Vespa crabro (European hornet): 124424654
Help
Entry
124424654 CDS
T09462
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat protein SHOC-2-like
KO
K19613
leucine-rich repeat protein SHOC2
Organism
vcrb
Vespa crabro (European hornet)
Pathway
vcrb04519
Cadherin signaling
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vcrb00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04519 Cadherin signaling
124424654
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_14
LRR_8
LRR_4
LRR_9
LRR_13
LRR_LRWD1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124424654
NCBI-ProteinID:
XP_046819981
LinkDB
All DBs
Position
6:6701061..6703883
Genome browser
AA seq
587 aa
AA seq
DB search
MEKDNLKILVYQEQSESTVNQCWPCLIESSNKNSVPMNNYTKGSLNFKSILYIQNIYNSS
NKLLPNKLTNLIKLDLSNNYLKDLPDYLDLLKNLQHLILNNNQLSCLPSVIGNLEKLVSL
KVHNNNIKEIPENIGNLSNLEDLDLGSNKLRDIPGSYKMLNRLKYLSLANNNFMYTPDCL
RTGMCSLEMLDLSQNNHIMLNVPLCSIKIKRFYAKENDICPSFLNWIFTNKYYKLEEVLL
DYTVFQKFNFPSEEIPMLNITKLSMVQCQLSEQLLSEIIKRLKCPESLNIGNDEITKKGN
TFWALPIKDIQDKSNLKEINLHKTNIPMIPKCINEFLALVTIDASCNNITWLPDEICDLH
NLQNLIINNNLLVSLPDSIGQLTSLKTLIASYNALTCLPSSMMRLNNLQFLDLYDNKFFT
ATDININMTCLQGIDLEQNYFSTNDLPITKSYENLRAVLLEYWNKEFREVGLKKESECSD
DNESLYSFYSYKINDDELQEVQNSSEWVEENWDDSDNSADEFDPNEYWKPKLRQCSPIFA
YKRQILQSHFCPADLHAKSILKHFRQMLNNDTFSSNTEFETGQFEDV
NT seq
1764 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagaaagataatctgaaaatattagtatatcaagaacaatctgagagcacagtaaat
caatgttggccatgtcttatagaatcgtctaacaagaattcagtaccaatgaacaattat
acaaagggatcattaaattttaaaagtatcctatatatacaaaatatatataattctagt
aataaacttttaccaaataaattaactaatctaataaaattagatttatctaacaattat
ttaaaagatctacctgactatttggatctattaaaaaatctacaacatcttattctcaat
aataatcaactttcatgtttgccaagtgtaattggaaatctagaaaaattagtatcttta
aaggtacacaataataacataaaagaaattccagaaaatattggaaatttatcaaatctt
gaagatttggatttaggttctaataaattaagagacattccagggtcgtacaaaatgtta
aatagattaaaatatctttctcttgctaataacaattttatgtatactcctgattgcctt
agaacaggaatgtgtagtttggaaatgttagatttatcacaaaataatcatattatgttg
aatgttccattatgtagtattaagattaaaagattttatgctaaagaaaatgatatctgt
ccatcatttttaaattggatatttactaacaaatattataaattggaagaagtattatta
gattatacagtgtttcagaaatttaattttccaagtgaagaaataccaatgttaaatatt
acaaaattatcaatggtacaatgtcaattgtctgaacaacttttgagtgaaattattaaa
agactaaagtgtcctgaaagtttaaatattggtaatgatgaaataacaaagaaaggaaat
acattttgggctttaccaattaaagatatacaagataaatctaacctgaaagaaataaat
cttcataaaacaaatattccaatgatacctaaatgcataaatgagtttctggctttggta
acaatagatgctagttgtaataacattacttggttacctgatgaaatatgtgacttgcat
aatttacaaaatttgataataaataataacttattagttagtttgcctgactctattggc
caattgacatcacttaaaacattaatagctagttataatgcattaacttgtttaccaagt
tctatgatgcgtttaaataatttacagtttctggatctttatgataataaattttttaca
gcaacagatattaatattaatatgacttgtttacaaggaatagatcttgaacaaaactat
ttttcaactaatgatttaccgatcacgaagagttatgaaaatttaagagctgtattatta
gagtattggaacaaagaatttagagaagttggtttaaaaaaggaatctgaatgcagtgat
gacaatgaatctttatattcattttactcatataaaattaatgatgatgaattacaagaa
gtacagaattcttctgaatgggttgaggaaaattgggatgattcagataattcagcggat
gaatttgatccaaatgaatattggaaaccgaaactccgacaatgttctccaatttttgct
tataaaagacaaattttacagtcacatttttgtcctgcagatttacatgctaaatcaatt
ttaaagcattttagacaaatgttaaataacgatactttctcttcgaatactgaatttgaa
acaggtcaatttgaagatgtctga
DBGET
integrated database retrieval system
