KEGG   Vespa crabro (European hornet): 124428829
Entry
124428829         CDS       T09462                                 
Name
(RefSeq) rotatin isoform X1
  KO
K16484  rotatin
Organism
vcrb  Vespa crabro (European hornet)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vcrb00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   03037 Cilium and associated proteins [BR:vcrb03037]
    124428829
Cilium and associated proteins [BR:vcrb03037]
 Primary cilia and associated proteins
  Other primary cilia associated proteins
   124428829
SSDB
Motif
Pfam: RTTN_N MutS_C
Other DBs
NCBI-GeneID: 124428829
NCBI-ProteinID: XP_046829322
LinkDB
Position
13:complement(2552978..2562275)
AA seq 2169 aa
MSSLNTITFAHVKKLGHSIDEIRGRALENIISKLDLGFGCDSDVVKKELIVKLFHWFTFD
NIPHPREALDLLYRLTKGGNNNYLNAFGRSRFQNELHQLKRKLDTSWHDKVDQIEQVILN
PDKEESSNDIKRNIKTLLDPSRISFKQTEYMKRIHNYDNYGSKDFNADTINASNDACAFV
SPLDNTLPVDLTVQHSDGTLVSKTVEGGIKWLVMPWQPLVTSDKGVLAAVEEALNNTADT
NLILHTCQFITNVMLQDFPAEVFLQRPAIVSVLHALLDTSINIIEPDIKYIIPAVLKALH
KLTRCLRFRIYYYYDPCVANKKQKLLAEKLDNNSYHLSEARDSPDGGIPEANYQAYQSAA
TSDRSQSIMDNVDESVLRLQQMLIPSYCIETLKHVISQLNIPNDSTFPLKNTKYIVDLIH
ELAQLLLITVMPNIWICNDNMARKISDELKMLLTLLGDSLEYFANYGSIDYHRITYLHLL
CITVNLLSNIVPFEVANIILPKSIKNSMSIALMDAPIYLMYPKLHTALQVYIQHLEDSNE
LAIIKIFEESRVIIKSMQAAICSIKESSRGSHSDILKILYASKLSLPYHKNMSIVKKTIK
FLQNINRYSLSKEDHVICRKLILNLLANGDTDIQELAYKECHCLVKSILGIEYNKEKLTW
ENLIFLLEPNVLTEIICYGLPNENKKIREMSEEMIIYILKGKVQADETGWLKILETIIPV
LPLLQCYAYSSTVIGRCITKMLDPDIFNSIHLPYLEVLKGNLRLLYSAECDVREEASCRL
IWLLGKEKDSIKKLPRLSSLHGLPLSSLCIFERPSVFKRLEGNYQRSSLLSVLEMLRDSE
IDPKMRKSALVQINVMLTDTSLHKLFLNENGLFLILQTFNSALIENDYKNYPDSVIPILA
ILKLIVASESSVRHELSTNIDIFINIIRSIFLFPNNECVKADGSYILCLLLYNDYIIRMN
EKQTESNIQLTVSLPHIIVIKMKLPLICKSHWKTSVHRRSEISVLHGSNQTILTFVRQYW
AWEWNGGWKMLWKNYDDVNDSELPEKLRIQEHEFFIFQYSCSYFYCQKQLYNVQNSTTHD
GVLNALDYLIMYIKFYNMLQYEEIKDINSLPWEQTFERFLSSHPSSKEDCDLFVNIINFL
QLYISIAKGKSSWISKMMKNMTKSWADLFQNLEVDNQDVHQSILKLARTCAAIERNERSD
INQKHTWIHFIELVVSTLCFGNQQHFYNLAYLDWLLTCLTYLISQCDWSNHKNLLASLGN
TLIEMIISFHGAGTVSFMGLSITRNSIICLNHLLYQMHENFNKNTWISFWYEDSRSLSWL
PMLWQNRDPLVRASALQLLSGLLNEMHSASQLSNAIAVAPNELCYMLLQYIIIGEESCIV
REQACIAFSNLIKNCNSMSFQHIDSLKTNIILIYTEQVNFYYEMSILYSNIYMLPTLDSD
LLNNEQQKDDKVPSVQAATSGCVSLVPRTVSYLYNCHDELLPFSGVDSESMDMDHYLLSV
ATPSLVTATCTLLNNLILIGQQEVVRHVYEQSLDKYLIRCLKEIPKNIDTKKDLIHYCDM
LEMYISICVVLSNCVIHSNEFAAVASFTPDCIYSLFNLLHFDLYSIHMSHLISLYNKLKA
EIYNFLSILSLTDDQHFESIQTALELYGPDKALTSICTAIKDTDTELRMNAIACLTFLLT
