Vagococcus carniphilus: H9L18_11470
Help
Entry
H9L18_11470 CDS
T06797
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
Organism
vcp
Vagococcus carniphilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
AAA_22
G-alpha
DEAD
RsgA_GTPase
TsaE
NB-ARC
ABC_ATPase
AAA_30
nSTAND3
AAA
AAA_14
Zeta_toxin
AAA_18
AAA_16
AAA_17
AAA_19
AAA_29
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNN72469
LinkDB
All DBs
Position
2366131..2367873
Genome browser
AA seq
580 aa
AA seq
DB search
MTDKSSIFSMLKFMFSKIKNEKKMLIISFTFLLGISFFEFKIPQITQQMIDVSIPAKSFY
QIGMNVLSILAFALCLSFLTYYSNIVMSRVSQHMIANLRDELYEHVLKQDFAYFENSKTG
DLMTRLTGDVKALQDLISAQSLKLISNLFTFVFIYIFMLMQDVKLTLLITITFPLLYFLN
TFFSKHIKQAFKKVRASTSEINNHLQTSLTSILLIKTFVNEEKEAEDFHQLNIKTRDNFL
EAMKYQTVFSPTIELVNYMGMAIVLLYSGYGIIHGKQTVGELVAYLSYLKMLQNPIRSFT
QMVSRFQQAVVSYQRILDIYEAEPLVVDCENPIVLSDLKENISFDKVSFHYPTYEKNILN
ELDFTLEKGKMLALVGVSGSGKTTITKLITRLYDVSSGEIRIDNENIQHFSLGSLRQNIG
MVTQEIELVDGTILDNILYGSKEKTEEDIRQALKAAKLADFIDSLPKGLHTEIGERGIKL
SGGQKQRVAIARIFLKNAPILILDEATAALDNESEKYIQESLNQLLNDRTSLVIAHRLST
IQKADDIIVLEDGKILERGTHKELLASSGRYKELYEAQFN
NT seq
1743 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgataaatcaagtatttttagtatgcttaaattcatgttctccaaaataaaaaac
gagaaaaaaatgttaattattagttttacttttttacttggtatttccttttttgaattt
aaaattcctcaaataactcagcaaatgatagatgtttctattccagctaaatccttttat
caaattggtatgaatgttttatctattctcgcctttgctctttgtttaagttttttaact
tattactcgaatattgtcatgagtcgtgtcagtcaacacatgattgctaacttacgagat
gaattatatgaacatgttttaaaacaagactttgcttatttcgaaaattctaaaactggt
gacttgatgactcgcctaacaggagacgttaaagctcttcaagatttaatttctgctcaa
agtttaaaattaatttctaatttatttacttttgtcttcatttatatttttatgctcatg
caagatgttaaattaactctactcattacaatcacttttccgctgctttattttttaaat
acttttttcagtaaacatatcaaacaagcatttaaaaaggtacgtgcctctacctcagaa
attaataaccatcttcaaacaagcctgacttctattttgcttattaagacatttgttaat
gaggaaaaagaagcagaagattttcatcaattaaatattaaaacacgtgataatttcctt
gaagctatgaagtatcaaacggttttctctcctacaattgaattagttaattacatggga
atggctattgttcttctttattctggatatggcattattcacggtaagcaaaccgttggt
gaactggttgcttatctgtcgtatttaaaaatgctgcaaaatcctattagatctttcact
caaatggttagtagattccaacaagcagtagtttcttatcaacgtattttagatatctat
gaagctgaaccacttgtcgttgattgtgagaatcctatcgttttatctgatttaaaagaa
aatatttcatttgataaggtatcatttcattacccaacatacgaaaaaaatatcctaaac
gaacttgattttacacttgaaaaaggtaagatgctggcacttgttggtgtctctggttct
ggtaaaacaactataaccaaattaatcacccgtttatatgatgtttcttctggcgaaata
agaatcgataatgagaatattcagcatttttctctaggttcacttcgtcaaaatattggg
atggtgactcaggaaattgaattagttgatggcactattttagataatattttatatggt
tcaaaagaaaaaacggaagaagacattagacaagcgctaaaagctgcaaagctagctgat
tttatcgactctttacctaaaggtcttcatacagaaattggcgaaagaggcattaagctt
tcaggaggacaaaagcaacgtgttgccattgctcgtatttttctaaaaaatgcaccgatt
ttaattctggatgaagcaacagctgctcttgataatgaatcagaaaaatatatccaagaa
tcattaaatcagctactaaatgacagaacctctcttgttattgctcaccgattatccact
atccaaaaggcagatgatattattgttttagaggatggtaagattttagagcgtgggact
cataaagaattacttgcaagcagtggtcgttataaagagctttatgaagcacaattcaat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
