KEGG   Vibrio cholerae O1 El Tor MS6: MS6_1402
Entry
MS6_1402          CDS       T03666                                 
Name
(GenBank) T1SS secreted agglutinin RTX
  KO
K20276  large repetitive protein
Organism
vcs  Vibrio cholerae O1 El Tor MS6
Pathway
vcs02024  Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:vcs00001]
 09140 Cellular Processes
  09145 Cellular community - prokaryotes
   02024 Quorum sensing
    MS6_1402
SSDB
Motif
Pfam: Cadherin HemolysinCabind Big_11 Big_9 Cadherin_4 Calx-beta Cadherin_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: BAP03057
LinkDB
Position
1:complement(1589931..1596344)
AA seq 2137 aa
MGIHALLSLTNLAANQLLVIDKNGNIAIINAGEAVPEGAIILDPNSNNLMPEQEPLPVAQ
LVDAEGNVQPITDDIEQILAALEEGADPTALDDLAPAAGGLQGSSITGSASIERDGAETI
ASTQFDTSGFEAIGLSRTQSLSLLNLLQAPTAPITPIPPVDPEEPASPIVISSITGDNAA
EGSNNTFSVSLSGTTAAETTIVLTLAGDTATKGVDFNGTSVIVVINGVSQTVPVNEDGTF
QVTVPTNTNSFSVQVSTIDDNIYEGNETFTLSGAGTNSIVTGTATITDDGSNGGTDDSPV
VNGISSPTVSEGESATFDVSLSNASTTATTVTLTLAGGSATAGTDFTSSEVTITYQDGTT
QTVAVNGDGSFEVAIPAGDTTFSISVQTTDDNVYEGSESFTLSGKTATQGTAITTTGTIV
DNDEVPTIKSIGTGDVTATEGDALIFTVKLSNVSSTSTSFDFLLQDGTATSDDYGAASFS
NGVTYDASTGKITVPTGVTSFTVNVPTTNDSIEEADETVKLTIGGKEAIGTIVDNDNAPV
IDDATVNNLSESIANGTEVYDVHEARTGNDTDLDGEALQYTFVHSNNTRSTTSEDGAFSI
DPGTGKITVLDTTKLDYESATSIVLKVETTDGVNKDTADITLNLTNVNDSDTVFTKESET
FNYAEGTAAGVTLGKVTATDADGDSISYSIAQEHNVYAADDVNKERPFYQVDANGNVSLT
EAGEKAFTNDYESGRNTHTITVTATGTDGSGADTTDTIEVTLNETNIDDNAPKFEGTTDG
EYSFSYDENSAADTVLGTVKATDADKETVTYSTKSGNDNGWFAIDATTGVITLTAKGAEA
AANDFEALANVHSLVVTATEDAGLGGVKTTDITVKLNEQNIDEELSISGLNGANAELTIH
ESNLSGGSSPDHSALSKVGSFSFTSIDGLASLVIAGHSFNVAELLALNSSEATISTPYGE
LTLTGFSGDLTGGTVQYEYTLNENVDNDSATNANDTDYTDHISVTVIDVDGSQITDSLDV
KIVDDASTALDDRGEVDIVADSFTVSGVVANWTSWSNGTNVTTFDGTNAPNGGGLDNDSG
KDQIRWGQPASSYSSGYGFIDNDSALNGEFALNQDIILGTFTHYNYPVYSGGAITSASMD
VAFSVTDAHGVLTPVTLKLNFDHNETPNTNNPEASKDIIKVGNTNVTFENAGALYTLQVI
GFRIPGTNQIVTEIRTGENATNSYELVVRVGPGEGYELPSTSGNVLSNDVSGADVDMTVV
GAASGNHVSSGVSGSVGSMIAGLYGNLILLADGSYTYQVTANASSIPNDAIEIFTYTMKD
GDGDTSTALLSINVNRVTMADFNANQDHKVGLEDTVVAGNVLDNDGSKNTSVDHFTVGND
ATSHVVGSPVSLEQGELTLNSDGSYTFKPADNWNGEVPVITYTTHTGKTSTLAITITPVD
DATVTQPDHKSIAEDTIATGNVLANDCDIDSALSVTSFHVEGVNGVYTAGNTMYQLAEGT
LVLKANGDYTFDPKDNWSGSLPEITYTTNTGATGTLNIHVEAVADVPNLTINGYTSVAAI
NFEDARLNGSWDGVVANQIKGLNTIGTWHTSNNSGKVEIGYENIYVSGGSSTNKVMEIEF
NNGDKTLYTDIHAQAGRFYELDFDIAARAGSVNSSGLTIKLVPLNAYGVPILAEAITLYD
