Aliivibrio fischeri ES114: VF_A0801
Help
Entry
VF_A0801 CDS
T00236
Symbol
glgX
Name
(GenBank) glycogen debranching enzyme
KO
K01214
isoamylase [EC:
3.2.1.68
]
Organism
vfi
Aliivibrio fischeri ES114
Pathway
vfi00500
Starch and sucrose metabolism
vfi01100
Metabolic pathways
vfi01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vfi00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
VF_A0801 (glgX)
Enzymes [BR:
vfi01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.68 isoamylase
VF_A0801 (glgX)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
CBM_48
ISOA1-3_C
GlgX_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAW87871
UniProt:
Q5DZC5
LinkDB
All DBs
Position
II:899076..901031
Genome browser
AA seq
651 aa
AA seq
DB search
MNTHQAFPFPLGATLTNTGCNFAVHHDSAFPLSLIIFKEDGSYTEHSFTEEYGTIKYTHL
TGIKEGAVYGFKIIKNEEDLLLLDPYAKALKNIPNYQVPYTAKQSWSLAQAIVVNDNFDW
QSTTMPIIPRSETILLETHVKGFTLLNPNIDENVRGTYLGLVDPATIAHIKEQGITSIQL
LPIAACMHEPHLLEMGMVNYWGYNSLSFMAPDPRYAISDAVTELKTAIRELHKNNIEVIL
DVVYNHTAEGGNGGCTFNLKGLDQDYYLHHNGNYTNYTGCGNTLDITHQPSLNLVMDTLR
YWVEHYHIDGFRFDLAATLGREYDQFNPNNAFFKAIAQDPILKNTKLIAEPWDIGPNGYQ
VGEFPDGWNECSDKYRDTTKSFWRGEQNYLKSIATRLMGSRDLVSASRWPHKLPVNYVSY
HDGFTLQDLVSYKNRHNHANGENNRDGHGDNRSDNYGVEGPTDNPRIIALREKQKRNMMT
TLLFSFGIPHLLAADACSHTQQGNNNAYCQDSEISWVNWNLDPTAQEFKIWLSDMIHARQ
KHIVPIINAFSGSKRSHQKVEWYTPDGRTMTHNDWHGAKSLCLHLNIYDGEKELLIMINQ
SNIPTRFVLPKLTKQANWSLVCDTQYSKVKPKPIVFDYSLSPLSIAVFCNK
NT seq
1956 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaacacacatcaagcttttcccttccctttaggggcgacattaactaatactggatgc
aattttgctgttcatcatgattcagcattccctttatctcttattatcttcaaagaagat
ggtagctataccgaacactcctttactgaagagtacggcacaataaaatacacacacctt
acagggataaaagaaggtgccgtgtatggtttcaaaatcattaagaatgaagaagatctt
ttattgcttgatccttacgctaaagctttaaaaaacattcccaattaccaagttccatat
acagcaaagcaaagttggtccctagcacaagccatcgttgttaacgacaattttgattgg
caaagtaccactatgccaataattcctcgctctgaaaccattttactggaaacccatgtg
aagggatttacgcttttaaaccctaatatcgacgaaaatgttcgtggtacatacctaggt
ttggtagatccagcaacgattgcccatataaaagagcaagggattacgagtattcaactt
ctccctattgctgcttgtatgcatgaaccacacctacttgaaatgggtatggtgaattat
tggggttataactccctttcttttatggctccagaccctcgatatgcgattagtgatgcg
gttactgaattaaaaacagccattagagagctgcataaaaacaacatcgaagtcatttta
gatgtggtatataaccatacggctgaaggtggaaatggaggctgtacttttaatttaaaa
ggcctagatcaagattattatttacatcacaatggtaattacaccaactatacaggctgc
gggaataccttagatatcacgcaccagcctagccttaatttagtgatggacacattaaga
tattgggttgagcattatcatatagatgggtttagatttgatttggctgcaacgctaggt
cgtgaatatgaccaatttaaccctaacaatgctttttttaaagccatcgctcaagatcct
atcctaaagaatacaaaattgattgctgagccttgggatattggccctaatggttatcaa
gtgggtgaatttccagatggttggaatgagtgtagtgataaatacagagacacaacaaaa
agcttttggcgtggtgaacaaaactacttaaaatccattgctacacgtttgatgggctct
cgtgatcttgttagtgcttctcgttggcctcacaaattacccgttaactacgtgagttat
catgatggatttaccctccaagatttagttagctacaaaaatcgtcataatcatgctaat
ggtgaaaataatcgtgatggtcatggcgataaccgctccgataactacggtgtagaaggg
ccaacagacaaccctagaatcattgcgttacgtgaaaaacagaagcgtaatatgatgact
actctattatttagttttggaataccacatcttctagctgcagatgcatgctcgcatacg
caacagggtaataataatgcttattgccaagacagtgaaattagctgggttaattggaat
ttagatccaactgcgcaagaatttaagatctggctttcagatatgattcatgcaagacag
aaacatattgtcccaatcattaatgcttttagtggttcaaaaagaagccatcaaaaagtc
gagtggtatacacctgatggacgaaccatgacacataacgattggcatggagcaaaatca
ctgtgcttacatttgaatatttacgatggtgaaaaagagttgttaattatgattaatcaa
tcaaacataccgactcgatttgttctccctaaactgactaaacaagcgaactggtcttta
gtctgtgatactcaatattccaaagtaaaaccaaaaccgattgtttttgattacagctta
tctcctctttctatcgctgtattctgcaacaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