QEIQKETLGKNNISIKTILDSIIYIPINNQSNNLQEVITNINKLSIRSINLHSKKANRND
EIDDYTVNSDNIKMKSDEQQYTIGAELCKVLLPLFIAHNYTRSKKSRKHIENRDLIVSAL
ANLLCVSMEAKKIALKENLSETALMILKELYVKLNLQPFELYKNQVDREKKINPLFSDIN
NIFILLMNFMHENLQVKETLTKDGLADVLHKLWAWIALNKNISSCALKLLATFTTKCSAA
AQSLTLTTVLPGTGLRKTPNTIAIIHIIIQLICKEIDKAGHLFDNNKLHFAFHVLRNAVH
VHECRVSISKSNLLQFFTKIHPITTKRVKPWPLVELYCLEFLIDFTYYEEGQICVPKAVD
GLDSLIHLAKCSSSPTKILAISILRNLAFNMANRPRILSSVDVINLLHDVFKNGSLCEIR
IAGSMLWSLICNNQKGKLIARTAGFPQSIQEALGRLTLLTTNNVEQEQDVVKILEYLIRL
ISPIENKSD
NT seq 6510 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaagtttaaatacaattacatttgcacatgttaaaaagttagggcacagtattgat
gagatacgaggaagggcattagaaaatattatttctaaattagatcttggttttggatgt
gattctgacgttgttaaaaaagaattaatagttaaactctttcattggtttacctttgac
aatatacctcatcctagagaagctttagatttgttatatagattgacaaagggtggaaat
aacaattatttaaatgcatttggcagatcaagatttcaaaatgagttacatcaattaaaa
agaaaacttgacacttcatggcatgataaagttgatcaaatagaacaagtcattttaaat
ccagataaagaagaatcatccaatgacattaaaagaaatattaaaacattattagatccg
tcaagaatatcatttaaacaaacagagtatatgaaaagaattcataattatgataattat
ggaagtaaagattttaatgctgacacaattaatgcttccaatgatgcttgtgcttttgta
tctccattggacaatacgttgcctgtggatcttactgttcaacatagcgatggtacactt
gtttccaaaacagtagagggtggaattaaatggttagtaatgccatggcaaccattagtc
acatcggataaaggtgtattagcagcagtagaggaagctttaaataatactgcagatact
aatctgatattacatacgtgtcagtttataacaaatgttatgttacaagattttccagct
gaagtttttcttcaaaggccagcaatagtatcagtactacatgctcttcttgatacaagt
ataaatataattgagcctgatattaaatatattataccagctgtattaaaagcattacat
aaattaacaagatgtctacgatttcgaatttattattattatgatccatgtgtggcaaat
aaaaaacaaaagttacttgcagagaaattggataataatagttatcatttatctgaagct
agagacagtcctgatggaggaataccagaagctaattatcaagcatatcaatctgctgct
acaagtgacagaagtcaaagcatcatggataatgttgatgaatctgtattacgattgcaa
caaatgctcattccttcctattgtattgaaacattaaaacacgttatctcgcaattaaat
attcctaacgattctacatttccattaaaaaatactaaatacatagttgacctaattcat
gaattagcacaattactacttatcacagtcatgccaaatatatggatatgcaatgataat
atggcaaggaagatcagcgacgaattaaaaatgttattaacattactaggagattctctg
gaatattttgcaaattatggcagtatagattatcataggattacatatcttcatcttctt
tgtattacagtaaatttattaagtaatattgtgccatttgaagtagcaaatattatttta
cctaaatccataaaaaattctatgtcaattgctttaatggatgcacctatatatttgatg
tatccaaaattgcatactgcacttcaagtatatattcagcatttagaagattcaaacgaa
cttgcaataatcaaaatctttgaagaaagtagagttattatcaaatcaatgcaagcagct
atttgctcaataaaagaatcttccagaggatcacattctgatatattaaaaatattatat
gcatctaaattaagtttgccttatcacaaaaatatgagtatagttaagaaaactattaaa
