Aliivibrio fischeri ES114: VF_2542
Help
Entry
VF_2542 CDS
T00236
Name
(GenBank) putative peptidoglycan binding domain
Organism
vfi
Aliivibrio fischeri ES114
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LysM
LysM2_NFP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAW87037
UniProt:
Q5E1Q9
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(2862052..2863122)
Genome browser
AA seq
356 aa
AA seq
DB search
MLKKTLIFSSLISAILFSSPSISSDDKLVLKQDYPEQYTVKKGDTLWDISALFLDSPWFW
PKLWKINPDINNPHLIYPGDELTLSWHNGNPVLSVKPLKKLSPKMRKVVKEPVPTLPTSL
VVPYLQSDRLIDDVNYQTSYRVLGTSDGRKFLSSSERVYVDAELSHKEWGIYRVVNEFSR
QDDKASSYALRLVGVAELAESNEDMSGLKIIKQQQEIAINDVVLPISSDEIKTELTTTFY
PQPAPKDIDVSILGSIDGGEYLAVNQVAVIDKGSNDGLLQGSMFSLKEEGNIVNGNKGEY
YYEVDKDTKKEGIQLPQTEIGELIVIRPYEKFSLALITKSEMPIHKGVIAVSPDEE
NT seq
1071 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttaaaaaaaacactcattttttcatcattaattagcgcaattttattctcatcacca
tcgatatcaagtgatgataaattggttttaaaacaagattatccggaacaatacaccgtt
aaaaaaggggatactctctgggatatttcggcgttatttttagatagcccttggttttgg
ccaaaattatggaaaattaacccagatataaataatcctcacttaatttatcctggagat
gaattaacgttaagttggcacaatggcaatcctgtattaagtgttaaaccacttaaaaaa
ttgtcgcctaaaatgcgtaaggtggtaaaagagccagttcctaccttacccactagctta
gtagtaccttatttacagtctgatcgtttaattgatgatgtgaattaccaaacgtcttac
cgagtacttggaaccagtgatggtcgtaaatttttaagttcgagtgaaagagtgtacgtt
gatgctgagctatcgcataaagaatggggtatataccgagtcgttaatgaattttctcgt
caggatgacaaagcctcatcttatgcccttcgtcttgttggtgtcgctgagttagccgaa
agtaatgaagatatgagtggattaaaaatcattaaacagcaacaagaaattgcgattaat
gatgtggttttacctatttcttcagatgaaataaaaacagaattaaccacaacgttttac
cctcaacctgcaccaaaagatattgatgtatccatacttggttctattgatggtggtgaa
tacttagcggttaatcaagttgcagtgatagataaaggcagtaatgacggcttattgcaa
ggaagtatgttttctttgaaagaagaaggaaacattgttaatggcaataaaggcgagtac
tactatgaagtcgataaagacaccaagaaagaaggcattcaattacctcaaacggaaatt
ggtgaattaattgttattaggccttatgaaaaatttagcttagcactcattacaaaaagt
gaaatgccaatacacaaaggtgttatagcggtttctcctgatgaggaataa
DBGET
integrated database retrieval system
