Vibrio cholerae O1 MJ-1236: VCD_002929
Help
Entry
VCD_002929 CDS
T00903
Name
(GenBank) lipase family protein
Organism
vcj
Vibrio cholerae O1 MJ-1236
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Lipase_3
CarboxypepD_reg
SdrD_B
Ig_DR_A0283-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACQ61089
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2127535..2129460)
Genome browser
AA seq
641 aa
AA seq
DB search
MDSFNYCVQCNPEENWLELEFRSENDEPIDGLLVTITNQSAPSNTYTQTTSSGKVLFGKI
AAGEWRASVSQASLLTEVEKYASRKEGQESPVKKRAAAELDAADKDTKQYRFTTIGDFWD
EAPKDEFLQKQHKGIDVNASAEKAGFRLSHNQTYVFEIKALRSYMPVIIDTDEFNLVNSY
TFALLSKLAYATNDFNRDDGKTIDNQGAISTVISQLKRKERPTYSGDLQAKWLLEEIPYS
KALSAQYYAEDDVGSEGYIIFNDELAIIGVRGTEPYFQSKKPPVDNTKFKIIKAASGMAA
VIADKIESATDSPGMKDLIITDLDAAQIAPEEFGGTYVHRGFYQYTMALLSLMEKDLGLH
KIKKFYCCGHSLGGAGALLISALIKDSYHPPVLRLYTYGMPRVGTRSFVERYQNILHYRH
VNNHDLVPQIPTVWMNTDVSEGFHVLDVFKSRVDLMRKMLTDDDDDNYQHHGHLSQLLTY
NSNNQVLLTPKQTQVTMLDLANLATNDSVAMVDGLSDASIVEHGMEQYIPNLFEQLTALS
DESLMVHYQRAISALEQEIATLQQSYLTVKQAWIESIGNGTPTMNIGRLMSEMHSINKLI
ENRNKIRGELRQIVSDPQRMPATKFLISQQTLPDEIKVQIR
NT seq
1926 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcatttaattattgcgtgcagtgtaaccctgaggaaaactggttagagctagag
tttcggagtgaaaatgatgaaccgatagatggtttgctagttacgattacgaaccaaagt
gccccctctaacacatacacgcaaaccacaagttcgggtaaggtgttgtttggcaagatt
gcggctggggaatggcgtgcttctgtaagccaagcttctctgttaactgaagtcgaaaaa
tatgccagccgtaaagagggacaagagtcgccagtgaaaaaacgagctgcggcagaactt
gacgccgcagataaagatacgaagcagtaccgctttaccactattggtgatttctgggat
gaagcaccaaaagatgagtttttacaaaagcagcataaagggatagatgtcaatgcttct
gctgagaaagcagggtttagactcagtcataaccagacctatgtttttgaaatcaaagca
ctacgtagctatatgccagtgattattgataccgatgaatttaacttggtgaatagttat
acctttgcgttgttgtcgaaattagcttatgcgactaacgattttaatagggatgatggt
aagacaatagataatcagggagcaattagcacggttatttctcaattgaagcgtaaagaa
agaccgacttattctggagatttacaagcaaagtggttattagaggaaattccatatagc
aaagcgttaagtgcccaatattatgctgaggatgatgtcggtagtgaaggttacatcatc
tttaacgatgaattggcgattataggtgtgagaggtacagagccttattttcagagtaag
aaaccacctgttgataacactaaatttaaaattataaaagcggcttcaggtatggcggct
gtgattgcggataagatagaaagtgctaccgattcaccaggaatgaaagaccttattata
acagaccttgatgctgcgcaaatcgcccccgaagagtttggtggaacatatgttcatcgg
gggttttaccaatatacgatggctttgttatctttgatggagaaagatctagggctacat
aaaataaaaaaattctattgttgtggccatagcttagggggcgctggtgcattacttata
agtgcattgattaaagatagctatcatcctccagtattgcgtttatatacatatggaatg
ccacgagtgggaactcgcagttttgtagagcgctatcaaaatattttgcattaccgtcat
gttaataatcacgatttggtgccacagataccaacagtatggatgaacacagatgtatct
gaaggattccatgtacttgatgtatttaaaagccgtgttgatctgatgagaaaaatgctc
actgatgatgatgatgacaattatcaacaccatggtcatttgtctcagttactaacttat
aattcaaataaccaagtcttactgacacccaaacaaactcaagtcactatgctagaccta
gcaaatttagccactaatgattctgttgctatggtagatggtttatcagatgcctcaata
gtagagcatggaatggagcagtatatacccaatttatttgagcagttaacagcactaagt
gatgaaagtttaatggtgcattatcaacgagcgatttcagccttagagcaggaaattgct
acgttgcaacaaagttatcttacagttaaacaagcttggattgaatctataggaaatggc
acgccgactatgaatatcggacgtttgatgagtgaaatgcattctataaataaattaata
gagaaccgtaataaaattagaggtgagctaaggcagatagtctctgatcctcagcgtatg
cctgcaactaaatttttaatttcacagcaaaccttaccagatgaaatcaaggtgcaaata
agatga
DBGET
integrated database retrieval system