Vibrio crassostreae: IS519_04120
Help
Entry
IS519_04120 CDS
T08776
Name
(GenBank) ABC transporter permease
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
vcra
Vibrio crassostreae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vcra00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vcra02000
]
IS519_04120
Transporters [BR:
vcra02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
IS519_04120
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
MacB_PCD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UPR30480
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(937359..939812)
Genome browser
AA seq
817 aa
AA seq
DB search
MLWPVVKALLGHYRRYPLQIILVWLGLTLGVSLLVGVTAINQHAKQSYAHGEKLFSNPLP
YRIRPKHNANKIPQGFYIHLRREGFQQCSPLDHHRITDENGANFMLVGIDPVSMLQLQPG
IALKDLTALNLMKPPYPILVSDDLAEHMEWHNGDYIPLMDGSELGPVVVDQNNLINGTRL
IADISLLRMLKRSAGLSVIACSDMSTEKFERLKNMLPNGLTISRSSKAELESLTSAFHLN
LKAMGMLSFVVGLFIFYQAMSLSFIQRQPLVGILRQTGVSGWQLAKALCLELLILVVLSW
ICGNVFGVMLANQLLPAVSSSLGDLYDANIGLTIDWNWRWSGYSLLMALLGAFLACAWPL
VRLLRSQPIRLTSRLSLMRFAGTEFTWQALIGCGFLVAAVAVYQAPQTQETGFAIIALML
ISVALFTPFLMWKLFNGLSYSLRWVRARWFFADAASSMSYRGVATMAFMLALTANIGVET
MVGSFRDTTDKWLTQRLAADLYIYPTNNAAARMSNWLSDQPEVDSVWWRWEKDVASPVGS
IQVVSTGPSEGELEALTIKLGIPNYWYHLHHSKGVLISESMSLKLGIRPGDYIDLYDSLG
SGWQVVGVYYDYGNPYHQVMMSHRNWLYGFAGRGNVGLGVILKDDVNSLGLRSRLESVFR
LGSERVFDNNNIHSQAMRVFDRTFAIADTLGNITLVIAVFGIFFATVAGEVSRQRHISLQ
RCLGVSAKELILTGSLQLFVFGLISSLIAIPLGLALASLIVDIVIKQSFGWSLELQVIPW
DYLQTFAWAMAALMLAGALPVMRMIRNTPMKSLRDAL
NT seq
2454 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttatggcccgtagttaaggcgctactcggtcactatcgacgttacccactgcagatt
attttggtatggcttggtttaaccctcggcgtatcacttttggttggtgttactgctatc
aaccaacacgccaagcaaagctacgcgcatggcgaaaaactcttttcgaatcctctccct
taccgtattcgaccaaaacacaacgccaataaaatcccgcaaggcttttatatccacctt
cgccgtgaaggctttcaacagtgttctcctcttgatcaccatcgtatcactgatgaaaat
ggcgcaaacttcatgcttgtcggcatagaccctgtttctatgcttcagctacaacctggt
attgcgttaaaagatctcaccgctttgaatctcatgaagccaccatatccaattcttgtc
agtgatgatcttgctgaacacatggaatggcacaacggtgattacatccctttgatggat
ggttctgagcttggccctgtggttgttgatcaaaataacctgattaatggtacaaggctg
attgcggatatatccttgcttaggatgcttaaacgcagtgcggggctttctgtaattgcg
tgttcagacatgtccactgagaagtttgaacgtctcaaaaacatgctacctaatggtttg
acgatctctcgtagctctaaggcagagcttgagtcgctaaccagtgcgttccacttaaac
ctaaaagcgatgggtatgctgtcgtttgtggttggcttattcattttctatcaagcgatg
tcgttgtcatttattcagcgccaaccgttagtcggaatcttaagacaaacaggtgtatct
ggctggcagctggctaaagcgctgtgcttagaattgctgatattggtcgtactgagctgg
atctgcggtaatgtatttggggtcatgttagccaaccaattattaccagcggtatcttca
agcttaggcgacttatacgacgccaacattggcttaacgatcgactggaattggcgatgg
agcggctacagcttattgatggcgttacttggtgcgttcttagcgtgtgcttggccattg
gtgcgtttgcttagatcacaaccgattcgtttgacttctcgcttatctttgatgcgcttt
gcgggtactgagtttacttggcaagcattgattggctgtggtttcttggttgccgctgtc
gctgtgtatcaagcccctcagactcaagaaacgggttttgcgattatcgcgctaatgctg
atcagtgtggctctatttaccccgtttttgatgtggaagttatttaacggcctctcttat
tcattgcgctgggttcgtgctcgctggttctttgctgatgcagcgtcaagtatgagttac
cgtggcgtagcgaccatggcctttatgttggccttaacagccaatattggtgtagaaacc
atggtgggcagctttagagataccactgataaatggctaacgcagcgtttggctgccgat
ctttatatctacccaaccaacaatgccgctgctcgtatgagtaattggttatctgaccaa
cctgaagtggattcggtttggtggcgttgggagaaagatgttgcgtctccagttggtagc
attcaggtggtcagtacaggtccttctgaaggtgagctagaagcgctgacaattaaatta
ggtattccgaattactggtatcacttgcatcactctaaaggtgtgttgatcagtgaatcg
atgtctctcaagctggggattcgccctggcgattacatcgacctctatgacagtctcggc
tctggttggcaggttgtcggtgtttattacgattatggtaacccttaccatcaagtcatg
atgtcgcatcgaaactggctgtatgggtttgcagggcggggtaatgtcggacttggcgta
atactcaaagacgatgtgaattcattagggcttcgcagtcgattggaaagcgtatttaga
cttggttctgagcgtgtgttcgataacaacaatattcacagtcaagcaatgcgggtgttc
gataggacgttcgcgattgcagatacactagggaacatcaccttggttatcgccgtcttc
ggtatcttcttcgcgacggttgcgggagaagtgtctcgccaaaggcatatttccttgcag
cgctgtttgggtgtctcggcgaaagagctgatcctgacaggtagtttgcagttgtttgtg
tttgggcttatttcctccttaattgcgattccgctcggattggcgttagcgagcctaatt
gttgatatcgtgataaagcagtcttttgggtggtcactcgagttacaagtgattccttgg
gactatttgcagacatttgcatgggccatggcagcattgatgctagctggtgctttacca
gtgatgagaatgattcggaacactccgatgaagtcactgagggatgcgctttag
DBGET
integrated database retrieval system