Vibrio cholerae O1 MJ-1236: VCD_001318
Help
Entry
VCD_001318 CDS
T00903
Name
(GenBank) sensor histidine kinase
Organism
vcj
Vibrio cholerae O1 MJ-1236
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
Response_reg
HisKA
PAS_4
PAS
PAS_8
HATPase_c_2
PAS_10
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACQ59491
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(325520..328963)
Genome browser
AA seq
1147 aa
AA seq
DB search
MQGWLVIPVSLAYLGVLFLIAWYGDRQTRWLANWRPWIYSLSIAVYCTSWTFYGTVGQAS
VNPWSFLPIYIAPILMFVFGWRVLARLILIAKREHITSLADFIAARYGKSQGLAVAVTVI
AVLGILPYIALQLRGITMGLNIVAPDLMTVYGYQESHVSWFVVLALALFTMLFGTRHIDN
TEHHRGMMMAIAFESIVKLVAFLCVGVFIAYLAWRTDGLELSTIAASTYQAPNWPTLLIH
TLLTMIAIVCLPRQFHTMVVENERPQDLHTARWLFPVYLLLMSLFVLPIAWTGQGLLPNT
SPDTFVISLPVFAGAHDIALLAFLGGTSAASGMVIVSTIALAIMVSNDLVMPLLLRRMRL
SQRTHRHFSGLLVVIRRTLILLLLFGAWGFYLVLDSIPSLSAIGFLSFSAITQFAPAIFG
GMYWREGNRKGVYVGLAVGFTLWLITLMSATDMLAGDASNNVLLWVITPPDWLVALGLKS
ADWGMLLSVTLNTLCYIGVSLVTRASLSERLQAAAFVGTPLPENENMSLYQSRVTVGELE
MLASRFVGRTRVRNAFAQYWSQQRETLLPNQQASSALIRHTERVLAGVFGASSAKLVLTS
ALQGRKMQLEEVATIVDEASELYDFSRGLLQGAIEHIGQGIAVVDKQLRLVAWNQRYLEL
FEFPPGLIQVGRPIADVIRHNAQQGLCGPGDPEDHVRRRVYHLEQGTSHTSSRVRADGRV
IEVQGNPMPGGGFVMSFTDITVFREAEQSLKMANETLEERVLQRTLELEKLNKQLVTATQ
RSERESQSKSRFLAAVSHDLMQPLNAARLFASSLSEVAKEAEVQKLAHHIESALGAAEDL
ISDLLDISRLESGKIDLHPHSFAIMDVLSNLNAEFSALAAKQGVQFSLVPSLLWVHSDPK
LLRRVIQNFLTNAFRYNPNGKVILGVRRVATGQVRIDVWDNGIGIEQDKQQEIFEEFNRG
GQVRSDQGLGLGLAISKGIAHVLGHHISMRSWPGQGSVFSITLDRAQPMPSSLTQTVAMV
NEKGSELQHLRVLCVDNEPDILVGMRDLLERWGCEVKTATDIHGSLKALEGQWIPDVILS
DYRLDNGRTGLEVLQQCRLRLGDCFAGVIISADRNPDILDGIESSGFRFMAKPIKPLKLR
ALLNSLS
NT seq
3444 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaggttggttggtaattcccgtttcgctcgcgtatctcggcgtgctgtttttgatt
gcgtggtatggtgacaggcaaactcgttggctcgccaattggcggccgtggatctatagc
ttgtcgattgcggtttactgtacctcgtggacgttttacggcacagtcgggcaggcgagt
gtcaatccttggtcgtttctgcctatctatatcgccccgatcttgatgtttgtgtttggt
tggcgagttttagcgcggctgattttgattgctaaacgtgagcacattacttcgctcgcc
gattttattgccgcccgttatggtaaatcgcagggtttggccgtggcggtgacggtgatc
gcggtcttgggtattttgccgtatatcgcgctacaactgcgcggcattacgatgggattg
aacattgtcgctcccgatttaatgacagtgtacggctaccaagaatcgcatgtatcttgg
tttgtggtattggcgctggctctgtttaccatgctgtttggcactcggcatattgataat
accgagcatcaccgcggaatgatgatggcgattgcgtttgaatcgatcgtcaaattggtg
gcctttctctgcgttggggtatttatcgcgtatctggcgtggcgtaccgatggattagag
ctttcaacaattgcggccagcacttaccaagccccaaactggccgaccttattgattcat
accttgctgaccatgattgcgattgtgtgtctgccgcgccagtttcataccatggtcgtt
gaaaacgagcgcccgcaagatctgcacaccgcgcgctggctctttcccgtttatcttctc
ttaatgagcctgtttgtgttgccgattgcttggacgggacaaggtttactgccaaacacc
