Aliivibrio fischeri MJ11: VFMJ11_A0010
Help
Entry
VFMJ11_A0010 CDS
T00754
Name
(GenBank) Ig domain protein, group 2 domain protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
vfm
Aliivibrio fischeri MJ11
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
vfm00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
vfm02000
]
VFMJ11_A0010
Transporters [BR:
vfm02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
VFMJ11_A0010
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACH63789
UniProt:
B5ES93
LinkDB
All DBs
Position
II:9957..14321
Genome browser
AA seq
1454 aa
AA seq
DB search
MSSVIKSTSITMMKLFTLFFTVISLFGCNAEDAFSIPSKGDDNSGKVLVSIQISPVTKLN
FGRSDLQIAKGNKLPLVAIGTYSDGSNEDVTNKADWSSLEPLFVSISSVGVTKGESEGQS
GITASIGDIISNELIVLVNPAEVVSIQITPPMKNIAVGSSQQYEARATYTDGTSAVINSN
DKVEWFVSGGKKVSMAPTGVATAAETGNVEIFVMLGDVKSNVADLIVTDAVIMSIQVEPA
VQEIPKGNKQQYTAIGTLSDKTTKDITNDVVWAVIGGDGVSISERGLATGNEVGTVNIEA
SIGEIKSNKASLEVKDAVVTALNITPLNTSIAKGNTQKYEAVATYSDGKKTDITSQVSWK
SSDATIASIISGTANGVTVGQVNINASFNGINSEDAVLSVTAAEVVSLQVSPAMHSLAQG
TSHQYTATATYTDESFAVVTDSVSWLSSDSATATIVGGLATGVKVGQVTVTATLDSVVSN
EAELTVTSAALQSIQITPAIKSIAKGNTQQYEALGTYSDGKVQDISSLVSWSSNNTGFAT
ISDKGLASGVAVGSLNIEAVLGSTASNTAVLSVTAAEVVSIQVTPANASIAKGNSQKYTA
TATYTDATTENVTDSVSWFSSNTLFASITSAGLATGISEGSVDVHATLGSITSNSVELTV
TAAELESIQITPPGASIAKGNTQQYLAIGSYSDDQNVDLTDVVTWVSSAPSLVTISSGAS
GGLANGNNEGEVKITAVYQLNTSNEATLSVTAAEVESIQITPASENVVEGNTQQYLAIAT
YTDNNTADVTNSVSWTSSIPTLATINTQGLATGVSVGEVRISAVKDEIASNNATLTVVSA
AVVSIQVTPPTKSIAKGDTQQYVAVATYNNNTTKDVSDSVSWSSSNTALATISSEGLATG
VAEGGVTIKAALNGVTSNSASLTITSAVIRALQITPAVQSIPKGNQQQYTAVATYSDNST
QDVTARVSWNSSDRDIATITNVGSAQGVVEGEVTITGMLDGINSNEATLTVTAAVVRSLE
ITPELQSIPKGNQQQYAAKATYSDNSTLDVTARVSWSSSNTGIATITNTGLAQGVVEGEV
TVTAALNGVNSNNATLNITAAVIRTIEVTPDNSTIVTGNTQQYLAMGVYSDGERNDISAQ
VDWSSSSTDLVTISAQGLATGVRVGEVTIRAHHENVLSNVVNLTVSDPILESITITPPKA
SVIIGSTQQYVAMGNYSDGKSEDISNSVSWHVSSTDIATISLTGGAVGVEPGTVVVTATK
GSVTSNNADLIVVPVPEPATYRLIINPQDTIIFVGGIQKFSVELLHNNGVREKLSNDSVI
WQSSSFDKLFISEKGISNAIAVGRSNIKATLISNPTVSAQTSLRAVNEAGLMAYTIQSYD
MNLVVGEQSSLTVSGMYDMMTGGIADLTYSSTWSSSNSSIIEMEGNLMKFVGSGTATITA
RYGKYTASVQFTVR
NT seq
4365 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcagtgtaatcaaatcaacttcaataaccatgatgaagttatttactcttttcttt
actgttattagtttatttggatgtaacgctgaagatgcatttagcattccttcaaaaggt
gatgataatagcggtaaggttttagttagtattcaaatatcgcctgtaacgaaattaaac
tttggtcgtagtgatttacaaatagcaaaggggaataaattacccttggttgctataggt
acttatagcgatggttcaaatgaagatgttaccaataaggctgattggagtagcttagaa
ccattgttcgtaagtatctctagtgttggtgtgacaaaaggagagagtgaaggtcaaagt
gggatcactgcttctattggtgacatcataagtaacgaacttattgttttggttaatccg
gctgaagttgtttcgattcaaattacacctccgatgaaaaatattgctgttggtagttct
caacaatacgaagctcgagcgacttatactgatggcacatcagcagttattaatagtaac
gataaagtcgagtggtttgtttctggtggaaaaaaggtatctatggcgccgacaggggtg
gcaactgctgctgaaacagggaacgttgaaatatttgttatgttaggagatgtaaaaagt
aacgtagctgatttgatcgtgacagatgcggtgattatgtcgattcaagtcgaacctgca
gttcaagagatcccaaaaggaaataaacaacaatacacagctataggtacattaagtgat
aaaacaactaaagatattactaatgatgttgtttgggctgttatcggtggggatggtgtt
tctatctctgagcgtggcttggcaactggtaatgaagttggaacggttaatattgaagct
tctatcggtgagattaaaagtaataaagcttctttagaagtgaaggatgctgttgtaact
gccctcaatattacgcctttaaatacaagtattgctaaagggaatactcaaaaatatgaa
gcggtagcaacgtattctgatggaaagaaaaccgatatcacaagtcaagttagttggaag
agttcagatgcaactattgcgtcaatcattagtggaactgctaacggtgttactgttggg
