Aliivibrio fischeri ES114: VF_0655
Help
Entry
VF_0655 CDS
T00236
Symbol
chiA
Name
(GenBank) endochitinase
KO
K01183
chitinase [EC:
3.2.1.14
]
Organism
vfi
Aliivibrio fischeri ES114
Pathway
vfi00520
Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
vfi01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vfi00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00520 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism
VF_0655 (chiA)
Enzymes [BR:
vfi01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.14 chitinase
VF_0655 (chiA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_7
Glyco_hydro_18
BiPBP_C
CBM_5_12
Y_Y_Y
TIM-barrel_EndoS
Big_6
Big_13
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAW85150
UniProt:
Q5E746
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(718381..720921)
Genome browser
AA seq
846 aa
AA seq
DB search
MKGIFIKSAIASALFISYGANAFDCSSTPIWQSTQAYSGGDTVQQNNIAYQAQWWSQGND
PETHSGEWQEWKNLGKCSTGGENIAPTVTIISPINNAIIPEASLITLQASADDKDGSITQ
VEFLSNNQSIAIVTSPPYNTPWIAIKNTTSIIVIATDDEGATTTESVSIKVQSAGELVPP
TIELTSPIGNEKLTTGDTLVVSANANDSDGVINNVEFYIDNQLAFTDTEAPFEYSWLATS
GPHQFKAKATDNDNQTTISKGVTLEVSEPSSGGCAGLPQYKSGTNYAAGDEVQNLNQKYR
CDIGGWCSSSSDWAYAPGTGSNWQDAWTGLGVCSTPPQVTITSPNDNSVILAGSIVEVNA
SASDSDGSVIGVEFFANNVTLGSDTQAPYTVNWDATVIGSNTLKAVATDNEGNNSENSIL
VTVSDQNVVTALTSPITGSSLVLGKITQLKATATSLSSSITKVDFLVNGVIIASDTTSPY
SVNWTPAAIGAYTLSVEATDAQGNTALSTASSVSVVEQTLAKHKLIGYWHNFVNGSGCPI
RLADMSDEWDIIDIAFADNDRNSNGTVHFNLYSGDIHSSCPALDPTQFKQDMAALQAKGK
VFVLSLGGAEGTITLNTDNDEVNFVNSLTAIIDEWGFDGLDIDLESGSNLLHGTQIQARL
PTALKQIEANMGGDMYLTMAPEHPYVQGGMIAYSGIWGAYIPVINQVRDTLDLLHVQLYN
NGGLPNPYMPGSAPEGSVDMMVASVKMLVEGFELADGTFFAPLRDDQVAIGLPSGPSSAN
SGQAPIQNIVDALDCVTYGTACSSVVPSKLYSNFGGVMTWSINWDLHDGFNFSKPVGDKL
NQMNNQ
NT seq
2541 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagggatattcattaagagtgctattgcttctgctctctttatctcatatggagca
aatgcatttgattgtagctcgacgccaatttggcaaagtactcaagcttatagtgggggg
gatactgttcaacaaaacaatattgcttaccaagcccaatggtggtcacaaggaaacgat
ccagaaacacattccggtgaatggcaagaatggaagaatcttggtaaatgtagtacagga
ggtgagaatatcgcaccaacagtgacaatcatatccccaataaataatgccataatccct
gaagctagcctgataacacttcaagcgagtgctgatgataaagacggttccattactcaa
gtagaattcttatcaaacaatcaatctattgccattgttaccagccctccttataacaca
ccttggattgctattaaaaacaccacatcaattattgttattgccacagacgatgaaggt
gccaccaccacagaatctgtttctataaaggttcaatcagcaggtgaacttgtccctcca
acaattgaacttacctctccaataggaaatgaaaaactaacaacaggcgacacattagtc
gtttcagccaatgcaaatgacagtgatggcgtaattaataatgtcgagttctacattgat
aatcaacttgcttttactgataccgaagcaccttttgagtattcatggttagcgacaagc
ggtcctcaccaatttaaagcaaaggcgacagataatgataatcagacaaccataagtaaa
ggcgttacacttgaggtatctgaaccatccagtggtgggtgtgcaggcctccctcaatac
aagtctggaacaaactatgcggctggtgatgaagttcaaaacttaaatcaaaaatatcgt
tgtgatattggtggttggtgctcatcatcatcagactgggcttacgctcctggaacggga
tctaattggcaagatgcatggacaggattaggcgtttgcagtacaccgccacaagtaacg
attacctcaccaaatgataatagtgtaattcttgctggttctatcgtcgaagtgaatgcg
agtgcaagtgatagtgatggaagtgttattggtgttgagttctttgcaaacaatgtcact
cttggatctgatacacaagcaccatataccgttaattgggatgctacagtaattggaagt
aatacattaaaagcagtagcaacagataatgaaggtaataacagtgaaaatagtattttg
gttacggttagtgatcaaaatgtggttacagcactcacctccccaataacaggttcgagt
ttagttctgggtaaaataactcaactcaaagcgacagcaacatctctaagcagttctatc
accaaagtagacttcttagttaatggcgttattatcgcctcagatacaacatcaccgtat
agtgtcaattggacaccagcagcaattggagcttacaccttatcggtcgaagctacagat
gcgcaaggtaatacagcattatctactgcttcaagtgtctctgttgtagaacaaacacta
gcgaaacataaacttatcggttattggcacaattttgtaaatggttcaggatgtccaatt
cgcttagctgatatgtcagatgaatgggatattattgatatcgcttttgctgacaatgac
agaaacagtaatggtaccgtgcattttaatctgtactcaggagatattcatagcagttgt
ccagcattagatccaactcaatttaaacaggatatggcagcactacaagcaaaaggcaaa
gtatttgttctttcacttggcggtgcagaaggaaccattacattaaatactgataatgat
gaggttaactttgtaaatagtctaacggctatcattgatgaatggggatttgatggactc
gatattgatttagaaagtgggtcaaatctacttcatggtactcaaatacaagctcgatta
cctacagcacttaaacaaatagaggctaatatgggtggcgatatgtatttaaccatggcg
ccagaacatccttatgtgcaaggtggaatgatcgcttacagtggtatttggggtgcctat
ataccggtgattaatcaagttcgagatacattagatttattacacgttcaactttataac
aatggcgggctaccaaatccatacatgcctggttcagcacctgaaggttctgtcgacatg
atggtagcgtcagtaaaaatgctagttgagggttttgaattagcagatggtaccttcttc
gctccattaagggatgatcaagttgcgattggattaccatcaggcccaagctctgcaaac
tcaggtcaagctccaattcaaaacattgtcgatgcactagactgtgttacttatggcacc
gcatgcagttcagtggttccaagtaaactctactcaaactttggtggagtaatgacatgg
tcaatcaattgggatttacatgatggatttaatttttccaaacccgttggtgataaatta
aatcaaatgaataatcaataa
DBGET
integrated database retrieval system