tcacccgatacgtttgtgattagcctacctgtgtttgctggggctcacgatatagcattg
ttggcttttttgggcggaacatcggcagcttcggggatggtgattgtctcgaccattgcc
cttgcgatcatggtatccaatgatttagtgatgcctttactactacgccggatgcgcttg
tcgcagcgcactcatcgacatttttccggtttgttggtggtgatccgccgcaccttaatc
ctacttttgctgttcggtgcatggggtttttatctggtactcgacagcattccttcgtta
tcggcgattgggtttctatcgttttcagcgattacccagtttgcccctgcgatttttggc
ggtatgtactggcgagaaggcaatcgtaaaggggtttatgttggtttagcggtcggtttt
accctgtggcttatcaccttgatgagtgccaccgatatgctggcgggcgatgccagcaat
aacgtcttgctgtgggtgatcactccaccagattggttggtggctctagggttaaaaagt
gcggattggggcatgctactgagcgtgacccttaataccttgtgctatatcggtgtgtct
ttggtgacgcgcgccagcttaagtgagcgtttgcaagccgcggcgtttgtcggtactccg
ctgcccgaaaacgaaaacatgagcctttaccaaagtcgcgtgactgtgggtgagcttgaa
atgttggcctcacgttttgtggggcggactcgggtacgcaacgcctttgctcaatactgg
agtcagcagcgtgaaaccttgctaccgaatcagcaagcctcttccgccttgatccgccat
accgaacgcgtactggctggggtatttggtgcttcgtccgctaagttggtgctcacctcg
gcgctgcaaggacgtaaaatgcagcttgaggaagtggcgaccatagtcgatgaggcgtcc
gagctgtacgatttcagccgcggcttgttgcaaggggcgattgaacacatcggccaaggt
attgccgtggtggataaacagttacgtttagtggcatggaaccagcgctatcttgagctg
tttgagtttccgccgggattgattcaagtgggacggccgattgcggatgtgatccgccat
aacgcgcagcaaggtttatgtgggccgggcgatccagaagatcacgtacggcgacgggtc
taccacttagagcaagggacaagtcatacctcctcgcgagtgcgggcggatgggcgagtg
attgaggtgcaggggaacccgatgcccggcggtggatttgtgatgagctttactgacatt
acggtgtttagagaagcggaacaaagcctgaaaatggccaacgaaacgctagaagagcgt
gtactgcagcgtaccttggagctagaaaagctcaataaacagttagtcaccgcgacccag
cgttcggagcgcgagtcgcaatccaaatcgcgctttttggcggcggtcagccatgatttg
atgcagccattgaatgccgcacgcctgtttgcctcatctttatctgaagtggctaaagag
gcggaggtgcagaaacttgcccaccatattgaaagtgctttgggcgcggcggaggatttg
atcagcgatttgctggatatttcgcgtttggagtccggcaaaatcgatctgcatccgcac
agttttgcgattatggatgtattgtcgaatctcaatgccgagttcagtgccctcgccgct
aaacaaggtgtgcaatttagcctagtgccatcattactttgggtgcattcagatcccaaa
ttgctgcgccgagtaatccaaaatttcctgactaatgcgtttcgttataacccgaacggc
aaagtgattctcggggtgcgcagagtcgccaccgggcaagtgcgtattgatgtgtgggat
aatgggattggtattgagcaagataagcagcaggaaatttttgaggagtttaaccgcggt
gggcaggtacgctccgaccaaggtctagggcttgggctggcgatttcgaaagggattgcc
catgtactgggtcatcacatttcgatgcgctcttggccggggcagggcagtgttttctcg
attactttagatcgcgctcaacccatgccgtcgtcactcactcagacggttgcgatggtc
aatgagaaaggttcagagctgcaacatctgcgtgtgctgtgtgtcgataacgagccagat
attttggttgggatgcgtgatttgctggagcgttgggggtgtgaagtcaaaaccgcgacc
gatattcatggcagcctcaaagccttggaagggcaatggatccccgatgtgattttgtct
gattaccgcttggataacggacggacagggcttgaagtgctgcagcagtgccgcttgcgt
ttgggggattgtttcgctggcgtgatcatcagtgccgatcgcaatcccgatatcttggat
gggattgaatcaagcggttttcgctttatggctaaacccattaagcccctcaaactgaga
gccttactgaatagtctgtcttga
DBGET
integrated database retrieval system
