Vibrio cholerae O1 El Tor MS6: MS6_0728
Help
Entry
MS6_0728 CDS
T03666
Name
(GenBank) hemolysin-related protein RbmC
KO
K20952
rugosity and biofilm structure modulator C
Organism
vcs
Vibrio cholerae O1 El Tor MS6
Pathway
vcs05111
Biofilm formation - Vibrio cholerae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vcs00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
05111 Biofilm formation - Vibrio cholerae
MS6_0728
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta-prism_lec
Crystall_4
FG-GAP_3
FG-GAP
Beta-prop_BBS7
PHA_synth_III_E
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP02383
LinkDB
All DBs
Position
1:842951..845824
Genome browser
AA seq
957 aa
AA seq
DB search
MTSHYIALAVGLLSLSSNVVQATTNEAEGCIISRLNGEKYCLKVGERSGYSLPSWIYAHP
VDVQAPSGVSVMLSDWDNLSYNRLAVFDRYTGNEDLKNVKAYNGAYLDFSKPRSMRVLAS
ETYPEACIVSRQTGERFCLKEGERSGYSLPAYIYGHEVDVEAPLGLGVMLSDWDNLSYNR
LAVFGGNTQNEQMRAVKAYNGETLDFSKPRSMRVVPYDGDSSALNMKLKWSWQGSAFQPN
SNQVMVTPIVAQLNDDNGDGKIDEKDVADLIVVTFEGNKYANGGLVRALSGVDGSELWSY
ANGGVIADARYSPAVGDLDGDGIVEIVTTNNRDQFITILDNQGNIKKQIPTTESGWRIVG
DITLADLDHDGSVEILAADGVYNYHSGLVFNHPWAPSSINVDVDGDQQQEVFSGGTLFQN
NGAINWQYQANDAVWFSSLVNLDNDAEPEIVASVPATFATGDNARFAVLEHDGTIKWEIN
NTANPGGGVQAVSNFLGKAQAVETSEFSKVYGYQPNNNPASIALAVDGKISVRSGFAIDA
IGASASTLVGGTGGNLNAAVNVKDIKAIDLTWGKYYWGGYHLLALDFRMSNGSVISMGSK
NYAYSKQTERFTVPAGSRIKGIKAWTAGWLLDGVQFELATQNGTNDLDVKGIVYAGYAAV
DMYNSKGERVWSVANDDTGSGKIGVSAYDFDNDGIDEVLVQDHARVRVLDGKTGKERASL
AHSTATLWEYPIVVDLEGDNNAELIVAANDFDRQYSINHGVYVYQSADSSKPWKNATRIW
NQHAFHLTNINQDGTLPTFVEPSWLSHNTYRSSTLRAAVGGESPIFGYSNTQQSQRVVTA
DNQMYLRSGFAIDAIGTTVNNLVGGPVQGTNGGVLRAPIALDQLQSVEVTSGLYNWGGYH
IVAIKFTMKDGSSVLLGSTHYASNKKVETYTVPQGKRIKQINVWTGGWLVEGFQFVY
NT seq
2874 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgtctcactatattgcacttgctgtcggtcttttgtcgttgagtagtaacgtggtt
caagccacaacgaatgaagccgaagggtgtattatcagccgcctgaatggcgaaaaatat
tgtttaaaagtgggagagcgctcgggctattccctccctagctggatttatgctcatcca
gtagatgttcaggctccgagtggtgtctctgtcatgctaagtgattgggataacctgtct
tataaccgtttggcggtgttcgatcgttatactggtaacgaagatcttaagaatgtcaaa
gcctacaacggtgcttatttagatttttctaaaccacgttcaatgcgagtactggcttct
gaaacttatcctgaggcttgtattgtgagtcgtcaaacgggtgaacgtttctgtttaaaa
gagggtgagcgctctggttactcgctaccagcgtacatttatggccatgaggttgatgtt
gaagcacctctaggtttgggggtcatgctgagtgattgggataacctttcatacaaccgt
cttgcggtgtttggtggtaacacccagaacgagcaaatgcgtgcagtcaaagcctacaat