FNPTNANWLRDQKVTLPIDQTGEYRLLFESDDANSYGAILDNLAFKVVDNMGYRGDFIKL
SEISTSLNDTDTSETLSLKLKGMPEGSILKDDKGHEVTVGSNGEVDITGWDYSSLQIKTP
NHGNFNITVEATATESSNQDSATTSATIPVTVLHPNEYLGRGGVDSFLLTKSNGDNANLN
IALNAYYEGTTAVAPVTQQVAVTIDTDLVIHSGNSNDYIDLGISRADNTVYTGSSIPNFN
NSTPSQSTLADSAFMKNDVITDHDGVLLQSVQSQIQPITDTVNLGSGNDTVYGGGGNLAA
YGGAGNDTLIGGDGNDALRGGADNDYLSGGRGNDVLRGDSGNDVLIGGLGHDILTGGSGE
DLFKWVDGDLDGSTDRITDFHLSEKDKIDLSDLFDNPSEQEVTALLDSIKSTVQGDDHSS
SFKVEKNDGSSVTIQLDGVSSVELINNLASIIQIKED
NT seq 6414 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgggaattcatgctttgttgtctttaacaaatctagcagcaaatcagctgctcgtgatt
gataaaaacggaaatatcgcgatcatcaacgcaggagaggcggttcctgaaggtgcgatt
atcctcgacccgaatagtaacaatttgatgcctgagcaggagccactgcccgtagcacaa
ctggtggatgctgagggtaacgtccagccgatcaccgacgatatagagcagattttagcc
gcattagaagaaggcgcagacccgactgcactagatgatctcgccccagcagcaggtggc
cttcaagggtcatccatcacgggtagcgcctccattgagcgtgatggtgctgaaaccatc
gcgtcaacacaatttgatacatccggcttcgaagccattggcctatcaagaacgcaaagc
ttgagtttgctgaacctactgcaagctcctacggctccaattacccctattccaccagtt
gatccagaagagcctgcctctcccattgtaattagcagtattacaggcgataacgcagcc
gaaggtagcaacaataccttttccgtgagcctatcaggtactactgccgcggaaactaca
attgtgctgacactggctggtgacactgcgaccaaaggtgtcgatttcaatggtacgtca
gttattgtcgttattaatggtgtgagccagacagtgccagttaatgaagatggcaccttc
caagtaacagtgccgaccaatacaaacagctttagcgttcaagtctctaccattgatgac
aatatctacgaaggaaatgagaccttcaccctaagtggtgcgggcacaaatagcatagtc
acaggtacagcgaccatcactgatgatggcagcaacggcggcacagacgacagcccagta
gtaaatggcatcagcagcccaaccgtatcagaaggggaaagcgcaacgtttgacgttagc
ctgagcaacgccagcacaacagcgaccaccgtcactttgacattggcgggtggcagcgcg
actgcaggcacagacttcaccagtagcgaagtgaccatcacttatcaagatggcaccaca
caaaccgtggccgtcaatggcgatggttctttcgaagtggcgatcccagcgggtgacacc
acgttcagtatctcggttcaaaccaccgacgataacgtatatgaagggagcgaaagcttc
acactgagcggaaagaccgcgactcaagggacggcgattaccacgaccggaaccatcgtc
gacaacgacgaggtaccgaccatcaagtcgatcggcaccggcgatgtgaccgcgaccgaa
ggcgacgcgctgatcttcacggtgaaactgagcaatgtcagcagcaccagcacgtccttc
gacttcctgctgcaagatggcaccgccacgtccgacgactacggtgcggccagcttcagc
aacggtgtgacctacgacgccagcaccggcaagatcaccgtgccgactggcgtgaccagc
ttcaccgtcaacgtacctactaccaacgacagcatcgaggaagccgacgaaaccgtcaag
ctgaccatcggtggcaaagaggcgatcggcaccatcgtcgataacgacaacgcgccggtc
atcgacgacgcgaccgtgaataacttgtcagagagcatcgcgaacggcaccgaagtgtac
gacgtacatgaagcgcgcaccggcaacgacaccgacctcgatggtgaagcactgcaatac
accttcgtgcacagcaacaacacccgtagcactactagtgaagacggtgcgttcagcatc
