Vibrio antiquarius: VEA_001580
Help
Entry
VEA_001580 CDS
T01107
Name
(GenBank) rTX toxin putative
Organism
vex
Vibrio antiquarius
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Cadherin_4
Big_9
Cadherin
Cadherin_CELSR2_9th
HemolysinCabind
WW
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACY54261
LinkDB
All DBs
Position
2:1785452..1793683
Genome browser
AA seq
2743 aa
AA seq
DB search
MVGPSKLTAQTYVVIGLDGQIKAFASKENLLPGEVVVELVEGKIQPQHVYIADTEGEAQT
DSTDKLAKILEAIEKGQDPSELGDEYATEAGEVTGSSLTASGTVERTGAEVLASTFFETA
GVTTEQSTTLFNISRFTTSELGETEALIDGEDRGAVQEDVTLGTSGNLSVTDPNTGEALF
QSQSEVQDSYWGVFSIDAFGNWNYQLNNEHEEVQALDHDSDPIIRSITVLSVDGTEHEVV
ISITGTEDAPVVTGTFTGKVIEGNLGDFATATGTIAITDVDNGDDPIFANTTVTGTYGEL
VLVDGQWTYTLDQSQVQHLDEGDQVQDIITLTANDGTQQKIVIDITGTEDTPVVTGTFTG
SVTEGNLGDVATATGTITISDVDNGDEPVFSNTTVTGTYGELALVDGKWTYTLDQSQVQQ
LDEGDQVQDIITLTATDGTQQNIVIDITGTEDAPVVTGTFTGKVTEGNPGDVATATGSIV
ITDVDNGDDPIFANTTVTGTYGELALVDGKWTYTLDQSQVQQLDEGDQVQDTITLTATDG
TQQNIVIDITGTEDAPVVTGTFTGKVTEGNLGDVVTAAGTITISDVDNGDDPIFANTTVK
GTYGELALVDGKWTYTLDQSQVQQLDEGEQVQDTITLTATDGTQQKIVIDITGTEDTPVV
TGTFTGSVTEGNLGDVATATGTITISDVDNGDDPIFTNTTVTGTYGELVLVDGKWTYTLD
QSQVQQLDEGEQVQDTITLTATDGTQQSIVIDITGTEDTPVVTGTFTGKVTEGNLGDVAT
ATGTIAITDVDNGDEPEFSNTTVTGTYGELVLVDGKWTYTLDQSQVQQLDEGEQVQDTIT
LTATDGTQQKIVIDITGTEDMPAVTGTFTGKVTEGNLGDVATATGTITISDVDNGDDPIF
ANTTVTGTYGELALVDGKWTYTLDQSQVQQLDEGDRVQDTITLTATDGTQQNIVIDITGT
EDAPVVTGTFTGSVTEGNLGDVATATGTITISDVDNGDDPIFTNTTVTGTYGELALVDGK
WTYTLDQSQVQQLDEGEQVQDTITLTATDGTQQKIVIDITGTEDTPIVDGTFTGKVSEGN
LGDVATATGTITISDVDNGDEPVFSNTTVTGTYGELVLADGKWTYTLDQSQVQQLDEGDQ
VQDIITLTATDGTQQKIVIDITGTNDAPEFVSGSNDNFGLDAQGKTDIDSYQFSVDENSQ
SGVIGKVNAFDVDQDSQITYHLNGHSELFEINSLTGEISVKNGANLDHESIDNYQLEVEA
RDQFGGKDTAQVEVLVRDINEAPIAEDDKGIEKTTKTLDQSNWDDSTDITVDYYVIDTRS
GNKVSDASKADYVGDGDHKYGVSSALDSGSDRVQDGQIRYDDATGQSEAMRFSFANGQVA
DHAEVEVKNLWTDTSNGSWEPGIERGVWKAYYKGDLVATGVFEGTRGGNQVVNINADGRF
FDSIEMSTTSYKDGVIDPKGSEYFITQVSADLTTFDEAYQTNGSGTLELDVLANDSDPDG
DALTIIDYPSESFLNLQDGKLVFDAAKYLESLPADQQTLKTGEVKDYTFEYTIRDDDGLT
DKAKVTVSVMGEPMSLSDAHAALDESQVGTDTGVHAEGNFIANLGSATEAEYHFNAEQNL
GGFTSDGKEVVFEVSADQSTLTGYTGTGADRIKVVQANIDSKTGHFTVDQHMPLDHAEQG
ADMLDIRASVEVDAGGQSETATLHLNVTDSLPSSSSAHYEINDVDSQSNSVVIALDASES
MLDWVTDADGQYVTRWQLAQDSIKSMFEQYQDLGPVSFRIATYSGQPSGQISEWLDSAEA
IDAFISGIHPYASTPYNQAVDQINEILSDPEDDALLSNTDTQLYFISDGRPSDFTYWTNQ
TNVGEIQTRENLIKWSTSDDFESEQRYQDIVNGRVQPTSEEEGIILQNAMENSISSSGQD
