Vespa crabro (European hornet): 124426516
Help
Entry
124426516 CDS
T09462
Name
(RefSeq) sorting nexin-13-like isoform X1
KO
K17925
sorting nexin-13
Organism
vcrb
Vespa crabro (European hornet)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vcrb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
vcrb04990
]
124426516
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
vcrb04990
]
Phox homology (PX) domain-containing proteins
Sorting nexins
124426516
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PXA
Nexin_C
PX
RGS
TerC
Imm9
ORF239-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
124426516
NCBI-ProteinID:
XP_046824230
LinkDB
All DBs
Position
1:21094823..21100938
Genome browser
AA seq
1113 aa
AA seq
DB search
MQYVRKYTKSNLLESSKMNIRLYGIVGAIIIFLIAIFGIGLIVKLFVCLLVLIIGIMICI
NRISTLSDNNALISEREDIIKKTDHFRQYIFNLSKEKINFTLDRRITGSRIIDESLQEIL
DFILRDYVQSWYSSITDDKEFLYSVRNNAQKIAINIANRVKAVDWIPYLTTRLVDDAASH
MRLYRQAQLRIKERRAQKLYKGSASSSTSGGTPKRMPTHRRNKSETDISWYTQSKFYIPN
LSSLIEPIELGDQNEEESLEKIFFDLEVQMENNLICRDVVCTNKAQERELLCEISEGLLH
LILPKEDYDCLTVRYFLKELLANAIIKPLLNLFSDPDYINQAFIWLCNKESGLPSEIFLT
VIRITDNLEELMATKNIISKEITHLRSKDLTGDDDLSAKQRLNSLLYFKKILEARIVGMQ
EGLESEGDGIGTQPDWNRLIVPGQKLVNLPLDELLKNNIALSYFIDYMTSINAEAYLYFY
LNIYGWRVSAEQQIADIHLQKIQTGPSTSSIVNTKRKNIDLENLKEAALKIYQQYLSDKA
SSKLQLDDLLVKNLVTKIKTETVKEIWFDDLLVCCYEKLQNEDRFLPSFKKSLAYIKLLA
ELDLLKDPTSEDDTKSLKSINLTSVNDELNTLQNLTESCTNSEANITARKEGKLKSNSSL
NLIDTLESSESKSCSDIEKKSLSNTKDTKNIQKVSSIDLDQINEGKDVAFYLDSNVDQCI
TLDEKNCDLSVIKKLQQGRFEITAKIIETGIVNDRGKTYGIYAVAVTKCYDSGYQEKWHI
YRRYSDFYDLYQKIKEKYYDLAKIPFPAKKAFHNMERTVLEKRMLMLNAWLHQLTKPAVV
DGHMGLQNLLLAFLEQGDYDKGVTGGQISRTLDNLMNPLKTSMKSVTQAVKTMPDNMLST
VDGVMDNISKFFGNPRKSNVFYEHTKVGASLDVETNDNIPLRIMLLLMDEIFDLKVRNQW
LRRRIITLLRQIIRTMFGDIVNRRIIEYVSLITSPTKVAGYLRFIKNSLWPNGIKAESKP
IRDSEIKYRTRVVAKVALLSCFSDDLKHIIGSETTRHGLLRVFELFQQPVLNRRLLYVLL
EGILETLFPKSNIGDIFKKVYCTSSRLKDKIKT
NT seq
3342 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaatatgtacgtaaatatacaaagagcaatttattggagtcttcgaagatgaatatt
cggctgtatggaatagttggagccatcataatatttttgattgccatttttggcataggc
ttgatcgtaaaactttttgtttgtttgcttgttttaatcataggaataatgatctgtata
aatagaatatctactctcagcgataataatgctctaatatcagagcgggaggatataatc
aaaaagactgatcactttcggcagtatatttttaacttatccaaggaaaagattaatttt
acattagatagaagaattactggcagtcgtattatcgatgaatctctgcaagaaatttta
gactttatcctcagagattatgtgcaaagttggtacagctctattacagacgataaagaa
tttctctattcagttcgcaataatgctcaaaaaattgccatcaatatagcaaatcgggta
aaagctgttgactggataccatatttaactacgcgtcttgttgatgatgctgcttcacat
atgagattatatcgtcaagctcaactaaggataaaagaacgtagagcgcagaaattatat
aaaggcagtgctagttctagtacttcaggtggaacgcccaaaagaatgcccacacatcga
cgcaataaaagtgaaactgatatatcttggtatacacagtcaaaattttatattccaaat
