVW VRVDRSVNGTMQTVIDWHNVLSNPNQGATPADFLLSLAGSTGASVNNHEIENFKVCALKS RPVGQLIDHFRFTLPQQGLTCSASEVQIKACANDNCSQLYTDPVTATLSPNSAPSATGGW LGGSQVNFNNGIATAQLRRNSVGNVSVNVLGSTPASKPFQVNLCSYTNNPNSYSTANCTV NFADSGFIVDVPNAYANQTVTGTIKAVRKDNASQQCLPSFGNVQKSVAFWSEYLNPTANN SGFQSVSVGVNGTPIGQSANNATSISLNFNQNGEASFPISYREVGSLALHARFTGSGDEQ DLLLEGQDSFIRVPRALVLSANNPYNPTHPNGQCSAENISCNVFARADENFDLIIRAVVA APIEDNDFTNNLTAYNYQQQNIALQHTLVQPSAGQSGVLGVNEYTHLLGGTTTIAQKVSE VGVFDFSLFAPTHYLGLDLASANLPIAVTSTGSIGRFIPAYFSVSPMSNVTLDAACKTGN AFSYLGQPFEYSNSPGLYLQPKSANNADTQNYLIDPWWRYNNQWNGRTYSDSANGVNLGF DNLQTSPISRQALNNSGIVLNGERVWYQKPLQPKPVFNSAFDLTLNASNLTDQDGVCYRQ NASSPCLGYTFSHIDGAMPLYWGKLVIQDVYGPETQASEQPIYVEHFTNNGFVRTIEDSC TALPAITGFTLQSDPNNNGYTVLTTGVAVPPQVLAEHSAANLNSGQRAIRFSAPGAGALG VIDSVLDLNAHNLLWLAEDKDGDNNFDQTTQGRAQFGLYRGSDRVIWWRESN NT seq 3759 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt gtgaataagtggttagccaaaacgctagtgggattgggatgttttgcattgctctctgct tatgctttggcatttcaggatattgatcactcaatttattttcccagtgttgttcaaggc catggcagttgtagtggcgcaccaaatccgcagttaattcagtacaacagcgcaagaatt aacggaacgaataattcagttgtagatttttgttctattaatgctaccaatgaacggcct aatactcgttgtgataataatctttgccaagtttctggtaatactgtgccttcgcttagc cttgctgggattaatgcatttaaaacatcaagcgttagtggaacggaaataggttggtgt aatagtgggcaaagtattcttctatcaaaaacgaatattgggactgtacaactttatgcc tcatgtacattaagttttaccggacagactgaatataaaattaaatctttggatatggga agtggtgcgactcttgttctttccagcggtgattactggattgaatctctgcaacttaac caaggaggtgaagtcgttgtggatggggatgtacgcctttttattcgcaataattctgat tggaatagtgcacagattaatgtctcaggatcaggcaatttaaccattgttggttataac aacatcacattaaatcaatcgaatcaggtaaaggcttatctctatgtcggtggcacatta actctgcataacacatctgtcattaatggacgggtcacaagtcgtcgattatttatggag gctaatactgagattaaccaaaatgaacagcaaggctatgcttgttttaccgatgatttt aatcgctcatctcttggacaaaattggattccctacaccagtagcggtaatttcacaccg agtattattagtaaccgaatgcgcttaacagaagcgattaccaatcaagcgacagcagtg acttatcagcgtatttttcctgcagcaggcaatttggttaccgtagagtttgattattat gcatgggcgaatttaaccggtaatggagccgatggggtctcggtaattttttcggatgcg acggtcactccgagaacgggcggttttggtggctctctaggttatgcgcaaagaaccgat actaatcctgatacaccaggttttgcggggggatggttgggtgtcggcttagatgaatgg ggtaactattcgaacgcgacggaagggcgacaaggtggccccggttttcgtcagcaagct gtggcgattcgtggctctgagtcagcgaattatcaatatttagtgggcactgctgccaac ctcaatcctaaattagatgtgcgtcggacatgtcaatggtggggatgttctttttctggt gcaggccccggccatcgttatttcatcaccatcgattcgcgcagtggggggggcgtttgg gttcgtgtcgatcgctctgtgaatggcactatgcaaacggtcattgattggcataacgtg