VENIWSVGIGNGASLEHLESIATDKGSAIVVVDDSQIGDLLSKTVSGQLQGNLLDDNGGD
AQWVDHITIDGEIYYYNKVNGDVTNSDGTKISDHSLAQIDINHGKLTINFENGHYDYQAS
NVVGHQQEKLDVTVIDADGDTTNSEVTIDIRDRAPEFISVGDTDQTHGTDANGMPTEDTA
SFDVAEQEVGVLVGQVEAFDPDGSDTIKYELSGGDADLFRVDSNSGEIWLKDGVKLDHST
QQTYQLEVSASDGVDTDTTQVILNVTENHAPTSSPVQGFAQMEDLPINKVTVVFDHSNSM
TRTFDGENTVGRDATAPKTESRAYKAAAALHSMVENMIADGGESNTYIRLVRFDGDTSTH
SWLTLSEVELMTRPPEMNGRDPNDLSFQNEVSEYVRNWCDVEYGTNTDYDKALEAVMEPG
EASNAVYPWQDGWDYFGPEKPSESKDTIFFISDGEPNPSEGAVTSPDLDERWEDYKQTHD
AKVYGIGIALSDNVKAAEALDELSDKVVFIDSGEDLGQYLNQFSPDPIAGELLAGSQDAD
GDSMTISLAEGDFTLLGADLHGVTVNQPLVSSTSDVDGQLHIQTAFGTLEVSSNGSYSFT
QSDDLTLQGDQQADLHFLFKVSDGKGGISENVFTLTLNDSGTDIAQTERHASVGDEFANS
ITGGESIDILLGQAGEDTLSGGAGDDILVGGLGNDILTGGLGSDILTGGEGIDTFTFTQE
SLDMTSSRDVIKDFRLDEDKLDLSDILEFVGDDTTDMDNLLEHVSADYDSAQDTLNLTIT
GEGSNTMSVALENFDLSGLELGSSATSHEIVDQLFHHQVFSVD
NT seq
8232 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggttggaccatcaaaattaaccgcacaaacctatgttgtaatcggcctagatggtcaa
attaaagcttttgcgtctaaagaaaacttgttaccgggagaagtggtcgttgaattagta
gaggggaagatccaacctcagcatgtatatattgctgacacagaaggtgaagctcaaact
gattctaccgacaagcttgcgaaaatattagaggccatcgaaaaaggacaagacccgagt
gaactaggtgatgaatatgctactgaagctggtgaagttacgggttcaagtttgacggcc
tctggtactgttgaacgaacgggggcagaagtactagcaagtactttttttgaaaccgcc
ggcgtgacgacagagcaaagtacaacgctatttaatatttctcgattcacaacctcagag
cttggtgaaactgaagcgttgattgatggtgaagatagaggtgccgttcaagaagacgtg
acgcttggaacttctggcaacctcagtgttactgatccaaatacaggtgaagcattattc
caatcacagagtgaggttcaagatagttattggggcgtcttctcaattgatgctttcggt
aactggaattatcagctgaataatgagcacgaagaagtgcaggctttggatcatgacagt
gacccaatcatcagaagtattaccgttttatctgtagatggcactgagcatgaagttgtg
atctctattacgggcactgaagatgcgccagtcgtgacgggcacgttcacgggcaaggtg
atcgaaggcaatctcggtgattttgcgaccgcaacaggcaccattgctattactgatgtc
gataatggtgacgatccgatttttgcaaacaccaccgttacgggcacctacggtgagttg
gtattggtggatggtcagtggacgtatacgctggaccaaagccaggttcaacatctggac
gagggtgatcaggtgcaagatatcatcactctcacggcgaacgatggcacccaacaaaag
atcgtgattgatattacgggcaccgaagacacgcccgttgtgacgggcacgtttacgggg
tcggtgaccgaaggcaatctcggtgatgtcgcgaccgcaacaggtaccattactatctct
gatgttgataatggcgatgagccagtgttcagcaacactaccgttacgggcacctatggt
gagctagcattggtggacgggaagtggacgtatacgctggaccaaagccaggttcaacag
ctggacgagggtgaccaggtgcaagatatcatcactctcacggcgaccgatggcacccaa
caaaacatcgtgattgatattacgggcaccgaagacgcgccagtcgtgacgggcacgttc