ggcgaaacgcttgatttctcaaagccacgctcaatgcgcgttgtcccttatgacggtgac
agctcggcactcaatatgaagcttaagtggtcttggcaaggcagtgctttccaacctaac
tctaaccaagtgatggtaacgcctattgtcgcgcaactgaacgatgacaatggtgatggc
aagattgatgaaaaagatgtcgcagatttgatcgtagtgacgtttgaaggaaacaaatac
gccaatggcggcttagtgcgtgctttaagtggtgtggatggttctgagctatggagctat
gcgaatggtggtgtgatcgcggatgcgcgttattcgccagcggtaggcgatctggacggt
gacggaatcgttgagattgtgactaccaacaatcgcgatcaattcatcacgattttggat
aaccaaggcaacattaaaaaacagatcccaacgacagaaagtggctggcgtattgtcggt
gatatcacgttggcggatttagaccacgatggcagtgtagaaattctggctgcagatggt
gtgtataactaccacagcggattggtctttaatcatccttgggcgccgtcctcgatcaac
gttgatgtcgatggcgatcagcaacaagaagttttttcgggtggtactctgtttcaaaat
aacggtgcgatcaattggcagtatcaagcgaacgatgcggtttggttctcttcgctagtt
aacttagataatgatgctgagcctgagattgtggcctctgtacctgccacttttgcgaca
ggcgataacgcacgttttgctgtgctagaacacgatggcaccattaaatgggaaatcaac
aacacagcaaaccctggtggtggtgtgcaggcggtatctaactttttaggtaaagctcaa
gccgttgaaacgagtgagttctcaaaagtctatggttatcagcctaataacaatcctgct
tcgattgctttggccgtcgatggcaagatctcggttcgttcaggatttgcgattgatgcg
attggtgcttctgcttcgacgttagtcggtggtacgggaggcaatcttaatgctgcggtt
aacgtcaaagatattaaggcgattgacctgacttggggtaaatactattggggtggttat
catctattagcgctcgattttagaatgagcaatggtagcgtgatttctatgggctctaaa
aactatgcttactccaagcagaccgagcgctttactgtgccagcaggtagccgcattaaa
ggcatcaaagcttggaccgcgggttggttgttggacggtgttcaatttgagttagctacg
caaaatggtaccaatgatctggatgtaaaagggattgtttacgcaggctatgccgctgtc
gatatgtataacagcaaaggcgagcgtgtttggtctgtggcgaatgacgacactggcagc
ggtaaaattggtgtctctgcgtatgactttgataacgatggtatcgatgaagtactcgtg
caagatcatgcacgcgtgcgtgtattagatggcaaaacgggcaaagaacgtgcgtcgcta
gcgcactccacggcaacactttgggaataccctatcgtggtcgatctggaaggtgataac
aacgcagagttgatcgtggcagcgaacgatttcgatcgccaatattcgattaaccacggg
gtttatgtttaccaatcagcggacagttcgaaaccttggaagaatgcgactcgtatttgg
aaccagcatgctttccatctcaccaacatcaatcaagatggtactttgccgacttttgtt
gagccaagttggttgagccataatacctaccgttcaagcacattacgcgctgcagtgggt
ggtgagtctccaattttcggttactcaaatactcaacaatcgcaacgtgtcgtgacggcg
gataaccagatgtatctgcgttcaggttttgcgatcgatgccattggtactaccgtcaac
aacttagtcggcgggccggtgcaaggcactaacggtggtgtgttaagagcaccgattgca
cttgatcaattgcaatcagtggaggtcacctctggcctttataactggggtggttaccac
atcgtggcgattaaattcacgatgaaggatggctctagcgtgttattgggctcaacccac
tatgcgagcaataagaaagtggaaacatacactgtgccgcaaggtaaacgtatcaagcag
attaatgtatggactggcggttggttagttgaaggcttccagtttgtctactaa
DBGET
integrated database retrieval system