Aliivibrio fischeri ES114: VF_A0160
Help
Entry
VF_A0160 CDS
T00236
Symbol
fhuB
Name
(GenBank) fused iron-hydroxamate transporter subunits of ABC superfamily: membrane components
KO
K23228
ferric hydroxamate transport system permease protein
Organism
vfi
Aliivibrio fischeri ES114
Pathway
vfi02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vfi00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
VF_A0160 (fhuB)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vfi02000
]
VF_A0160 (fhuB)
Transporters [BR:
vfi02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Metallic cation, iron-siderophore and vitamin B12 transporters
Ferric hydroxamate transporter
VF_A0160 (fhuB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FecCD
ABC-3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAW87230
UniProt:
Q5E166
LinkDB
All DBs
Position
II:178557..180560
Genome browser
AA seq
667 aa
AA seq
DB search
MRVSSVLGKPKIGSSRTGLNIGIIVLMCIVLLSLLQWTAPYSQGIDLLWKTVFHYDSSDY
QQLITYLTYLPRLSIAVLSGFGLAIAGCVMQFVLRNPIASPTTLGVAAGAELGMVLGILF
LPVSSSISGFIPAFLGGAFATGLVFLLSVKRGFSPVHMVLAGMVVSLFFGSLNTMLLLLN
EQQLTSVFVWGAGTLNQNDWSSVSRLIPLITFPVITILLLARPLSALQLGDHVASSIGIN
IKQIKVISLTLAIFITAAVVSEVGLIGFVGIVAPAIARMCGARGLPTQILMSGSIGSVML
LFADLIIQPFSGVGGELLPTGAMTALLGAPFLLWLLNRQQLQSEMKVRETSQIVYRVRSL
RFVIVPLSLLIVVLFIGAALLGKGQLGWAVTFDISIIELRIPRVFVAFLAGVGLAIAGTV
IQRVSMNPMASPEILGISSGAALALVLGAVSGVAINRHEQMLLGTLGALIVTFVIWIMGR
KHHFAPTQMLLTGIALSAGLDAFLRIALSSGQDNVKALLTWLSGSTYLVSMNDVYLLAVG
VSLFFIFAMKSHRWLDLMGLGDTVASSVGLCCRRVRLFLLLFVAALTTLCTIIIGPLSFI
GLLAPHMARSLHQYQASHQLIAASLLGGCLMILADWIGRVMWFPWQFPAGLLASLIGGIY
FLYLMRK
NT seq
2004 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcgcgtatcaagtgtactaggtaagcctaaaataggtagcagtagaacaggactaaat
attggcattattgtcttgatgtgtattgttttattgagtttattgcaatggacggctcct
tattctcaaggcatcgatttattatggaaaaccgtatttcattatgattcatctgattat
caacaattaattacgtatttaacttatcttcctcgtttatccattgctgtgttatcaggt
tttggtttggcaattgctggttgtgttatgcagtttgtattacgtaaccctattgcttca
ccaacgacgttaggggttgctgctggagctgaattggggatggttcttggtattttgttt
ttacctgttagtagttctattagtggttttattcccgcatttttaggcggagcatttgcc
accgggctagtgtttttattgtcggtaaaacgtggtttttcgcctgttcatatggtgcta
gctggaatggttgttagccttttttttgggtctttaaataccatgctgttgttacttaat
gagcaacaattaactagtgtatttgtatggggggcgggtacattaaatcaaaatgattgg
agtagtgtatcaaggcttattccattgattacctttcctgttatcacgatcttgttactt
gctcgtcccttgtccgcacttcaattaggtgatcatgtagcttcctctatcggcattaat
ataaagcagattaaagttatatcgttgaccttagctatatttattaccgcagcagtggta
agtgaagttggtttgattggctttgttggcatagttgctccagccatagctcgaatgtgt
ggtgcaagaggattacctactcaaattttaatgagcggtagtattggcagtgtaatgctt
ttgtttgccgatttaattatacagccattttcaggtgtgggtggtgagttattaccaacg
ggagccatgactgcattacttggtgccccttttttgttgtggttattaaatcgacaacaa
ttacagtcagagatgaaggtgagagaaacctcgcaaattgtttatcgggtaagaagcctt
agatttgttattgttccattgtctttattgattgttgttttgtttattggtgcagcatta
cttggtaaaggccaacttggctgggcggtaacttttgacatatccattatcgagttaaga
ataccacgagtatttgttgcgttcttagccggggttgggctagccattgctggcactgtg
attcaaagggtgtcaatgaacccaatggcaagccctgagattttaggaattagctctggt
gcggcactggcgttagttttaggtgccgtttctggtgttgcaatcaacaggcatgaacag
atgttactgggtactttaggggcattaatcgtcacgtttgttatttggattatgggaaga
aaacatcattttgctccaactcaaatgcttctaacggggatagctttaagtgcagggtta
gatgcgtttttacgaattgctttatcatcaggacaagataacgttaaagcgctattaacc
tggttgtctggttcaacttacttagtttcgatgaatgatgtgtatttgcttgccgtaggg
gtatcgttgttttttattttcgcgatgaaatcacatcgatggctagatttaatgggatta
ggagacacggtagcgagcagtgttggtctatgttgtcgtcgagttcgattgtttttatta
ttgtttgttgccgcactaaccaccttatgtacgattattatcggacctcttagttttatt
ggtttattagctcctcatatggctcgctcactccatcaatatcaagcttcacatcaactc
attgcagcgagtttgttaggcggttgtttaatgattttagcggattggatagggcgagtg
atgtggtttccatggcaattcccggctggattattggcatcattaattggcggtatctac
ttcttatatttaatgcgaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system