acgggcaaggtgaccgaaggcaatcccggtgatgtcgcgaccgcaacaggctccattgtt
attactgatgttgataatggcgacgatccgattttcgcaaacactaccgttacgggcacc
tatggtgagctagcattggtggatgggaagtggacgtatacgctggaccaaagccaggtt
caacagctggacgaaggtgatcaggtgcaagacaccatcaccctgacggcgaccgatggc
acccaacaaaacatcgtgattgatattacgggcaccgaagacgcgccagtcgtgacgggc
acattcacgggcaaggtgaccgaaggcaatctcggtgatgttgtgaccgcagcaggtacc
attactatctctgatgttgataacggcgacgatccgatttttgcaaacaccaccgttaag
ggcacctatggtgagctagcattggtggacgggaagtggacgtatacgctggaccaaagc
caggttcaacagctggacgagggtgagcaggtgcaagacaccatcaccctgacggcaacc
gatgggacccaacaaaagatcgtgattgatattacgggcaccgaagacacgcccgttgtg
acgggcacgtttacggggtcggtgaccgaaggcaatctcggtgatgtcgcgaccgcaaca
ggcaccatcaccatctctgatgttgataacggcgacgatccgatttttacaaacaccacc
gttacgggcacctatggtgagttggtattggtggatggaaagtggacgtatacgctagac
caaagccaggttcagcagttggacgagggtgagcaggtgcaagataccatcaccctgacg
gcgaccgatggcacccaacaaagcatcgtgattgatattacgggcaccgaagacacgccc
gtcgtgacgggcacattcacgggtaaggtgaccgaaggcaacctcggtgatgtcgcgacc
gcaacaggcaccattgctattactgatgttgataatggcgatgagccagagttcagcaac
actaccgttacaggcacctacggtgagttggtattggtggatggaaagtggacgtatacg
ctggaccaaagccaggttcagcagttggacgagggtgagcaggtgcaagataccatcact
ctcacggcgaccgatggcacccaacaaaagatcgtgattgatattacgggcaccgaagac
atgccagccgtgacgggcacgttcaccggcaaggtgaccgaaggcaatctcggtgatgtc
gcgaccgcaacaggcaccatcaccatctctgatgttgataatggtgacgatccgattttt
gcaaacaccaccgttacgggcacctatggtgagctagcattggtggacgggaagtggacg
tatacgctggaccaaagccaggtccaacagttggacgagggtgaccgggtgcaagacacc
atcactctcacggcgaccgatgggacccaacaaaacatcgtgattgatattacgggcacc
gaagacgcgccagtcgtgacgggcacgttcacggggtcggtgaccgaaggtaatctcggt
gatgtcgcgaccgcaacaggcaccatcaccatctctgatgttgataacggcgacgatccg
atttttacaaacaccaccgttacgggcacctatggtgagctagcattggtggatgggaag
tggacgtatacgctggaccaaagccaggttcaacagctggacgagggtgagcaggtgcaa
gacaccatcaccctgacggcaaccgatggcacccaacaaaagatcgtgattgatattacg
ggcaccgaagacacgcctattgttgacggtacgtttactggcaaggtgagcgaaggcaac
ctcggtgatgtcgcgaccgcaacaggcaccatcactatctctgatgttgataatggcgat
gagccagtgttcagcaacactaccgttacgggcacctacggtgagctagtattggcggat
ggaaagtggacgtatacgctggatcaaagccaggttcaacagttggacgagggtgaccag
gtgcaagacatcatcactctcacggcgaccgatggcacccaacaaaagatcgtgattgat
attacgggcactaatgatgctcctgaatttgttagtgggagtaatgacaactttggtctg
gatgctcaaggtaaaaccgacatcgatagttaccagtttagcgttgatgaaaacagtcaa
tcgggtgtaattggaaaagtaaatgcattcgatgtcgatcaggacagtcagataacgtat