ttgagtaatcccaatcaaggggcaacccccgcggactttctactttctctcgcgggctcg acaggcgcatcagtcaataaccatgaaattgagaacttcaaagtgtgcgcattgaaatct cgcccagttggacaattaattgaccacttccgtttcactctgccacagcaagggctgact tgtagcgcttctgaggttcagatcaaagcttgtgcgaatgacaattgtagtcagctgtac acggatcctgtgacggctacgctctccccaaattcagcaccgagtgcgactggtggttgg ttgggtggctcacaagtgaatttcaataatggaattgccacggcgcaactgagacgtaat agtgtagggaatgtgtcagtcaacgtacttggctcgactcctgccagtaagccttttcag gtcaacctctgtagctacacgaacaatcccaacagttattcgacggccaattgtacggtc aattttgcagacagcggttttattgtcgatgtacccaatgcttatgctaaccagacggtg acgggcaccataaaagcggtgcgcaaagataatgcttcacaacaatgcttaccaagtttt ggcaatgtccaaaaatcagtggcgttttggagtgaatacctcaatccgacggccaataat agtggattccaatctgtcagtgtgggggtaaatggaacgccaattggtcagtctgcaaat aacgcgacctcgataagtttgaactttaatcaaaatggtgaggcgagtttcccgatctct tatcgtgaagtgggtagtctagctctgcatgctcgtttcacgggcagcggtgatgagcaa gatctgttgcttgaagggcaagatagttttatccgtgttcctagggcattggtactcagt gcgaataatccatataacccgacacatccaaatggccaatgctctgctgagaatatcagt tgtaatgtttttgcgagagccgatgaaaactttgatctgattattcgagccgttgttgct gcgcccattgaagataatgatttcacaaacaatttaacggcttataactaccagcaacaa aatatcgcgctacaacacactctggtgcagccatcggcagggcagtcgggtgtgttaggc gtaaatgaatacactcatctacttgggggtacaacgactattgcgcaaaaagtgagtgaa gtcggggtgtttgatttctctttgttcgcacccacccattatcttggccttgacttagcc agcgccaatctaccgattgcggtgacgtcaacaggatcgattgggcgctttattcccgct tacttttcggtatctccgatgagtaatgtcaccttagatgcggcatgtaaaaccggtaat gcctttagttatctcggtcagccgttcgagtattccaatagcccgggactctatttacag cctaaatccgccaataatgcggatacgcaaaattacctcatcgacccttggtggcgttat aacaatcaatggaatggtcgcacttacagtgatagcgcaaacggtgtgaatcttggtttc gataatctgcagacttcgcccatcagcagacaggcattaaacaacagtggcattgtctta aatggggaaagggtgtggtatcaaaaaccgttacaacctaaaccggtgtttaattcagcg tttgatttgactttgaatgcctctaacttaacggatcaggatggagtttgttaccgacaa aatgcgtcatccccttgtttgggatatacgttttcacacattgatggagctatgccgctg tattggggcaaattagtcattcaagatgtgtatgggccagagactcaagcctcagagcaa cccatctatgtcgagcatttcaccaacaatggttttgttcgtacgattgaggacagttgc accgcactgcctgcgatcacaggctttaccttgcaatcggatcctaataacaacggttat accgtattgaccactggcgttgcggttcctccccaagtcttggctgagcattcggcggct aatttaaactcaggtcagcgcgccattcgctttagtgcgccgggagcaggggctcttggt gtgattgattcggtgttggatctcaatgcgcacaacttgctgtggcttgccgaagacaaa gatggcgacaacaattttgatcaaaccacccaaggtcgagcgcaatttggcttgtatcgc ggcagtgatcgggtgatctggtggcgcgaatcgaattaa

DBGET integrated database retrieval system