tttctacaaaatattaacagatattccctcagcaaagaagatcatgtaatatgcagaaaa
ttaatattaaatttattagcaaatggagatacggatatacaagaattggcatataaagaa
tgtcattgtttagtcaaaagtattttaggaatagaatataataaagaaaaacttacatgg
gaaaatttaatcttccttttggaaccaaatgttttgactgaaataatttgctatggtcta
cccaatgaaaataaaaaaattagagaaatgtcagaagagatgataatttatatattaaaa
ggaaaagttcaagccgatgaaacaggctggttaaaaatattagaaacaattataccagta
ttacctcttcttcaatgttatgcatattcttctacagttataggcagatgtataacaaaa
atgcttgatcctgatatttttaatagtatacacttaccatatcttgaggttttaaaaggt
aacttaagattattgtattcagctgagtgtgacgttagagaagaagcttcttgtaggtta
atttggttgcttggcaaagaaaaagattctattaaaaaattgccaagattatcttccttg
catggtctacctcttagttctctttgtatattcgaacgtccatccgtttttaaacgctta
gaaggaaattatcagaggagcagtttattgtcggtgctagaaatgttaagagattccgaa
attgatcctaaaatgcgtaaatctgcgttagtacaaattaatgtaatgcttacagacacg
tcattacataaattatttcttaatgaaaatggattatttttaattttgcagacgtttaac
agtgctttgatagaaaatgattataaaaattatcctgattctgttattccaatactggca
atattaaaattaattgttgccagtgaatcatcagtgagacatgaattatccactaatatt
gatattttcataaatattattcgcagtatatttttgtttccaaataatgaatgtgtcaag
gctgatggttcatacattttatgcttacttttatataatgattatattatcagaatgaat
gaaaaacaaacagaaagtaatattcaattaactgtatctttgcctcatattattgtaatt
aaaatgaaattaccattaatttgtaaatctcattggaaaaccagtgtacatagacgatca
gaaatatcagttctccatggaagcaatcaaacaatattgacatttgtaagacaatattgg
gcatgggaatggaatggtggatggaagatgttatggaaaaattatgacgatgttaatgat
tctgaattaccagaaaaattaaggatacaagaacatgaattctttatttttcaatacagc
tgttcatatttttattgtcaaaaacagttgtacaatgtacaaaattctacgacacacgat
ggtgtattaaatgctctcgattatctgataatgtacataaaattttataatatgttgcaa
tatgaagaaattaaagatattaattctttaccgtgggaacaaacgttcgaaagattttta
tcgtcccatccgtcgagtaaagaggactgtgatttatttgttaatattatcaatttttta
caattatatatcagtatagcaaaaggtaaaagttcatggataagtaaaatgatgaaaaat
atgacaaagtcatgggcagatttatttcaaaacttggaagtggataatcaagatgtacat
caatctattttaaaattagcacgtacttgtgcagctattgaaagaaatgaaagatcagac
attaatcagaaacatacgtggatacattttatcgaattagttgtttctactttatgtttt
ggaaatcaacaacatttttacaaccttgcatatctggattggttgttgacatgtttgaca
tatttaatcagccaatgcgattggagcaatcataaaaatttattagcatcattaggaaat
acactcattgaaatgattatatcttttcatggtgctggtacagttagttttatgggttta
tctataactaggaattctataatatgccttaatcatttgctgtatcaaatgcacgaaaat
tttaataaaaatacgtggatatcattttggtacgaagatagcagatctttaagttggtta
ccaatgctttggcaaaatagagatcctttggtgcgtgcatcagctttgcagctattgtca
ggattattaaacgaaatgcattcagcgtcacagctatcaaatgcaattgcagttgcaccg
aatgaattatgttacatgttattgcaatacattataatcggagaagaatcttgtattgtt
cgagaacaagcgtgtattgcatttagtaacttaattaaaaattgcaactctatgtctttt