gatccaggcaccggtaagatcaccgtgctggataccacgaagttggattacgagagtgcc
acgtcaatcgtcctgaaagtcgaaacgactgacggcgtgaacaaagacactgcagacatc
acactcaacctgactaacgtcaacgacagtgacacggtcttcaccaaagagagtgagacg
ttcaactatgcggaaggcacggcggcgggtgtaacgctgggcaaagtcacagcgaccgac
gccgatggcgacagcatcagttacagcatcgcgcaagagcacaacgtgtacgcggcggat
gatgtgaataaagagcgtccgttctaccaggtggatgcgaacggcaatgtgagtctgacc
gaggcgggtgagaaagcgttcaccaacgactacgagtctggccgaaacacgcacaccatc
acggtgacggcgacgggcacagacggttcgggcgcggacaccacagacaccatcgaggtg
acgctgaacgaaaccaacatcgatgacaacgcaccgaagtttgaaggcaccaccgacggt
gagtacagcttcagctacgacgaaaacagcgcggcggacaccgtactgggcacggtcaag
gccaccgatgcggataaagagacggtgacctacagcaccaagtcaggcaacgacaacggc
tggtttgcgattgatgcgaccacgggcgtgatcaccctgactgcgaaaggtgcagaggcg
gcggcgaacgactttgaggcgctggccaacgtgcacagcttggtggtgactgcgaccgaa
gacgcaggtctggggggcgtgaagaccaccgacatcacagtcaagctcaacgagcagaac
attgatgaagagcttagtatttcagggttgaatggagctaatgctgagttaactatccat
gaatctaatctttcaggtggttcgtcgccagatcactctgctcttagcaaagttgggagt
ttcagttttacttctattgacggcttagcgtctttagtaatcgcgggtcatagttttaat
gtggcagaacttcttgcgttgaattcatctgaagcaacaatttcaacgccttatggtgaa
ctcaccttgacggggttcagtggtgatctcactggtggaacagttcaatacgaatatacg
ttgaacgaaaatgtggataacgattcagccaccaatgcaaatgacacggactataccgat
catatctctgtgactgtgattgatgtggatggcagccagatcacagatagcttagacgtt
aaaattgttgatgatgcttctacggctcttgatgaccgtggtgaagtggacattgttgct
gacagtttcacggtctctggtgtggttgctaactggacatcatggagtaatggtaccaac
gtaaccacgtttgatggaactaatgcaccaaatggtggtggcttagataatgacagtggc
aaagaccaaatccgttggggtcaacccgctagctcatacagctctggctacggatttatc
gataatgatagtgcgctaaacggtgagtttgccttaaaccaagatattattttgggtact
tttactcattacaattatcccgtttattcaggtggtgcgattaccagtgccagtatggat
gttgcgttctcagtgacagatgcccacggcgtacttacacctgtaacgttgaaactgaat
tttgatcacaatgaaacgccaaataccaataatccagaagcctcaaaagacatcattaaa
gttggtaataccaatgtgacttttgagaatgcaggggctctctataccttgcaagtgatt
ggctttaggattcctggcaccaatcaaattgtgacggaaattagaacgggtgaaaacgca
actaacagctatgaattggttgtacgtgttggacctggtgaggggtatgaattgccatcc
acatcaggcaacgtattatccaatgatgtttctggggcagatgtcgatatgacggttgtc
ggagcagcctctggtaatcacgtgagttccggtgtctcaggcagcgttggatctatgatt
gcgggcctgtatggcaatttgatcctgctcgctgatggtagctacacataccaagtgaca
gcgaatgcatcttcgattcctaatgatgcaatcgagattttcacttacaccatgaaagat
ggtgatggtgatacctcaactgcgttactttctatcaatgtgaaccgagttacgatggcg
gatttcaatgctaaccaagatcacaaggttggtttggaagacaccgtggtggccggtaat
gtgttagacaatgatggaagcaaaaatacctcagtggatcatttcacggtaggtaatgat
