Aliivibrio fischeri ES114: VF_A1042
Help
Entry
VF_A1042 CDS
T00236
Symbol
ybbP
Name
(GenBank) predicted inner membrane protein
KO
K02004
putative ABC transport system permease protein
Organism
vfi
Aliivibrio fischeri ES114
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vfi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vfi02000
]
VF_A1042 (ybbP)
Transporters [BR:
vfi02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
ABC-2 type and other transporters
Putative ABC transporter
VF_A1042 (ybbP)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAW88112
UniProt:
Q5DYN4
LinkDB
All DBs
Position
II:complement(1175872..1178331)
Genome browser
AA seq
819 aa
AA seq
DB search
MNEKSLTSTSLGNHLPSGNRMILRWSWREIWQGQLWPVMAALTLIVACVVALSALAIRVE
KVMTDQGRSMMAADLVFRSANPTPESILQRAAEQNLVTSSQVRFQTMAFSDTGMQLVSVK
SVESNYPLRGELLLHGENNEVYTQVNQGEVWVADRLLSLLELHIGDVIAIGDAELPISGV
IESEPELAFNPFRTMPSVFIHQSDLDKTGAIQLGSRVQYRTLFKGDDNGVSLLQSEYELQ
AGESWISEETQGRTADLMQKAKQYLSLTILMVILMASVTLVLTCQHYATSRANTVAMLKS
MGASKAWLKRWLFNQVGLMFITGVIAGSLIGLGLELLLRIPLADILPEELPSYGWQPFLF
GSIVALFIGLPALGIPLLRLLETPAISVLQSQISHSSKKGLWLILVPTAAFLLMYGSNSL
VWMVSIGLVVLFILLAGVSYGLVHFLGRFKWGAAMTLALSRIKRSPKNSMMQLAALSGSL
MLVAVIWLVRTDLLGDWQQTLPPDAPNVFAMNIAPYEQQDYLQALDNEKLDRSEGYPIVR
GRLTEINGESTKEKMKGEGQGSDALRREINFTWRNTLPVHNQVTAGAWTSENGVSVEQDV
ANDLDITIGDTLSFSVNSQPFTAVVNSIRVVDWQSMKPNFYFIFTPDVIADLPATWLVSF
KVNDDENTLLNQLARDYPTVSLLDFRTMGGKIQAMLAQITWSLTVLAGLGVVSGILLIFT
LLRLSLYQRQREITLYRTLGASRQRISNTLWSEYGVMALAAGFVAVMGAETIVFSLVKWG
FKLEPTLHISMWLVLPLIAMMIVFMSLVSVINQLLKPLK
NT seq
2460 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgagaaatcattaacctcaacttctttaggaaatcatctaccttctggaaaccgg
atgatattacgctggagttggcgtgagatttggcagggacaattatggcctgtaatggcg
gcattaaccttaattgtggcctgtgttgttgcgttatctgctttagctattcgggttgaa
aaagtcatgacggatcaaggtcgctctatgatggcggcggatttggttttccgctcagca
aatcctacccctgaatctattttacagcgtgctgctgagcaaaacttagttacttcttcc
caagttcgttttcaaaccatggcatttagtgatactggaatgcaattggtgagcgttaaa
tctgttgagagcaattacccacttcgtggtgagttattattgcatggcgaaaacaatgaa
gtatatacgcaggttaatcaaggagaggtatgggttgcggatcgccttttatctcttctg
gagttacatattggtgatgtgattgccattggtgatgctgagttaccgatctctggtgtg
attgaatctgagcctgagcttgcgtttaatccatttcgcaccatgccaagtgtgtttatt
catcaatctgatttagataaaacaggtgctattcaactgggcagccgagtgcaatatcga
acgttatttaaaggggatgataatggagtctcattgcttcaaagtgagtatgaattgcaa
gctggagaaagttggataagtgaagaaactcaaggtcgaactgcagatttaatgcagaaa
gcgaagcaatacttgtcattgacgattttgatggtgatcttaatggcttcggtcacttta
gtattaacttgtcagcactatgcaaccagtcgtgcgaataccgttgcgatgctaaagagt
atgggtgcaagcaaagcgtggcttaagcgctggttattcaatcaagtgggtttgatgttt
attacaggggtgattgcaggttcgttaatcgggttagggcttgaattattattgcgtata
cctcttgccgatattctgcctgaagagttacccagctatggttggcaaccttttctattt
ggttctatcgttgcgttattcattgggctaccagcacttggtattccactattacgctta
ttagagacgcctgcgatttctgttctccagtctcaaataagtcattcgtctaaaaaaggg
ttatggctaattttggttcctacagcggcatttttgctgatgtacggcagtaacagtcta
gtttggatggtttcgattggattggttgttttatttattctgcttgctggagtgagttat
ggcttagtgcattttttaggacgttttaaatggggagccgcgatgacattagcattgagt
cgaattaagcgttccccaaaaaatagcatgatgcaattggctgcactgtctggctcttta
atgttagtggctgtgatttggctagtgagaaccgatttattaggagattggcagcaaacc
ttaccaccagatgctcccaatgtatttgcgatgaatatagcgccttatgagcaacaagat
tacctgcaagcattggataatgaaaaattggatcgctcagaagggtatccgattgttcgt
ggtcgcttaacggaaattaatggtgaaagcaccaaagaaaaaatgaaaggtgaagggcaa
ggctcagatgcgctgcgccgtgaaattaattttacatggcgtaatactttgcctgttcat
aatcaggtgactgcaggggcgtggacgagtgaaaatggggtgtctgttgagcaagatgtt
gcgaacgatttagatattactattggtgatacattgagtttttctgttaatagtcagccc
tttaccgctgtagttaactcgattcgtgttgttgattggcaaagcatgaaaccgaatttt
tattttatcttcacaccagatgtgattgcggatttacctgcaacgtggttagtgagtttt
aaagttaacgatgatgagaacacattattgaatcaattggctcgtgattacccaacggtt
agcttattggactttagaaccatgggtggaaagatccaagccatgctagctcaaattacg
tggtcattaaccgtattagccggattaggcgtagtgagtggtattttattgatattcacg
ttacttcgtttgagtttgtatcaacgtcagcgtgaaatcactctttatcgtactcttggg
gctagccgtcagcgcatcagtaatacattgtggagtgaatacggtgtaatggcattggct
gcgggatttgtggcggtgatgggagctgagactattgtattcagcttagtgaaatggggc
tttaaattagaaccgacacttcatatcagtatgtggcttgtattgcctttaatagcaatg
atgattgtctttatgagtttagttagtgtgattaatcagctattaaagccgttaaagtag
DBGET
integrated database retrieval system