Aliivibrio fischeri ES114: VF_2440
Help
Entry
VF_2440 CDS
T00236
Symbol
dinF
Name
(GenBank) DNA-damage-inducible SOS response protein
KO
K26937
MATE family, multidrug efflux pump
Organism
vfi
Aliivibrio fischeri ES114
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vfi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vfi02000
]
VF_2440 (dinF)
Transporters [BR:
vfi02000
]
Solute carrier family (SLC)
SLC47: Multidrug and Toxin Extrusion (MATE) family
VF_2440 (dinF)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MatE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAW86935
UniProt:
Q5E211
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2740425..2741756)
Genome browser
AA seq
443 aa
AA seq
DB search
MWNSLRNLSLHRQVLALAIPMVLSNITIPLLGLIDVAVIGHLEHAWYLGGVAVGGTMISV
TFWLLGFLRMATTGLTAQAYGAENKNALSQTFSQGIFLALCFSFILLLFHQPLSQIIFSF
SDASVEVKHYAEQYFSIRIWSAPAALSNLVIMGWLLGTQNARYPMWLVIITNSINIILDL
LFVVGFHWKVEGAALASVIADYSSLVIGLWFVLKQSNKLVLPSFIMSLSDLLSGFKRLLN
LNRDIFLRSLCLQACFTFMTFQGASLGVDIVAANAVLMSFLMMISYGMDGFAYAMEAMVG
KAIGAKSRTQLTDSLIGTTFWSLVISSLLSLVFGVFGYQLIAMISSIEDVQKTALIYLPW
LIAMPLVSMWCFLLDGIFVGATKGSEMRNSMFIAMITFFSVWWLMQDNGNHALWAAMISF
MAMRGVSLAVTFYYQWKKAIFLS
NT seq
1332 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtggaattcattaagaaacctttcattacatcggcaagtgctagcattagctattccg
atggtgctatcaaatatcactattcctttattaggattaattgatgttgctgttattggg
catttagagcatgcttggtatttaggtggtgtagcggtgggcggcacaatgatcagtgtg
acgttttggttattgggttttcttcgcatggcaacaacaggattaaccgctcaagcttat
ggtgcagaaaataaaaatgcgttgagtcagacgttttctcaaggtatttttcttgctttg
tgcttctcttttattttactgctttttcatcagccactttctcagatcattttttcattc
agtgacgcttctgttgaagtgaagcactatgccgagcaatatttttctattcgtatatgg
agtgcgccagcagcattaagtaatttggttatcatgggctggttactgggtacgcaaaat
gctcgttatcctatgtggctagttatcataaccaatagcattaatattattctcgatctt
ttgtttgtggttggttttcattggaaagttgaaggtgcggcacttgcttccgtcattgcc
gattattcttcattagtaatcggtttgtggtttgtcttaaaacagagtaataagctcgtg
ttacctagctttattatgtcgctatctgatttattatcgggttttaagcgtctcttgaat
ttaaatcgagatatattcttacgttctctgtgcttacaagcttgctttacttttatgacg
tttcaaggagcatcattaggtgtagatattgttgctgcaaatgcagtattaatgagcttc
ttaatgatgatttcttatggtatggatgggtttgcttatgcaatggaggcaatggtagga
aaggcgattggagcaaaaagtagaactcagctaacggattctcttattggtacgactttt
tggagtttagtgataagtagcttactcagtttggtatttggtgtatttggttatcagtta
atcgcaatgatatcttcaattgaagatgtgcaaaaaacagcgttgatttatttgccttgg
ttaattgccatgccattggtatcaatgtggtgtttcttgttggatggtatttttgttgga
gcaaccaaaggctctgagatgagaaattccatgtttatcgccatgataaccttcttctct
gtttggtggttaatgcaagataacggaaatcatgcgctttgggcggctatgatttcattt
atggcaatgcggggggtgagtttggctgtgacattctattatcaatggaaaaaagcaatt
ttcctatcatag
DBGET
integrated database retrieval system