caacatattgactcattgaaaacaaatattatacttatatacacggaacaagtgaacttt
tattatgaaatgagtatattatattctaacatttatatgttaccaacattagattctgat
ttgttgaacaatgaacaacaaaaagatgataaagtaccatccgtacaagctgcgacatca
ggatgtgtatcattagtaccacggacagtatcatacttatacaattgtcacgatgaacta
ctacctttttcaggagtagattctgaaagtatggatatggatcattatttattatccgtt
gcaactccttctttagtaacagcaacgtgtacccttttaaataatttaatacttattgga
caacaggaagtagtacgtcacgtttatgaacaatcactcgataaatatcttattaggtgc
ttaaaagaaattccaaagaatatcgatactaaaaaagatcttatacattattgtgatatg
ttagaaatgtatatcagcatttgcgttgtcttatcaaattgtgtcatacatagtaatgaa
tttgctgcagttgcaagttttacacctgactgtatttattctttatttaatcttcttcat
ttcgatctgtacagtattcatatgtcacatctaatttctctgtataataaattaaaagca
gagatttataattttttatctatattatcgttaacagatgatcaacacttcgaatctatt
caaacagctttagaattatatggtccagataaagcattgacttctatttgcactgcaatt
aaagatactgatacagaattacgaatgaatgctattgcatgtcttacttttcttcttact
caagaaattcaaaaagaaacattaggaaaaaataatatttcaataaagacgattttagat
agtattatatacattccaataaataatcaaagcaacaatttacaagaagttataactaat
attaataaactttctataaggagtataaatttgcattctaaaaaagcaaatcgaaatgat
gaaattgatgattatactgttaattctgataatattaaaatgaaatcagatgagcaacaa
tatacaataggtgctgaattatgtaaagttttattacctctttttattgctcataattat
acaagatcaaaaaaaagtcgtaaacatatagagaatagagatcttattgttagtgctctg
gctaatttattatgtgtttctatggaagctaaaaaaattgcattgaaagagaatttatct
gaaacagcattgatgatacttaaagaattgtatgttaaattaaatctacaaccatttgaa
ctttataaaaatcaagttgatcgtgagaaaaagattaatcctctatttagtgatataaac
aatattttcatattattaatgaattttatgcatgaaaatttacaagttaaagaaacactt
actaaagatggcttggctgatgtattgcacaaattatgggcttggatagctttgaataaa
aatatttcatcttgtgcattaaaattattagcaacatttacgacaaagtgctcagctgca
gcacaatctttaacattaactacggtattaccaggaacaggattgagaaaaacacctaat
acaattgctataatacatatcattatacaattaatatgtaaagagatcgataaagcagga
cacctttttgataataacaaattgcattttgcttttcatgttttacgaaatgccgtacat
gtacatgaatgcagagtctcaatttcaaaaagcaatttattacaattttttacaaagata
catcctattactacaaagagagtaaaaccttggccactggtagaactctattgtttagaa
tttctaattgattttacatattatgaagaaggacaaatttgcgtgcctaaggccgtagat
ggtttagattctctaatacatttagcaaaatgttcatcttcgccaacaaaaattcttgcc
atttccattttgcgtaatttagcatttaatatggcaaatagaccaagaattcttagctca
gtggatgtcatcaatcttcttcacgatgtttttaaaaatggatctttatgcgaaatcaga
atagcaggatcaatgttatggtcattaatatgtaataatcagaaaggaaaattaattgca
cgtactgcaggatttcctcagagtattcaagaggcattaggtagattaacattattaaca
acaaataacgtagaacaagaacaagatgtagttaaaatattggaatatctaatacgtctt
ataagtcctatcgagaataagtctgattaa

DBGET integrated database retrieval system