Vibrio cholerae O1 El Tor MS6: MS6_0646
Help
Entry
MS6_0646 CDS
T03666
Name
(GenBank) accessory colonization factor AcfB
KO
K10937
accessory colonization factor AcfB
Organism
vcs
Vibrio cholerae O1 El Tor MS6
Pathway
vcs05111
Biofilm formation - Vibrio cholerae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vcs00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
05111 Biofilm formation - Vibrio cholerae
MS6_0646
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MCPsignal
dCache_1
MCP-like_PDC_1
HAMP
TPR_MLP1_2
DUF948
DASH_Duo1
SKA2
BLOC1_2
DNA_Packaging
dCache_2
Lycopene_cyc
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP02301
LinkDB
All DBs
Position
1:751154..753034
Genome browser
AA seq
626 aa
AA seq
DB search
MKFSIKLLMIFTSIIITISSILTYFQMHGTNEYLDRTIKDTISETLDSLEDKINLSIESK
VDVSKSVIDIYENLLEGESPLSKFKDVDVNHLSNVFQLFGYADERTGEIITNDPNFKVPT
GFDPRTRSWYLNAKKLNTFSLSEPYVDLITEKLMVTTSAPIYNKNDLTGVIFFDIPLDDV
QELIKSYNPFDAGTIFIVDNSGKIIFGNKNDISGKNLFGDFDSFPLSVSESKTKDKNGVN
YDVFIKMSDFGGWNLVSIIDHDKARSDIITLRNNSIFTAVILASVFFAILLFTMRLMLKP
LHQLTDAMVNISSGSADLTVRIPNSTDQEFSKIINSFNIFVGNLQSIVSEVKMNSEKINC
ITTETQELVEVCNNSVADQYRELDMLASSMNEMVATSNQIAQITSEASEITSKINGQVNE
GVGAVSSVTESVGNLVEKLDKTKSVIQDLNRQTQNIDVILKAINDIADQTNLLALNAAIE
AARAGENGRGFAVVADEVRSLAIKTQESTKNIGSIIHILQENSLLSVHVMDESFNIASET
MTISADSKQCLDNISQSVIQIVDITNQVATAAYEQSHVSEEINSNSISIKDKADTLSSLG
NKISQQAYSQKALIGHQDDLISKFII
NT seq
1881 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagttttctatcaagttactaatgatttttacatcaattataattactatttcatct
atccttacttactttcagatgcatggaaccaatgaatatcttgatcgtacgataaaagat
actatttctgaaacgctagactctttggaagataaaataaatctttctattgagtccaag
gtcgatgtgtcaaaatctgttatcgacatttatgaaaatttactggagggggaatcccct
ctcagtaaatttaaggatgttgatgtcaatcatctttcaaatgtttttcaattgttcgga
tatgctgatgaaagaacaggagagatcattactaatgacccaaactttaaagtgcctaca
ggattcgatccaaggactcgatcgtggtatttaaatgcaaaaaaattgaatacctttagt
ttgtctgagccgtatgtcgatctcattacagagaagttaatggtgacaacaagtgcacca
atatataataaaaacgatttaacaggagttatattttttgatataccactagatgacgtt
caggaattaattaaaagctacaatccatttgatgccggcacgatttttatcgttgataac
agtgggaaaataattttcggtaataaaaatgatatatcgggtaaaaatttatttggagac
tttgatagcttccctctatcggtaagtgagtcaaaaacgaaagataaaaatggggtaaat
tacgatgtattcatcaaaatgtcagactttggcggttggaatcttgtttctattatcgac
catgataaagcacgctctgatattatcacgttgagaaacaatagtatatttactgccgtc
attttagcaagtgttttctttgctatcttgttgtttactatgcggttaatgctgaagcca
ttgcatcaattaaccgatgcaatggtaaatatttcatcgggcagtgctgatcttacggtt
cgtatcccgaatagtacggatcaagagttttcaaaaataataaattcctttaacattttt
gttggtaatctgcaatctattgtgtcggaggttaaaatgaactcagaaaaaataaattgc
ataactactgaaacacaagagctagtcgaagtttgcaataatagcgtagctgatcagtat
cgtgaacttgatatgctagctagctcaatgaatgagatggtggcaacatctaatcagatt
gcacaaattacatccgaagcatcagagatcacatctaagattaacggtcaagtgaatgaa
ggagtcggtgctgtttcttctgttaccgaaagtgtaggtaatttagttgagaagttggat
aagacgaaatctgttatccaagatcttaatcgccaaactcaaaatatagatgttattttg
aaggctattaatgatattgctgaccaaacaaaccttcttgctcttaatgctgcaattgag
gctgcacgagctggggaaaatggacgaggttttgctgtggttgctgatgaggtacgcagc
ctagcaataaagacacaagagtctactaaaaatataggaagtattatccatatattacaa
gaaaactctttgctatccgttcatgttatggatgaaagttttaatattgcctctgaaact
atgactatatcagctgattcaaaacaatgtttagacaatattagtcaatcagtaatacaa
attgttgatatcacaaatcaagtagctacagctgcttacgaacaaagtcacgtatcagag
gaaataaacagcaactctatttctataaaagataaagcagataccttatcaagtttgggt
aataagatttctcaacaggcttattctcaaaaagcactgattggtcatcaagatgattta
atcagtaagtttatcatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