caagtaaatattaatgccagttttaacggtattaacagtgaggatgcggttttatctgta
acagcagcggaagttgttagtcttcaagtttctcctgcgatgcatagtcttgcacaaggc
acatcacatcagtatacagcaacggcaacttatactgatgaaagttttgctgttgttact
gatagtgttagttggttaagttcggattcagcgacagcgacaattgttggtggattagca
actggagtgaaggttggccaagtaacagtgactgcaactttagattctgtagtaagtaac
gaagctgaattaacggttacttcagcggcgctacaatcgattcaaattacacctgctatt
aaaagtatcgcgaaagggaacactcagcaatatgaagcattaggtacctattctgatgga
aaagtgcaagatattagttctttagtgagttggtcgagtaataatactggttttgctact
atttcagataaagggctagcatctggcgttgctgttggcagcttgaatattgaagcagtg
cttggtagcacggcgagtaatacggctgtattaagcgtcactgctgctgaagttgtatca
attcaggttacacctgcaaacgcaagtattgctaaaggtaattcacaaaaatatacagct
acagcaacatatacggatgcgacaacggaaaatgttacagattccgtgagctggtttagt
tctaatacgttgtttgcgtcaataacttctgcaggtttagctactggtattagtgaaggt
agtgttgatgtacatgcaacattgggttctattacaagtaattctgttgaattaacggtg
actgctgctgaattagaatcgatccaaattacgccccctggtgcaagtatcgcaaaaggt
aatacgcaacaatatttagctatcggatcttatagtgatgatcagaatgtagatcttaca
gatgtggttacttgggttagttctgccccttcattagttacgatatcttctggtgcgtca
ggaggacttgctaacgggaataatgaaggggaggtgaagatcactgcggtatatcaatta
aatacgagtaatgaagcaacattatccgtcactgccgcagaggtagaatctattcaaata
acgccagcatcagaaaacgtagtggaaggaaatactcaacaatatttagctattgccact
tatacggataataatactgcagacgtgactaactcagttagttggaccagttctattcct
actttagctacgattaacacacaaggtttagctactggtgttagtgttggtgaagttcgt
atttcagccgttaaagatgagatagcaagtaataatgcaacgttaacggtagtaagtgcg
gccgttgtttctattcaagtgacacctcctactaagagtattgctaagggggatactcag
cagtatgttgccgttgctacttacaacaataatacaaccaaagatgtcagtgatagtgtt
agttggtctagttcgaatacggctcttgcaacaataagttctgaaggtttagctactggt
gttgccgaaggaggagtaacgattaaagcggccttaaatggtgtaaccagtaattctgcc
tcattaacgataacttctgctgttattcgtgctttacaaataacaccagcagtacaaagt
atccctaaaggtaatcagcagcagtatactgcagttgcgacatattcagataattcgact
caagatgttacagctcgagttagttggaactcctctgatagagatatagcaacgattaca
aatgtagggtcagcacaaggcgttgttgaaggggaggtaactataacaggaatgctagat
ggaattaatagtaatgaggcgacgttaactgtcactgcagcggttgttcgttcgttagaa
attacgcctgaattgcaaagtattcccaaaggtaaccaacagcaatatgctgcaaaagcg
acttattctgataattcaacattagatgttacagcgcgagtgagttggagttcgtctaat
actggcattgcaactattacgaatactggattagcgcagggtgttgttgaaggtgaggtg
acagtcacggctgctttaaatggggttaatagtaataatgcgacattaaacattactgct
gctgtaattagaacaattgaagtaactcctgataattcaacgattgtaacagggaatact
cagcagtatcttgctatgggggtatatagtgatggtgagagaaatgatattagtgcacaa
gttgattggtcgagttcttctactgatttagttactatcagtgcgcaaggtttagccaca
ggggtacgagttggtgaggtaacaatacgagcacaccatgaaaatgtgttgagcaatgtt
gttaatcttactgttagtgatccgattttagaatcaataacgattacaccacctaaagca
tctgtaattataggttcaactcaacaatacgtagcaatggggaattacagtgatggtaag
tcggaggatattagtaatagtgttagttggcacgtatcgtctacagatattgctaccatt
agtttaactggtggggctgtaggtgtagaacctggtactgtggtcgtaacggcaacgaaa
ggtagcgttacgagtaataatgctgatttaattgttgttcctgtacctgaaccagccact
tatagattaatcattaatcctcaagatacgattatttttgttggaggtattcagaagttt
agtgtggaacttcttcataataatggtgttagggagaaactgagtaatgatagtgttata
tggcagagctcaagtttcgataaattatttatttcggaaaaaggaatatctaatgctatt
gctgtaggaagaagtaatataaaagcgaccttgattagtaatcctactgtttctgctcag
acctcactaagggctgtaaatgaggcagggctgatggcatatacaattcaatcttatgat
atgaatttagttgttggtgagcaaagctcgctaactgttagtgggatgtatgatatgatg
actggaggaattgcggatttaacttattcatctacgtggtcaagttctaattcatctata
attgaaatggaagggaatcttatgaaattcgttggttctggtactgcaaccattacggct
cgttatggtaagtatacggcaagtgtacaatttacagtaagataa
DBGET
integrated database retrieval system
