Aliivibrio fischeri MJ11: VFMJ11_1138
Help
Entry
VFMJ11_1138 CDS
T00754
Name
(GenBank) TrkA domain integral membrane protein
KO
K07085
putative transport protein
Organism
vfm
Aliivibrio fischeri MJ11
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vfm00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99977 Transport
VFMJ11_1138
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Asp-Al_Ex
TrkA_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACH67143
UniProt:
B5FDE4
LinkDB
All DBs
Position
I:1202052..1203929
Genome browser
AA seq
625 aa
AA seq
DB search
MNIGQIGRPFTWVRSKGWVQLFTLLCVTFFSHLALAESLENQATQDASSVFGFLFSYIAQ
NPFVFLFLSIAIGYPLGKVTIKGVNLGSTAGTLVVGVAIALPAFSIYGLHINAPGLVSDI
FLMMFMYAIGMKVGPQFFSGLARGGLDFVVIGLIVVFSNFLIVFFGSKLLDLAPGYAAGI
ISGSYTVTAVMGVAQSAINSGAVKAPAGMTLDQISANIAAGYAISYILSSVFIILLIKYL
PAMFGIDPVKAGKDAEAEFGAGGDTEALPSTNGFSNLGVLPLDIRAYRVDHQELVGQDVE
SLFHRYPHAAILKVVRGEDVYEASDNPILQLGDIIGIRGDYHVLIEGGESSVGIEVDEPR
ARNVDIEVADIHLGKSEYTGKTIEDISKEVGFGIYMKALFRQGHQLPILPQTIVEVGDVI
RVAGSDWCVKQAGKKLNSNPIVESTLTETFYLALSLLIGYVCGHFSVTLGGIPFALGTSA
GCMLTGIIFSFLRTRNPAFGGPMSEGARSFLQDIGLSLFVAVLAATVGPKILASFQGIVV
IKIAVLGLVAALLPPLLAWIYGLYVRKMNPAILAGACAGGRNSTPAMKGAQDECQSDMPA
VGYPVPYALTSMIVLVLGYLAMVLY
NT seq
1878 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatcggtcaaataggtcgtccatttacttgggttcgctccaaaggttgggttcag
ttatttactttactatgtgttactttcttcagtcatttggctttggctgaatcattagaa
aatcaagcaactcaagatgcatctagtgtctttggttttctcttttcttatattgcacaa
aatccgtttgtgtttcttttcttaagcatcgccattggttatccattaggcaaagtaaca
ataaaaggggttaatttaggctcaacagcaggcaccttagtggttggtgtggctattgct
ttacctgctttttctatttatggattacatattaatgcaccgggattagtctcggacata
ttcttgatgatgtttatgtatgcaattggtatgaaagttgggccgcaatttttctctggt
ttagctcgaggcggtttagactttgtagttattgggttaattgttgtttttagtaacttt
cttattgtgttctttggttctaaattattggatttagcaccgggttatgcggctgggata
atttcaggaagttacacagtaactgctgttatgggcgttgctcaatctgcgattaattca
ggagccgttaaagctcctgcaggtatgacacttgatcagatcagtgccaatatcgctgcg
ggctatgctatcagttacattttatcaagtgtattcatcatcttacttattaagtatctg
cctgctatgtttggaattgatccagtaaaagcaggtaaagatgccgaggctgaatttggt
gctggtggggacacagaggcgttaccaagtaccaatggtttctcgaatttaggtgtgctt
cctttggatattcgtgcctatcgtgttgatcaccaagagttggttggtcaagatgttgaa
tcattatttcatcgctatcctcatgctgcgattcttaaagttgtgcgcggtgaggatgtt
tatgaagcatcagataatccaatacttcaacttggcgatattattggtattcgcggtgat
taccatgtcttgattgaaggaggagaatcctctgtaggtattgaggtagatgaaccaaga
gcacgtaatgttgatattgaagttgcggatattcacctaggtaaatcggaatatacaggt
aaaacgatagaagatatcagtaaagaagttggctttggtatttatatgaaagccttgttt
agacaagggcatcaacttcctattttacctcaaaccattgtcgaagtaggcgatgttata
cgtgtggcagggtctgattggtgcgttaagcaagccggtaagaaactgaacagtaatcca
attgtagagagtacgctaacggagactttttacttggcactttctttattgattggttac
gtttgtggtcactttagcgttacgttaggggggatcccatttgctttaggcacatctgct
ggttgtatgttgacagggataatattctcgtttttacgtactcgtaatcctgcttttggt
ggacctatgagtgaaggggctcgtagcttcttacaagatatcggtttgagtctatttgtt
gcggtattagcagcaactgtgggccctaaaatattagcgtctttccaaggcattgttgtg
attaaaattgcagtgttagggttggttgctgctttacttcctccattattggcgtggatt
tatggtttatacgtcagaaaaatgaaccctgcaattctggctggtgcttgtgctggtgga
cgtaatagcacacctgcaatgaaaggcgctcaagatgaatgccaaagcgatatgcctgca
gtaggctaccctgttccttatgcattaacatcaatgattgttcttgtattaggttatctg
gcgatggtgctgtattaa
DBGET
integrated database retrieval system