Vibrio cholerae O1 El Tor MS6: MS6_1959
Help
Entry
MS6_1959 CDS
T03666
Name
(GenBank) ferric vibriobactin receptor ViuA
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
vcs
Vibrio cholerae O1 El Tor MS6
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vcs00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vcs02000
]
MS6_1959
Transporters [BR:
vcs02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
MS6_1959
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP03614
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2222208..2224271)
Genome browser
AA seq
687 aa
AA seq
DB search
MAVLCPARVSVAENKKFKLHTLSAMMMGLFTGSFAYAETQNTSNQEQEMPVLVVIGEKTQ
RSIYETSASVEVFDQDTIERTPGATEIDDLLQLIPNLVDSGQSNNMPTIRGIDGSGPSVG
GLASFAGTSPRLNMSIDGRSLTYSEIAFGPRSLWDMQQVEIYLGPQSYIQGRNTSAGAIV
MKSNDPTHHFESAVKAGIGESDYSQTAGMISAPIIQDELAFRLSFDQQKRDSFVDLAAFE
PAGDPKKIEMNSVRGKLLYEPSALDGFKTTLTLSHMDSRGPQTENINVAGNEAFRPVYET
ASFTTAWDIIWHLNDLFTFENNLVYADFSYDRYTNPNSRGDFNTDGKEFHIEPLLRYIAL
DGSVNTLIGARYYQSSQDDMYIDAASAYPMDGRTKAKSVFAEVTYALTPSINVNLAGRFE
REQVKRNVSHPRYKLDYDETSSVFLPKLDVAYTPVQGQTYGIKAAKGYNASGAGLAFNSM
QFTGFRPYEFEQESIWNYEFYTRHRFSHSVEVLTNLFYNDFDSMQMTQTTSSGDVFIANL
DEASTYGAEIGSRWYATSSLELFANLGLLKTEFKETTGNTKELPRAPKMSANVGLLYDFG
QGFEFSSNAAYTGSYFSESGNSEKFAIDSYWVANAQLAYVFEHGRATLYATNLLDSDKTT
LYLSTNNTLDQLKQQPRMIGASVQLNF
NT seq
2064 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagttttatgcccagcgcgagtcagtgttgcagagaacaaaaagtttaaattgcac
accttgtcggcgatgatgatggggcttttcacgggcagttttgcctatgcggaaacgcag
aatacgagtaatcaagagcaagaaatgcccgtgttggtcgtgattggcgaaaaaacacaa
cgcagcatttatgagacgagcgcgagtgtcgaagtgtttgatcaagacacgattgagaga
acacccggcgcaacagagattgatgatctcctacaactgatcccaaaccttgtcgattcg
ggtcaaagcaacaatatgcccacgattcgaggtatcgatggctcggggccttccgttggg
ggcttggccagttttgctggcacatcacctcgcttaaatatgtcgattgacggtcgttcg
ctgacttattctgaaattgcttttggccctcgttcactctgggatatgcagcaagtggag
atctatttagggccacagagctacattcaagggcgaaatacctcggcgggcgcgattgtg
atgaagtctaacgaccctactcatcattttgaaagtgcggtaaaagcaggtattggcgaa
agcgattattcgcaaacagcgggtatgatctctgcacctattattcaagatgagttggca
tttcgtttgagttttgatcagcagaagcgggatagttttgtcgatcttgctgcttttgaa
cccgcgggcgatcctaaaaaaatcgagatgaattcggtgcgcggtaagctgctgtacgaa
ccttccgcactggatggttttaaaaccacgttaacgctctctcatatggattctcgtggg
ccacaaacagaaaacattaatgtggcgggtaacgaagccttccgaccggtttatgagaca
gcctcgttcacgacggcgtgggatattatctggcatctcaacgacctcttcacttttgaa
aacaatctggtgtatgccgatttcagctatgaccgttataccaatcccaatagccgaggg
gatttcaataccgatggtaaagaattccatatcgaaccgttattacgctatatcgcactg
gatggtagcgtgaatacgctgattggggcgcgttactaccaatcttcacaggatgatatg
tacattgatgcggccagtgcatatccgatggatggtcgcactaaagccaaatccgttttt
gcggaagtcacttatgcgttaacgccttctatcaatgtgaatttggctggccgatttgaa
agagagcaggttaagcgaaacgtctcgcacccaagatacaagcttgattacgatgaaaca
tccagcgtatttttgcctaagctcgatgtggcatatacaccagtgcaagggcagacctat
gggattaaagcggctaaaggttacaatgcgagtggggcaggactagcctttaactcgatg
caatttacaggttttaggccctacgagtttgaacaggaatcgatttggaactatgagttt
tacacccgtcaccgtttcagccattctgtcgaagtgttgactaaccttttctataacgat
tttgacagtatgcagatgacgcaaaccacatccagtggtgatgtgtttatcgctaacctt
gatgaagcgagcacttacggcgctgaaatcggatcacgttggtatgcgacctcttcactc
gaactttttgccaacctagggcttttgaaaaccgagttcaaagaaaccaccggaaacacc
aaagagctgcctcgagcaccgaaaatgtcagccaatgttggtctgctttatgattttggc
caagggtttgagttcagtagtaatgcggcttataccggaagctatttctcggagagtggc
aattcagaaaaatttgcgattgactcatattgggttgccaatgctcagttagcctatgtt
tttgagcatggacgagcaaccttgtatgccactaacttattggattctgataaaacaacg
ctttatctctcaaccaataatacgcttgaccaacttaaacagcagcctcgcatgattggt
gcatcggtgcagttgaatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
