Aliivibrio fischeri MJ11: VFMJ11_1472
Help
Entry
VFMJ11_1472 CDS
T00754
Name
(GenBank) carbohydrate binding domain protein
Organism
vfm
Aliivibrio fischeri MJ11
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_19
CBM_5_12
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACH66704
UniProt:
B5FEC6
LinkDB
All DBs
Position
I:1553358..1555049
Genome browser
AA seq
563 aa
AA seq
DB search
MFKLALLPSLLACSFAANSFTMNPQPDPDNPTGYVVSKAEIKAAEDAKTLDPMYDVWAKA
LETRPNSVVEAIDAGIPTNPDNVKRVERVFPQSEWFFLTQMAAPEYTYTRFLRAIGKFPA
FCGDYTDGRDADAICKKSIVTAFAHFSQETGGHIAVDNVSDNPLGLEEWQQALVHVREMG
WSEGQEGYTTGCGQNDWQNKRWPCAAGQGYFGRGAKQLSYHFNYGAFSEVMYDGDATVLL
NNPGLVADSWLNLASAIWFFLTPQAPKPAMLHVIDRTWTPSQRETDAGIGYGFGTTINVI
NGGIECGEQNKDKGQPVNRIRYWEGLSSHYEIPVEADEKNTCWQQTPYGSLNLNGATDVL
YTNWDGNWKYYPDRPEGASFECELVGFQTAYSALVPGDYEKCVTNFYGSHANWPETRVVE
TLPTDPSEPTDPTDPTNTWDANKVYNTGDQVVVNGVTYQAKWWNQGDNPATSTTGVWEVI
SGTPTEPTPPVAVEPTPVEPTPPAPVEPTPPTEPTDPSSTWDAAATYNTGDQVTVNGITY
QAQWWTQGNNPETSGEWGVWKRV
NT seq
1692 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaaactcgctcttttaccttcattgctagcatgcagttttgcagcgaatagtttt
acaatgaaccctcaacctgaccctgataatccaacaggttatgttgtctctaaagctgaa
attaaagcagctgaagatgcgaaaacattagaccctatgtacgatgtttgggctaaagca
ttagaaacgcgtcctaatagcgttgttgaagccattgatgcgggcattcctactaaccca
gataacgtaaaacgtgttgaacgagtttttccgcaatctgaatggttcttcttaacccaa
atggcggctccagaatatacttatactcgcttcttacgtgctattggtaaattccccgcg
ttctgtggtgactataccgatggacgcgatgctgacgctatttgtaaaaaatccattgta
acggcatttgcgcatttctcacaagaaaccggtggtcacattgctgtagataacgtatca
gacaatccactaggacttgaagaatggcagcaagcacttgttcacgttcgtgaaatggga
tggtcagaaggtcaagaaggttatacaacaggctgtggtcaaaatgattggcaaaacaaa
cgttggccgtgtgcagcaggtcaaggttactttggccgcggtgctaaacagctttcttac
cactttaactacggtgctttctctgaagtcatgtatgacggcgatgcgactgtattatta
aacaatccaggtttagttgctgattcttggctaaacttagcatctgctatttggttcttc
ttaacaccgcaagcgccaaaaccagcaatgcttcacgttattgatcgcacatggacacca
tcacaacgtgaaacagatgcaggaattggttacggatttggtacgactattaacgtaatt
aatggtggtatcgaatgtggtgagcagaataaggataaaggacaacccgttaaccgtatt
cgttactgggaaggactgtcttcacattacgaaatcccagtggaagcagatgaaaagaat
acttgttggcagcaaactccttacggtagcttgaacctaaatggtgcaacggatgtactt
tacactaactgggatggtaactggaaatattacccagatcgtccagaaggtgcgtctttt
gaatgtgaattagttggcttccaaaccgcctactctgcgcttgttcctggtgattatgaa
aaatgtgtcactaacttctatggttctcatgcaaattggcctgaaactcgagttgtagaa
acactaccaacagacccatctgaaccaacggatccgacagacccaacaaatacatgggat
gcaaacaaagtttataatacaggtgatcaagttgttgttaacggcgtaacttatcaagct
aaatggtggaaccaaggtgataacccagcaacaagtacaactggtgtttgggaagtaatc
agcggtacaccaacagaaccaacacctcctgtagccgttgagccaactcctgttgaacct
acaccaccggcaccagttgaacctactccgccaacggagccaacagatccatcatcaacg
tgggatgcagctgcaacatacaacactggtgaccaagttacggttaatggtattacgtat
caagctcagtggtggactcaaggtaataacccagaaacatctggtgaatggggagtttgg
aaaagagtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