cacttaaacggtcatagcgaactgtttgaaatcaacagtcttactggtgagatcagtgtc
aaaaatggtgcaaatctggaccatgaatctatcgataactaccagctagaagtggaagct
cgtgaccagtttggcggtaaagacaccgctcaggtcgaagtgttggttcgcgatattaat
gaagcccctattgctgaagatgataagggcattgaaaaaacaaccaagacacttgaccag
agcaactgggatgatagcactgatatcacagttgattattatgtgattgatactcgatct
ggaaacaaggtttctgatgcatcgaaagctgattatgttggtgacggcgaccacaaatat
ggcgttagttctgcgctagacagcggctcagaccgggttcaagatggtcagattcgatat
gatgatgcaactggacaaagtgaagcaatgcgcttctccttcgctaatggtcaggttgcc
gatcatgctgaagttgaagtgaaaaacctatggacagacacttcgaacggtagctgggag
cctggtattgagcgcggtgtttggaaggcttactacaaaggtgacttggttgcgacaggt
gtgtttgaaggtacccgtggtggtaatcaagtagtcaacatcaatgcagatgggcgtttc
ttcgatagtattgaaatgtctactaccagctataaagacggtgtcattgatcctaaaggc
tcagagtactttattactcaggtatcagcggacctgacgacctttgatgaagcttaccag
accaacggctcaggcacgttagagctggatgttctggcgaatgacagcgacccggatggt
gacgctctgactattatcgactatccatcagaaagtttccttaatctgcaagatggtaaa
ttggtctttgatgcggccaagtacctagagtcactgccagctgatcaacaaaccctgaaa
acgggtgaagtgaaagattataccttcgaatacaccatccgtgatgacgatggtctgact
gataaagcaaaagttaccgttagtgtgatgggtgagcctatgtcgctcagcgatgcacac
gcagcattggatgaatctcaagttggcacggatactggcgtacatgctgaaggcaacttt
atcgcaaacctcgggtctgcaacggaggctgaatatcacttcaacgccgagcaaaaccta
ggtggtttcaccagcgatggtaaagaggtcgtgtttgaagtgagtgcagatcagagcact
ctaactggttatactggaacaggtgccgaccgcatcaaagtggttcaagccaacatagat
agcaaaacgggtcatttcacagttgatcaacatatgcctcttgatcatgcggagcagggg
gcggacatgctggatatccgcgctagcgtcgaggtggatgccggaggtcagtctgagact
gccaccttgcatctgaatgtaacggattcactaccgtcatcgtcttcagctcactacgaa
ataaatgatgttgattcacaaagtaatagtgttgtgattgcacttgatgcgtcagaatca
atgctcgactgggtaacagatgcagacggacaatatgttactcgctggcaacttgctcaa
gactccattaagtcaatgtttgagcaataccaagatttgggtccagtaagttttagaatt
gcaacttacagcggacaaccatctggccagatttctgagtggctagattctgccgaggcc
attgatgcctttatctctggtatacatccctatgcatcgacgccatataaccaggccgtt
gaccaaataaatgaaatacttagtgacccagaagatgacgcattgcttagtaataccgat
acccagctttactttatctcagatggtcgaccttccgattttacctattggacaaatcaa
acaaacgtgggagaaattcaaacccgtgaaaacttgattaagtggtcaacatcagatgat
tttgaaagtgaacagcgttatcaggacatagtgaatggtcgggttcagcctacttctgaa
gaagagggcatcattctgcaaaatgcgatggaaaatagcatcagcagtagcggtcaggat
gttgaaaatatctggtctgttggtattggtaatggagcgtctctggaacatctggagtcg
atcgcgacagataaaggcagtgctattgtcgttgtagatgattctcagattggggatttg
cttagtaaaacggtctcaggccagttgcaaggcaaccttctggatgacaatggcggtgat
gctcagtgggtagatcacatcactatcgatggcgagatatattactacaacaaagtaaac