ttatcatctctcattgaacctattgaacttggagaccaaaatgaggaggaatctttagaa
aaaatattctttgatcttgaagtgcaaatggaaaataatttgatatgtagagatgtcgta
tgcacaaataaagctcaagaacgagaattattatgtgaaatatcagaaggtctcttacat
ttaatattgccaaaggaagattacgattgtttaactgttagatattttttaaaagaatta
ttagcaaatgccataattaaaccattattgaatctattctctgatcctgattatattaat
caggcatttatatggctgtgtaataaagaaagtggattgccgagtgaaatctttttaaca
gtaattagaataactgataatttggaagaactaatggcaacaaaaaatattatttctaag
gaaataacacatctacgttcaaaagatttaactggggatgatgatttatcagcaaaacaa
cgattaaatagtttactttattttaaaaaaattttggaggcaagaattgttggaatgcaa
gagggtttagaatcagagggagatggaattggtactcaaccagactggaatagattaatt
gttcctgggcaaaagttagttaatctgcctttagatgaattgttgaagaataacattgca
cttagttattttattgattatatgacttctataaatgctgaggcatatctgtacttttat
ttaaatatatatggttggagagtatcagcagagcaacaaatagcagatattcatttacaa
aaaatacaaactggtccttcaacctcaagtattgttaatactaaacgtaaaaatatagat
ctagaaaatttaaaggaggctgctttaaaaatttatcaacagtatttgagtgataaagca
tcatcaaagttacagttagatgatttattagtaaaaaatttagtaacaaaaataaaaact
gaaactgttaaagaaatatggtttgatgatctcttagtttgttgctatgaaaagttacaa
aatgaggatagatttttacctagttttaaaaaatcacttgcatatattaaacttcttgct
gaattagatttgctgaaagatccaacctctgaggatgatacaaaatccttaaaaagtata
aatttaactagtgttaatgatgaattaaatactttgcaaaatttaacagagagctgtact
aacagtgaagcaaatataacagcaagaaaagaaggcaagctaaaatcaaattcttcatta
aatttgatagatactcttgaatcaagtgaatctaaatcatgcagtgatattgaaaaaaaa
tctttaagtaatacaaaagatacgaaaaatattcaaaaggtatcaagtatagatttggat
caaattaacgaaggaaaagatgtagctttttatttagattcaaacgtagatcaatgtatt
acgttagatgaaaagaattgtgacttaagtgtaattaaaaagctccaacaaggtcgtttt
gaaattactgcaaagataattgaaactggtattgttaatgatcgtggtaaaacatatggt
atatatgctgtggctgttaccaaatgttatgattcaggttatcaagagaaatggcacatt
tatagaagatattctgatttctatgatttgtatcaaaaaataaaagaaaaatattatgat
ttggccaaaattccatttcctgctaagaaagcctttcataatatggagaggactgtattg
gaaaaaagaatgttaatgttgaatgcttggttacatcaactaacaaaaccagcagttgtt
gatggccacatgggtttacaaaatctcttattagcatttttagaacaaggagattacgat
aaaggggttactggaggtcaaatttcacgaacgttagataatttaatgaatcccctaaaa
acatccatgaagagcgtgacgcaagcagtaaagactatgccagataatatgttgagtaca
gtagacggtgttatggataatataagtaaattttttggtaatccaagaaaaagtaatgtt
ttttatgagcatactaaagttggtgctagcctggatgtagaaacaaatgataatattcca
ttaagaataatgttattattaatggatgaaattttcgatttaaaagtaagaaatcagtgg
ttaagacgaaggatcattactttattaagacaaattattcgtacgatgtttggtgatatt
gtgaatagaagaataatagaatatgtttcattaataactagtcccacaaaagttgcagga
tatttacgattcattaagaatagtttatggcccaatggtataaaagctgaaagtaaacct
attcgagattcagaaataaaatatagaactcgagtagtagccaaagtagcattgctctct
tgtttttcagacgatttgaagcatatcataggtagtgaaacaacaagacatgggctccta
agggtgtttgaattatttcaacaacctgtattaaatagaagattattatatgtattactt
gaagggattctagaaactttatttccaaaaagcaacataggagatatatttaaaaaagtc
tactgtacgtcttctcgtttgaaagataaaattaaaacgtaa
DBGET
integrated database retrieval system