gccacttctcacgtggtgggtagccctgttagcttagagcaaggtgagctgacgcttaat
tcggatggcagttacacatttaagccagcagataactggaatggtgaagttccggttatt
acctacacaacccacactggaaaaacgagcacactcgccatcaccatcacccctgttgat
gatgcgacggttactcaacctgatcataagtcgattgcagaagatactattgcgacgggt
aatgtgctggccaacgattgcgatatagacagcgctctctcagtcaccagcttccatgtt
gagggagtcaatggtgtttataccgctggtaatacgatgtatcagctggctgaaggtact
ttagtgcttaaggcaaatggtgattatacctttgatccaaaagataactggagtggctca
ctaccagaaattacctataccaccaataccggagcaactggaactctgaacattcatgtt
gaggcggtggctgatgtgccgaacctgactatcaatggctatacctctgttgctgcaatc
aatttcgaggatgcgagattgaatggcagttgggatggcgtggttgctaatcagattaaa
ggtctgaacacgattggaacgtggcataccagcaataatagcggtaaagttgaaatcggt
tacgaaaatatctatgtctccggtggttcttcaacaaataaagtcatggaaattgagttc
aataacggtgacaagacgctgtataccgatattcatgctcaagcgggtcgtttttatgag
ctagattttgatattgcagctcgtgctggttctgtgaacagttcaggtttaaccattaag
cttgttcctctgaatgcttacggtgttcctatccttgccgaggcgatcactctttatgat
ttcaatccaaccaatgcgaactggttgagagatcaaaaagttacgctccctattgatcaa
actggggaatatcgtctgttgtttgaaagcgatgatgctaatagctatggggcgatttta
gataatttggcgtttaaagttgttgataatatgggctaccgcggagatttcattaaactg
agtgaaatttccacttcactgaatgataccgatacctctgaaaccttgagtcttaaatta
aaaggaatgccagaagggtcgatcttgaaagacgataaaggtcatgaagttacagtgggt
tcaaacggtgaggtagatattacaggatgggattacagcagcttacaaattaaaacgccg
aaccatggtaatttcaatattactgttgaagctacggcgactgaaagcagtaaccaagat
agtgcaacgacgagtgcgacaattccggtcacggtattacatcctaatgagtatttggga
cgtggcggtgttgactctttcttgttgaccaaaagcaatggcgataatgctaacttaaat
attgctctcaatgcttattatgaaggcaccacagcggtcgcacctgtgacgcaacaagta
gcagtaacgattgatacggacttggtgattcattcaggaaatagtaacgattatatcgat
ttaggtattagtcgcgcggataatacggtttataccggtagctcaattcctaactttaat
aattccacgccgtcacaatctacactggcggatagcgcgtttatgaaaaatgacgtgatt
actgatcatgatggtgtgttattacaatcggtacaaagccaaattcagccgatcactgat
acggtgaatttaggtagtggtaacgatacagtttatggcggaggtggaaaccttgccgct
tatggcggagcgggtaatgacactctgattggcggtgatggcaacgatgcactcagaggt
ggtgcggataatgactatctttcaggaggtcgtggtaatgacgttttacgtggtgattca
ggcaatgacgttcttattggtggtcttggccatgatattttaaccggtggctcaggagaa
gatctcttcaaatgggttgatggagatctggatggaagtacagatcgaattactgatttc
catttatctgagaaggataagattgatttaagtgatttgttcgataatccatcagagcaa
gaggtgacggcactattggatagcattaaatcaacggtgcagggtgatgatcattcatcg
tcattcaaagtagagaaaaatgatggttcttcggtgacaattcaattagatggcgtgtcg
tccgttgaacttattaacaacctagcatctataattcagattaaagaagactag

DBGET integrated database retrieval system