ggtgatgtcactaacagcgatggcacgaaaatatcggaccattctctggcgcaaattgat
atcaaccacggcaagctgaccattaactttgaaaatggtcactacgactatcaagcgagc
aatgttgtaggtcatcaacaagagaagcttgacgttacggttatcgatgctgacggtgat
actacaaatagcgaagttaccattgatatccgagatcgcgcaccagaattcatcagtgtc
ggtgatacagaccaaacccatggcaccgatgccaacggtatgccaacagaagatacagca
agctttgacgtcgctgagcaagaagttggggtattagtcggccaggtggaagcgtttgat
ccggatggcagtgacaccataaagtatgaattgagtggtggtgatgctgatctattccgt
gttgactctaatagtggtgagatttggctgaaagatggtgtaaaactggatcactcgact
cagcaaacgtatcagttggaagtgtctgcaagcgatggtgtggataccgatacaactcag
gttatcctgaatgtcactgagaaccatgccccaacctcatctccagttcagggctttgct
cagatggaagacttaccgatcaataaagtgacggtagtgttcgaccactcgaacagcatg
acccgcacctttgacggtgaaaataccgtgggtcgtgatgcaacagcaccgaaaactgaa
tcgagagcttacaaagcagctgctgcgttacattccatggttgaaaacatgattgccgat
ggaggagaatcaaacacctatatccgcctggtacgtttcgacggtgatacatccacacat
agctggctgactttgagtgaagttgagttgatgacacgcccaccagagatgaatggccgt
gatccaaacgatttaagtttccaaaatgaagtttcagaatatgtgcgcaactggtgtgac
gtagaatacggtaccaatacggattacgataaagctttagaggctgtaatggagcctggt
gaggcaagtaatgccgtttacccttggcaggatggttgggactatttcggtccagaaaaa
ccgtctgagagtaaggacaccatattctttatctcagatggcgaacccaaccctagcgag
ggcgctgttacttctcctgatctagacgagcgctgggaggattacaaacagactcatgac
gccaaggtatatgggattggtattgctctctctgataatgtcaaagcagcagaggctcta
gatgagcttagcgacaaagtggtgtttatcgactcaggtgaagacttggggcagtaccta
aaccagttctctcccgatccaattgccggcgagttactggcgggaagccaggacgctgat
ggtgatagcatgaccatttctttggcagaaggcgatttcactctgttgggcgcagatctg
cacggtgtaaccgtaaatcagccgttagtttcttcaaccagtgacgtagatggtcaactt
catatccagacagcgttcggcactttggaagtgtcatccaatggcagttatagttttact
caaagcgatgatcttactctacagggtgaccagcaggcggatttgcatttcttgtttaaa
gtgtctgatggtaaaggtggcataagtgaaaacgtctttacacttacattgaacgattct
ggcaccgatattgctcaaactgagcgccatgcgtcagtgggagatgagtttgcgaatagc
atcactggtggcgaaagcattgatattttgctaggacaagcaggtgaagatacgttgagt
ggtggcgcaggcgatgacattctggttggtgggcttggaaacgatatcctgacgggaggt
ctaggcagtgacatcttgacaggtggagagggtattgacaccttcacctttactcaagaa
tcactggacatgacgtcatcaagagatgtgattaaagactttaggctggatgaagacaag
ctggatttgagtgacattcttgagtttgtcggtgacgacacaacggatatggataacttg
ttggaacacgtaagcgcagactacgatagtgcccaagatactctgaacttgacgattact
ggagaaggcagcaacacaatgtcagtggcattagagaactttgatttatcagggttggag
ctagggtcgtcagcgacatctcatgaaatcgttgatcagctgttccatcaccaagttttt
agcgtggattaa
DBGET
integrated database retrieval system